无监督学习与生成式人工智能(MEAP)(一)(4)

简介: 无监督学习与生成式人工智能(MEAP)(一)

无监督学习与生成式人工智能(MEAP)(一)(3)https://developer.aliyun.com/article/1522505

2.7 聚类中面临的常见挑战

聚类并不是一个完全直截了当、没有任何挑战的解决方案。与世界上任何其他解决方案类似,聚类也面临着自己的一些问题。我们正在讨论我们在聚类中面临的最常见的挑战,它们包括:

  1. 有时,数据的数量非常大且有许多维度可用。在这种情况下,难以管理数据集。计算能力可能是有限的,而且像任何项目一样,时间是有限的。为了解决这个问题,我们可以:
  2. 通过使用监督学习回归方法或决策树算法等方法找到最重要的变量,尝试通过减少维度数量。
  3. 通过使用主成分分析(PCA)或奇异值分解(SVD)等方法来减少维度数量。
  4. 嘈杂的数据集:“垃圾进了,垃圾出”-这个陈词滥调对于聚类也是真实的。如果数据集混乱,会引发很多问题。问题可能包括:
  5. 缺失值,即 NULL、NA、?、空白等。
  6. 数据集中存在异常值。
  7. 数据集中存在类似#€¶§^等垃圾值。
  8. 数据中存在错误的输入。例如,如果将名称输入到收入字段中,那就是一个错误的输入。

我们将在每个章节讨论解决这些问题的步骤和过程。在本章中,我们正在研究 - 如何处理分类变量

  1. 分类变量:回想一下,在讨论中我们讨论过 k-means 无法使用分类变量的问题。我们正在解决这个问题。

要将分类变量转换为数值变量,我们可以使用独热编码。该技术在下图(Figure 2.)中显示的变量 city 有唯一值 LondonNewDelhi。我们可以观察到已创建了两个额外的列,用于填充值为 0 或 1。


但是使用独热编码并不能始终保证有效和高效的解决方案。想象一下,如果上述例子中的城市数量是 100,那么数据集中将会有 100 个额外的列,而且其中大部分值都将填充为零。因此,在这种情况下,建议对几个值进行分组。

  1. 距离度量:使用不同的距离度量可能会得到不同的结果。虽然没有“一刀切”,但大多数情况下,欧几里德距离被用于测量距离。
  2. 对聚类的解释是非常主观的。通过使用不同的属性,可以对相同的数据集进行完全不同的聚类。正如前面讨论的那样,重点应该放在解决手头的业务问题上。这是选择超参数和最终算法的关键。
  3. 耗时:由于同时处理了许多维度,有时算法的收敛需要很长时间。

但是尽管面临所有这些挑战,聚类仍然是一种广泛认可和使用的技术。我们在最后一节中讨论了聚类在现实世界中的应用案例。

这标志着本章关于聚类的讨论结束。让我们用一些总结思考来结束本章。

2.8 总结思考

无监督学习不是一项易事。但它肯定是一项非常有吸引力的工作。它不需要任何目标变量,解决方案自身识别模式,这是无监督学习算法最大的优点之一。并且这些实现已经在商业世界产生了巨大的影响。在本章中,我们研究了一类称为聚类的解决方案。

聚类是一种无监督学习解决方案,用于模式识别、探索性分析和数据点的分割。组织机构广泛使用聚类算法,并继续深入了解消费者数据。可以提供更好的价格、提供更相关的优惠、提高消费者参与度,并改善整体客户体验。毕竟,满意的消费者是任何企业的目标。不仅可以对结构化数据使用聚类,还可以对文本数据、图像、视频和音频使用聚类。由于其能够使用大量维度在多个数据集中找到模式,聚类是想要一起分析多个维度时的解决方案。

在本书的第二章中,我们介绍了基于无监督的聚类方法的概念。我们研究了不同类型的聚类算法——k 均值聚类、层次聚类和 DBSCAN 聚类,以及它们的数学概念、各自的用例以及优缺点,重点放在为相同数据集创建实际 Python 代码上。

在接下来的章节中,我们将研究像 PCA 和 SVD 这样的降维技术。将对技术的构建模块、它们的数学基础、优点和缺点、用例以及实际的 Python 实现进行讨论。

现在您可以进入问题部分了!

实用的下一步和建议阅读材料
  1. 从链接获取在线零售数据(www.kaggle.com/hellbuoy/online-retail-customer-clustering)。这个数据集包含了一个总部位于英国的零售商在 2010 年 12 月 1 日至 2011 年 12 月 9 日期间发生的所有在线交易。应用本章描述的三种算法,确定公司应该针对哪些客户以及为什么。
  2. 从链接获取 IRIS 数据集(www.kaggle.com/uciml/iris)。它包括三种鸢尾花品种,每种 50 个样本,具有一些花的特性。使用 kmeans 和 DBSCAN 并比较结果。
  3. 探索 UCI 的聚类数据集(archive.ics.uci.edu/ml/index.php
  4. 研究关于 kmeans 聚类、层次聚类和 DBSCAN 聚类的以下论文

a) Kmeans 算法:

i. www.ee.columbia.edu/~dpwe/papers/PhamDN05-kmeans.pdf

ii. www.researchgate.net/publication/271616608_A_Clustering_Method_Based_on_K-Means_Algorithm

iii. ieeexplore.ieee.org/document/1017616

b) 层次聚类

i. ieeexplore.ieee.org/document/7100308

ii. papers.nips.cc/paper/7200-hierarchical-clustering-beyond-the-worst-case.pdf

iii. papers.nips.cc/paper/8964-foundations-of-comparison-based-hierarchical-clustering.pdf

c) DBSCAN 聚类

i. arxiv.org/pdf/1810.13105.pdf

ii. citeseerx.ist.psu.edu/viewdoc/summary?doi=10.1.1.121.9220

2.9 摘要

  • 我们讨论了一种称为聚类的无监督学习技术。通过聚类,我们找出数据集中的潜在模式,并找出数据中的自然分组。
  • 我们了解到,聚类在各行业中都被用于各种目的,包括零售、电信、金融、制药等。聚类解决方案被用于客户分割和营销分割,以更好地理解客户群体,从而进一步提高对客户的定位。
  • 我们学习并理解了基于方法论的多种聚类技术。一些示例包括 k 均值聚类、层次聚类、DBSCAN、模糊聚类等。
  • 我们详细介绍了 K 均值聚类、层次聚类和 DBSCAN 聚类算法。
  • 我们学习了 k 均值(kmeans)是基于聚类的质心,而层次聚类是一种凝聚式聚类技术。DBSCAN 是一种基于密度的聚类算法。
  • 我们还详细讨论了这些聚类算法的优缺点。例如,对于 k 均值,我们必须指定聚类的数量,层次聚类非常耗时,而 DBSCAN 的输出取决于观测数据处理的顺序。
  • 我们介绍了用于测量聚类技术准确性的方法,包括 WCSS(组内平方和)、轮廓系数和 Dunn 指数。
    我们为每种技术实现了基于 Python 的解决方案。主要使用的库是 sklearn。
  • 在本章末尾,我们提供了实际案例研究来补充学习。

第三章:降维

本章内容包括

  • 维数灾难及其缺点
  • 不同的降维方法
  • 主成分分析(PCA)
  • 奇异值分解(SVD)
  • PCA 和 SVD 的 Python 解决方案
  • 降维的案例研究

“知识是事实的累积过程;智慧则在于它们的简化。”– 马丁·H·菲舍尔

我们在生活中面临复杂的情况。生活给我们提供了多种选择,我们从中选择一些可行的选项。这种筛选的决定基于每个选项的重要性、可行性、效用和预期利润。符合条件的选项随后被选中。一个完美的例子就是选择度假目的地。基于天气、旅行时间、安全、食物、预算等多种选项,我们选择了一些地方作为下一个假期的目的地。在本章中,我们正在学习同样的东西–如何在数据科学和机器学习世界中减少选项的数量。

在上一章中,我们涵盖了主要的聚类算法。我们还在那里进行了一个案例研究。在这些真实案例的数据集中,有很多变量。有时,数据中可能有超过 100 个变量或维度。但并非所有变量都重要;并非所有变量都显著。数据集中有很多维度被称为“维数灾难”。为了进行进一步的分析,我们从所有维度或变量中选择了一些。在这一章中,我们将学习降维的必要性,各种降维技术,以及各自的优缺点。我们将深入研究主成分分析(PCA)和 SVD(奇异值分解)的概念,它们的数学基础,并用 Python 实现。延续上一章的结构,我们将在最后探讨电信行业的一个真实案例研究。在后面的章节中,我们还将探索其他高级的降维技术,比如 t-SNE 和 LDA。

聚类和降维是无监督学习的主要类别。上一章我们学习了主要的聚类方法,而本章将涵盖降维。有了这两种解决方案,我们将在无监督学习领域取得很大的进展。但是还有更多的高级话题需要涵盖,这些是本书后面章节的内容。

让我们先了解一下“维数灾难”是什么意思。

3.1 技术工具包

我们将使用与上一章相同的 Python 3.6+版本。Jupyter Notebook 在本章中也将被使用。

所有数据集和代码文件都位于 GitHub 存储库中(github.com/vverdhan/UnsupervisedLearningWithPython/tree/main/Chapter3)。您需要安装以下 Python 库才能执行numpypandasmatplotlibscipysklearn等。由于您在上一章中已经使用了相同的软件包,所以无需再安装它们。CPU 足以执行,但如果遇到一些计算问题,请切换到 GPU 或 Google Colab。如果在安装这些包中遇到任何问题,请参考本书的附录。

现在,让我们开始在以下部分进一步了解“维数灾难”。

3.2 维数灾难

继续使用我们先前介绍的度假目的地示例。目的地的选择取决于许多参数 - 安全性、可用性、餐食、夜生活、天气、预算、健康等等。有太多的参数需要决定,这是一个令人困惑的想法。我们通过一个现实生活的例子来理解。

想象一下:一家零售商想要在市场上推出一款新的鞋类产品。为此,需要选择一个目标客户群体,这个客户群体将通过电子邮件、通讯等方式进行接触。业务目标是引诱这些客户购买新发布的鞋类产品。从整个客户群体中,可以基于诸如客户年龄、性别、消费能力、首选类别、平均开销、购物频率等变量选择目标客户群体。这么多变量或维度使我们在基于有效的数据分析技术进行客户筛选时受到困扰,需要同时分析过多参数,检验每个参数对客户购物概率的影响,因此这个任务变得非常繁琐和困惑。这是真实世界的数据科学项目中我们所面临的维数灾难问题。我们还可以在另一种情况下遇到维度灾难现象,即当观察值的数量小于变量的数量时。考虑一个数据集,其中观察值的数量为 X,而变量的数量超过了 X,这种情况下我们就面临维度灾难。

通过可视化是理解任何数据集的简单方法。让我们在一个向量空间图中可视化一个数据集。如果数据集中只有一个属性或特征,我们可以用一个维度表示它。如图 3.1(i)所示。例如,我们可能希望只用一个维度来捕捉一个物体的高度。如果我们有两个属性,我们需要两个维度,如图 3.1(ii)所示,在这种情况下,为了得到一个物体的面积,我们将需要长度和宽度。如果我们有三个属性,例如,为了计算需要长度、宽度和高度的体积,它需要一个三维空间,如图 3.1(iii)所示。这个需求将根据属性的数量而继续增长。

图 3.1 (i) 只需要一个维度来表示数据点,例如,表示物体的高度 (ii) 我们需要两个维度来表示一个数据点。每个数据点可以对应一个物体的长度和宽度,用于计算面积 (iii) 三个维度用于展示一个点。这里,需要长度、宽度和高度来获得物体的体积。这个过程根据数据中存在的维度数量而继续。


现在想象一下,如果我们总共有 20 个要分析的数据点。如果我们只有一个属性,我们可以将它表示为 x[1]、x[2]、x[3]、x[4]、x[5] …. x[20],因此,20 维空间足以表示这些点。在第二个例子中,我们需要两个维度,我们将需要(x[1,]y[1])、(x[2,]y[2])、(x[3,]y[3])、(x[4,]y[4])、(x[5,]y[5])…… (x[20,]y[20]),换句话说是 2020 = 400 维空间。对于三维空间,我们将表示一个点为(x[1,]y[1,]z[1])、(x[2,]y[2,]z[2])、(x[3,]y[3,]z[3])、(x[4,]y[4,]z[4])、(x[5,]y[5,]z[5])…… (x[20,]y[20,]z[20]),我们将需要 2020*20 = 800 维空间。这个过程将继续下去。

因此,我们很容易得出结论,随着维度数量的增加,所需的空间量会大幅增加。这被称为维度灾难。这个术语是由理查德·E·贝尔曼引入的,用来指代数据集中有太多变量的问题——其中一些是重要的,而很多可能不太重要。

还有另一个众所周知的理论,即休斯现象如图 3.2 所示。一般来说,在数据科学和机器学习中,我们希望有尽可能多的变量来训练我们的模型。观察到,监督学习分类器算法的性能会增加到一定的极限,随着最适数量的变量达到顶峰。但是,使用相同数量的训练数据,并增加维度数量,监督分类算法的性能会下降。换句话说,如果变量对解决方案的准确性没有贡献,最好不要将其包含在数据集中,并应将这些变量从数据集中删除。

图 3.2 Hughes 现象显示,随着维度数量的增加,机器学习模型的性能会在初期得到提升。但是随着进一步增加,模型的性能会下降。


维度数量的增加对机器学习模型的影响如下:

  • 由于模型处理了更多的变量,数学复杂度也会增加。例如,在上一章讨论的 k 均值聚类方法中,当变量数量更多时,各个点之间的距离计算将变得更加复杂。因此,整体模型会更加复杂。
  • 在较大维度空间生成的数据集相对于较少变量来说可能更加稀疏。数据集将变得更稀疏,因为有些变量将会有缺失值、NULL 等。因此,空间更为空,数据集更加稀疏,少数变量与之相关联的值更少。
  • 随着模型复杂度的增加,所需的处理时间也会增加。系统在处理如此多维度的情况下将感到压力。
  • 整体解决方案变得更加复杂和难以理解和执行。回顾第一章中我们讨论过的监督学习算法。由于维度数量较高,我们可能会在监督学习模型中面临过拟合问题。

当监督学习模型在训练数据上有很好的准确度,但在未知数据上准确度较低时,这就被称为过拟合。过拟合是一个麻烦,因为机器学习模型的目的是在未知数据上表现良好,而过拟合则违背了这一目的。

让我们将事物与一个现实世界的例子联系起来。考虑一个保险公司提供不同类型的保险政策,如人寿保险、车辆保险、健康保险、家庭保险等。该公司希望利用数据科学并执行聚类用例来增加客户群和销售的总保单数量。他们拥有客户的详细信息,如年龄、性别、职业、保单金额、历史交易、持有的保单数量、年收入、保单类型、历史违约次数等。同时,让我们假设还捕捉到是否客户是左撇子还是右撇子、穿黑鞋还是棕鞋、使用的洗发水品牌、头发颜色和最喜欢的餐厅等变量。如果我们将所有变量包括在数据集中,那么结果数据集中的变量总数将会相当高。对于 k-means 聚类算法,距离计算将变得更加复杂,处理时间将增加,整体解决方案将变得相当复杂。

还有一点必须注意,并非所有的维度或变量都是重要的。因此,从我们拥有的所有变量中筛选出重要的变量至关重要。记住,自然总是倾向于简单的解决方案!在上述讨论的情况下,像头发颜色和最喜欢的餐厅等变量很可能不会影响结果。因此,我们最好减少维度以简化复杂性并减少计算时间。同时,还必须注意,降维并不总是需要的。它取决于数据集的类型和我们希望解决的业务问题。在本章后续部分的案例研究中,我们将进一步探讨这个问题。

小测验 - 回答这些问题来检查你的理解。答案在书的最后。

  1. 维度灾难指的是数据规模很大。TRUE 或 FALSE。
  2. 在数据集中拥有大量变量将始终提高解决方案的准确性。TRUE 或 FALSE。
  3. 数据集中有大量变量会如何影响模型?

我们已经确定,拥有许多维度对我们来说是一个挑战。我们现在正在研究各种减少维度的方法。

3.3 维度减少方法

在上一节中,我们研究了拥有非常高维数据的缺点。维度较少可能会导致数据结构更简单,这将提高计算效率。同时,我们应该小心减少变量的数量。降维方法的输出应该足够完整以代表原始数据,不应导致任何信息损失。换句话说,如果原本我们有 500 个变量,我们将它降低到 120 个显著变量,那么这 120 个变量应该足够强大,能几乎捕捉到所有信息。让我们通过一个简单的例子来理解。

想象一下:我们希望预测下个月一个城市会接收到多少降雨量。该城市的降雨预测可能取决于一段时间内的温度、风速测量、压力、距离海洋的距离、海拔等。如果我们想要预测降雨,这些变量是有意义的。同时,例如城市中电影院的数量、城市是否是国家的首都或城市中红色汽车的数量可能不会影响降雨的预测。在这种情况下,如果我们不使用城市中电影院的数量来预测降雨量,那么它将不会降低系统的性能。解决方案很有可能仍然能够表现良好。因此,在这种情况下,通过放弃这样的变量不会丢失任何信息,当然,我们可以将其从数据集中删除。另一方面,移除温度或距离海洋的变量很可能会对预测产生负面影响。这是一个非常简单的例子,用于强调减少变量数量的必要性。

维度或变量数量可以通过手动和基于算法的方法的组合来减少。但在详细研究它们之前,我们应该了解一些数学术语和组件,然后再继续,下面我们将对此进行讨论。

3.3.1 数学基础

有很多数学术语是必须掌握的,以便全面了解降维方法。

我们正在尝试减少数据集的维度。数据集只是一个值矩阵——因此很多概念与矩阵操作方法、它们的几何表示以及对这些矩阵进行变换有关。数学概念在本书的附录数学基础中进行了讨论。您还需要理解特征值和特征向量。这些概念将在整本书中被重复使用,因此它们已经放在附录中供快速查阅。在继续之前,建议您先阅读这些内容。现在我们将探讨一些手动的降维方法,然后再转向基于算法的方法。

3.4 手动降维方法

为了解决维度灾难,我们希望减少数据集中的变量数量。可以通过从数据集中移除变量来实现减少。或者,一个非常简单的解决方案是合并那些可以逻辑分组或用共同的数学运算表示的变量。

例如,如下表 3.1 所示,数据可以来自零售商店,不同的客户产生了不同的交易。我们将获得每个客户一段时间内的销售额、发票数和购买的商品数量。在下表中,客户 1 产生了两张发票,总共购买了 5 件商品,并产生了 100 的销售额。

如果我们希望减少变量的数量,我们可以将三个变量合并为两个变量。在这里,我们引入了变量 ATV(平均交易价值)和 ABS(平均篮子大小),其中 ATV = 销售额/发票数,ABS = 商品数量/发票数。

因此,在第二个表中,对于客户 1,我们有 ATV 为 50,ABS 为 2.5。因此,变量的数量已经从三个减少到两个。该过程只是一个示例,展示了如何可以结合各种变量。这并不意味着我们应该用 ATV 替换销售额作为一个变量。

表 3.1 在第一张表中,我们有销售额、发票和商品数量作为变量。在第二个表中,它们被合并为创建新变量。


这个过程可以继续减少变量的数量。同样地,对于一个电信用户,我们将拥有一个月内手机通话的分钟数。我们可以将它们相加,创建一个单一的变量 - 一个月内使用的分钟数。上面的例子是非常基础的,用于起步。使用手动过程,我们可以采用另外两种常用的方法 - 手动选择和使用相关系数。

3.4.1 手动特征选择

继续上一节中讨论的降雨预测示例 - 数据科学家可能能够去掉一些变量。这将基于对手头的业务问题和相应数据集的深刻理解。然而,这是一个潜在的假设,即数据科学家能够充分理解数据集,并对业务领域有深刻理解。大部分时间,业务利益相关者将能够指导这样的方法。同样重要的是,变量是独特的,并且不存在太多的依赖性。

如下表 3.2 所示,我们可以删除一些对于预测降雨可能没有用的变量。

表 3.2 在第一个表中,我们有数据集中所有的变量。使用业务逻辑,一些可能没有太多用处的变量在第二个表中被丢弃了。但这需要谨慎处理。最好的方法是从业务利益相关者那里得到指导。


有时,特征选择方法也被称为包装器方法。在这里,机器学习模型使用变量的子集进行包装或拟合。在每次迭代中,我们将得到不同的结果集。选择生成最佳结果的集合用于最终模型。

接下来的方法是基于各种属性之间的相关性而存在的。

3.4.2 相关系数

两个变量之间的相关性简单地意味着它们彼此具有相互关系。一个变量值的变化将影响另一个变量的值,这意味着一个变量的数值相似的数据点也在另一个变量中具有相似的数值。高度相关的变量彼此提供类似的信息,因此其中一个可以被舍弃。

相关性在书的附录数学基础中有详细描述。

例如,对于零售店,一天内产生的发票数量与产生的销售额将高度相关,因此可以舍弃其中之一。另一个例子是 - 学习时间更长的学生通常比学习时间较短的学生成绩更好(大多数情况下!)。

但在放弃变量时我们应该小心,不应仅仅依赖相关性。在做出任何决定之前,应该充分了解变量的业务背景。

在从研究中删除任何变量之前,与业务利益相关者讨论是个好主意。

基于相关性的方法有时被称为过滤方法。使用相关系数,我们可以过滤并选择最重要的变量。

自测题 – 回答这些问题以检查你的理解。答案在书的末尾

  1. 如果我们觉得一个变量不需要,我们可以简单地将其舍弃。是或否。
  2. 如果两个变量相关,总是舍弃其中一个。是或否。

手动方法是更简单的解决方案,可以相当高效地执行。数据集的大小被减小,我们可以继续进行分析。但是手动方法有时是主观的,并且在很大程度上取决于手头的业务问题。许多时候,不可能使用手动方法进行降维。在这种情况下,我们有基于算法的方法,我们将在下一节中学习。

3.4.3 基于算法的降维方法

在上一节中,我们讨论了手动方法。从那里继续,我们将在本节中研究基于算法的方法。基于算法的技术是基于更数学的基础的,因此证明是更科学的方法。在现实世界的业务问题中,我们使用手动和基于算法的技术的组合。与基于算法的技术相比,手动方法执行起来更直接。此外,我们无法评论两种技术的比较,因为它们基于不同的基础。但与此同时,你必须在实施基于算法的技术时尽职尽责。

降维中使用的主要技术如下所示。我们将在本书中探讨其中大部分。

  1. 主成分分析(PCA)
  2. 奇异值分解(SVD)
  3. 线性判别分析(LDA)
  4. 广义判别分析(GDA)
  5. 非负矩阵分解(NMF)
  6. 多维缩放(MDS)
  7. 局部线性嵌入(LLE)
  8. 等距映射
  9. 自编码器
  10. t-SNE(T 分布随机邻域嵌入)

这些技术被用于一个共同的最终目标 - 将数据从高维空间转换为低维空间。一些数据转换是线性的,而一些是非线性的。

我们将在本章详细讨论主成分分析(PCA)和奇异值分解(SVD)。在本书的后续章节中,将探讨其他主要技术。也许,PCA 是我们在下一节中探讨的最常引用的降维方法。

3.5 主成分分析(PCA)

想象一下:你正在处理一个有 250 个变量的数据集。几乎不可能可视化这样一个高维空间。这 250 个变量中的一些可能彼此相关,一些可能不相关,并且有必要减少变量的数量而不丢失太多信息。主成分分析或 PCA 允许我们在数学上选择最重要的特征并留下其他特征。PCA 确实减少了维数,但也保留了变量之间最重要的关系和数据集中的重要结构。因此,变量的数量减少了,但数据集中的重要信息得到了保留。

主成分分析(PCA)是将高维数据投影到低维空间的过程。简单来说,我们将一个 n 维空间降维到一个 m 维空间(其中 n > m),同时保持原始数据集的本质和基本特征。在这个过程中,旧的变量被降维为新的变量,同时保持了原始数据集的关键信息,新创建的变量称为主成分。主成分是原始变量的线性组合。由于这种转换,第一个主成分捕获了数据集中的最大随机性或最高方差。创建的第二个主成分与第一个主成分正交。

如果两条直线彼此正交,意味着它们相互成90⁰的角度,

这个过程一直持续到第三个成分等等。正交性使我们能够保持后续主成分之间没有相关性。

PCA 利用数据集的线性变换,这样的方法有时被称为特征投影。结果数据集或投影用于进一步的分析。

让我们通过一个例子更好地理解。在下面(表 3.3)所示的例子中,我们用一些变量来表示一个家庭的总感知价值。这些变量包括面积(平方米)、卧室数、阳台数、距离机场的距离、距离火车站的距离等等——我们有 100 多个变量。

表 3.3 房价估算的基于的变量


我们可以数学上和逻辑上结合一些变量。PCA 将创建一个新变量,它是一些变量的线性组合,如下面的示例所示。它将得到原始变量的最佳线性组合,以便新变量能够捕获数据集的最大方差。方程式 3.1 仅是为了说明目的而显示的一个示例,在这个示例中我们展示了一个新变量,它是其他变量的组合。

(方程式 3.1)

new_variable = a面积 – b卧室数 + c距离 – d学校数

现在让我们通过视觉概念来理解这个概念。在矢量空间图中,我们可以如下图 3.3 所示地表示数据集。第一张图代表了原始数据,我们可以在 x-y 图表中可视化变量。如上所述,我们希望创建变量的线性组合。换句话说,我们希望创建一个数学方程,能够解释 x 和 y 之间的关系。

这种过程的输出将是一条直线,如图 3.3 中的第二张图所示。这条直线有时被称为最佳拟合线。利用这条最佳拟合线,我们可以预测给定 x 值的 y 值。这些预测实际上就是数据点在直线上的投影。

如下图 3.3 中的第三个图所示,实际值与投影之间的差异是误差。这些误差的总和被称为总投影误差。

图 3.3 (i) 数据集可以在向量空间图中表示 (ii) 直线可以称为最佳拟合线,其具有所有数据点的投影 (iii) 实际值与投影之间的差异是误差项。


如下图 3.4 所示,这条直线可以有多种选项。这些不同的直线将具有不同的误差和捕捉到的方差值。

图 3.4 数据集可以用多条直线来捕捉,但并非所有直线都能捕捉到最大的方差。给出最小误差的方程将被选定。


能够捕捉最大方差的直线将被选定。换句话说,它给出了最小的误差。它将是第一个主成分,最大扩展方向将是主轴

第二主成分将以类似的方式导出。由于我们知道第一个主轴,我们可以从总方差中减去沿着该主轴的方差以获得残差方差。换句话说,使用第一个主成分,我们将在数据集中捕捉一些方差。但数据集中仍有部分总方差尚未由第一个主成分解释。未解释的总方差部分是残差方差。使用第二主成分,我们希望尽可能多地捕捉方差。

使用相同的过程来捕捉最大方差的方向,我们将得到第二个主成分。第二主成分可以与第一个主成分呈多个角度,如图 3.5 所示。数学上已经证明,如果第二主成分与第一个主成分正交,那么我们可以使用两个主成分来捕捉最大方差。在图 3.5 中,我们可以观察到两个主成分彼此之间呈 90⁰ 角。

图 3.5 (i) 左侧的第一个图是第一个主成分。 (ii) 第二主成分可以相对于第一个主成分处于不同角度。我们必须找到第二主成分,它允许捕捉最大方差 (iii) 为了捕捉最大方差,第二主成分应与第一个主成分正交,因此组合方差被最大化。


第三、第四个主成分等依此类推。随着主成分的增多,向量空间中的表示变得难以可视化。你可以将其想象成一个带有多个轴的向量空间图。一旦所有主成分都被导出,数据集就会投影到这些轴上。这个转换后的数据集中的列是主成分。创建的主成分数量会少于原始变量的数量,并且捕获数据集中存在的最大信息。

在我们深入研究 PCA 过程之前,让我们先了解其重要特性:

  • PCA 的目标是减少结果数据集中的维数。
  • PCA 生成的主成分旨在通过最大化特征方差来减少数据集中的噪声。
  • 同时,主成分减少了数据集中的冗余。这是通过最小化特征对之间的协方差实现的。
  • 原始变量不再存在于新创建的数据集中。相反,使用这些变量创建新变量。
  • 主成分不一定会与数据集中的所有变量一一对应。它们是现有变量的新组合。因此,它们可以是一个主成分中多个不同变量的组合(如方程式 3.1 所示)。
  • 从数据集创建的新特征不共享相同的列名。
  • 原始变量可能彼此相关,但新创建的变量彼此不相关。
  • 新创建的变量数量少于原始变量的数量。我们选择主成分数量的过程已在 Python 实现部分进行了描述。毕竟,降维的整个目的就在于此。
  • 如果 PCA 用于减少训练数据集中的变量数量,则必须使用 PCA 减少测试/验证数据集。
  • PCA 不等同于降维。它可以用于许多其他用途。一般来说,仅仅将 PCA 用于降维是错误的。

我们现在将研究在实现 PCA 时采用的方法,然后我们将使用 PCA 开发一个 Python 解决方案。虽然我们在开发代码时不需要应用所有步骤,因为这些重活已经由包和库完成。下面给出的步骤已由这些包处理,但仍然必须理解这些步骤,以正确理解 PCA 的工作原理。

PCA 所遵循的步骤是:

  1. 在 PCA 中,我们首先对数据集进行标准化。 这确保我们所有的变量都具有共同的表示并且可比较。 我们有方法在 Python 中执行标准化,我们将在开发代码时学习。 要更多了解数据集的标准化,请参考附录数学基础。
  2. 在标准化数据集中获取协方差。 这使我们能够研究变量之间的关系。 我们通常创建如下所示的协方差矩阵,如下一节的 Python 示例所示。
  3. 然后我们可以计算协方差矩阵的特征向量和特征值。
  4. 然后,我们按照特征值的降序对特征值进行排序。 选择与最大特征值对应的特征向量。 因此所选的组件将能够捕获数据集中的最大方差。 还有其他方法来列出主要组件,我们将在开发 Python 代码时进行探讨。

快速测验 - 回答这些问题以检查您的理解。 书的末尾有答案

  1. PCA 将导致数据集中变量的数量相同。 真还是假。
  2. PCA 将能够在数据集中捕获 100%的信息。 真还是假。
  3. 选择 PCA 中主要组件的逻辑是什么?

因此,从本质上讲,主成分是原始变量的线性组合。 这种线性组合中的权重是满足最小二乘法误差标准的特征向量。 我们现在正在研究特征值分解,而奇异值分解将在下一节(3.6)中介绍。

3.5.1 特征值分解

我们在上一节中学习了 PCA,我们说主要组件是原始变量的线性组合。 现在我们将探讨 PCA 的特征值分解。

在 PCA 的上下文中,特征向量将表示矢量的方向,特征值将是沿着该特征向量捕获的方差。 下面的图 3.6 可以说明,我们正在将原始的 nxn 矩阵分解为组件。

图 3.6 使用特征值分解,原始矩阵可以分解为特征向量矩阵,特征值矩阵和特征向量矩阵的逆。 我们使用这种方法实现 PCA。


从数学上讲,我们可以通过方程式 3.2 来表示关系。

(方程式 3.2)

Av = λv

其中 A 是方阵,v 是特征向量,λ是特征值。 在这里,重要的是要注意特征向量矩阵是正交矩阵,其列是特征向量。 特征值矩阵是对角线矩阵,其特征值是对角线元素。 最后一个组件是特征向量矩阵的逆。 一旦我们有了特征值和特征向量,我们就可以选择显著的特征向量来获取主成分。

我们在本书中将 PCA 和 SVD 作为两种单独的方法进行介绍。这两种方法都用于将高维数据降维到较少的维度,并在此过程中保留数据集中的最大信息量。两者的区别在于 - SVD 存在于任何类型的矩阵(矩形或方形),而特征值分解仅适用于方形矩阵。等我们在本章后面介绍 SVD 时,你会更好地理解它。

我们现在将使用特征值分解创建一个 Python 解决方案。

3.5.2 使用 PCA 的 Python 解决方案

我们已经学习了 PCA 的概念和使用特征值分解的过程。现在是时候进入 Python 并在数据集上开发一个 PCA 解决方案了。我们将向你展示如何在数据集上创建特征向量和特征值。为了实现 PCA 算法,我们将使用sklearn库。库和包提供了一种更快的实现算法的解决方案。

我们将使用鸢尾花数据集来解决这个问题。这是用于机器学习问题的最受欢迎的数据集之一。该数据集包含三种鸢尾花的数据,每种鸢尾花有 50 个样本,并且具有每朵花的特性 - 如花瓣长度,萼片长度等。问题的目标是使用花的特性来预测物种。因此,独立变量是花的特性,而变量“物种”是目标变量。数据集和代码已经提交到 GitHub 仓库。在这里,我们使用内置的 PCA 函数来减少实现 PCA 所需的工作量。

步骤 1: 首先加载所有必要的库。我们将使用 numpy、pandas、seaborn、matplotlib 和 sklearn。请注意,我们从 sklearn 中导入 PCA。

这些是最标准的库。你会发现几乎所有的机器学习解决方案都会在解决方案笔记本中导入这些库。

import numpy as np
import pandas as pd
import seaborn as sns
import matplotlib.pyplot as plt
from sklearn.decomposition import PCA
from sklearn.preprocessing import StandardScaler

步骤 2: 现在加载数据集。它是一个.csv 文件。

iris_df = pd.read_csv('IRIS.csv')

步骤 3: 现在我们将对数据集进行基本检查 - 查看前五行,数据的形状,变量的分布等。我们在这里不进行详尽的探索性数据分析,因为这些步骤在第二章中已经覆盖了。数据集有 150 行和 6 列。

iris_df.head()


iris_df.describe()


iris_df.shape

步骤 4: 这里我们需要将数据集分成自变量和因变量。X_variables 代表自变量,它们位于数据集的前 4 列,而 y_variable 是因变量,在这种情况下是物种,是数据集中的最后一列。回想一下,我们希望使用其他属性来预测花的物种。因此,我们将目标变量物种和其他自变量分开。

X_variables = iris_df.iloc[:,1:5]
X_variables
y_variable = iris_df.iloc[:,5]

步骤 5: 现在我们正在对数据集进行标准化。StandardScalar() 内置方法可以很容易地完成这项工作。

StandardScalar 方法为我们对数据集进行了归一化处理。它从变量中减去均值,然后除以标准差。有关归一化的更多细节,请参阅附录数学基础知识。

我们调用该方法,然后在我们的数据集上使用它来获得转换后的数据集。由于我们正在处理自变量,所以这里使用了 X_variables。首先我们调用了 StandardScalar()方法。然后使用 fit_transform 方法。fit_transform 方法首先将转换器拟合到 X 和 Y,然后返回 X 的转换版本。

sc = StandardScaler()
transformed_df = sc.fit_transform(X_variables)

第 6 步: 现在我们将计算协方差矩阵,并将其打印出来,输出如下所示。使用 numpy 很容易得到协方差矩阵。

covariance_matrix = np.cov(transformed_df.T)
covariance_matrix


第 7 步: 现在,在这一步中正在计算特征值。在 numpy 库中,我们有内置功能来计算特征值。然后我们按降序对特征值进行排序。为了筛选主成分,我们可以选择大于 1 的特征值。这个标准被称为Kaiser 准则。我们也在探索其他方法。

特征值代表一个成分作为数据摘要的优劣程度。如果特征值为 1,意味着该成分包含与单个变量相同数量的信息。因此我们选择大于 1 的特征值。

在此代码中,我们首先获得eigen_valueseigen_vectors。然后按降序排列它们。

eigen_values, eigen_vectors = np.linalg.eig(covariance_matrix)
eigen_pairs = [(np.abs(eigen_values[i]), eigen_vectors[:,i]) for i in range(len(eigen_values))]
print('Eigenvalues arranged in descending order:')
for i in eigen_pairs:
    print(i[0])


第 8 步: 现在,我们将从sklearn库中调用 PCA 方法。该方法用于在这里拟合数据。需要注意的是,我们尚未确定在这个问题中希望使用多少个主成分。

pca = PCA()
pca = pca.fit(transformed_df)

第 9 步: 主成分现在已经被确定。让我们来看看它们解释的方差。我们可以观察到第一个成分解释了 72.77%的变化,第二个解释了 23.03%的变化,依此类推。

explained_variance = pca.explained_variance_ratio_
explained_variance


第 10 步: 现在我们正在绘制一个条形图来展现这些成分以获得更好的可视化效果。

dataframe = pd.DataFrame({'var':pca.explained_variance_ratio_,
             'PC':['PC1','PC2','PC3','PC4']})
sns.barplot(x='PC',y="var", 
           data=dataframe, color="b");


第 11 步: 我们绘制一个屏风图来可视化主成分解释的累积方差。

plt.plot(np.cumsum(pca.explained_variance_ratio_))
plt.xlabel('number of components')
plt.ylabel('cumulative explained variance')
plt.show()


第 12 步: 在这个案例研究中,如果我们选择前两个主成分作为最终解决方案,因为这两个成分捕获了数据集中 95.08%的总方差。

pca_2 = PCA(n_components =2 )
pca_2 = pca_2.fit(transformed_df)
pca_2d = pca_2.transform(X_variables)

第 13 步: 现在,我们将根据两个主成分来绘制数据集。对于此操作,有一个要求,即物种必须被映射回物种变量的实际值,即山鸢尾、变色鸢尾和维吉尼亚鸢尾。在这里,0 对应山鸢尾,1 对应变色鸢尾,2 对应维吉尼亚鸢尾。在下面的代码中,首先使用上述映射替换了物种变量的值。

iris_df['Species'] = iris_df['Species'].replace({'Iris-setosa':0, 'Iris-versicolor':1, 'Iris-virginica':2})

第 14 步: 现在我们将对两个主成分绘制结果。这个图表显示了刚刚创建的数据集被减少到两个主成分。这些主成分能够捕捉 95.08%的数据集方差。图中,第一主成分代表图表的 x 轴,而第二主成分代表图表的 y 轴。颜色代表了不同类别的物种。

plt.figure(figsize=(8,6))
plt.scatter(pca_2d[:,0], pca_2d[:,1],c=iris_df['Species'])
plt.show()


以上解决方案将成分数量从四减少到 2,并且仍能保留大部分信息。在这里,我们已经检查了三种选择主成分的方法 - 基于凯撒标准、捕获的方差以及剪切图。

让我们快速分析一下使用 PCA 我们所取得的成果。图 3.7 展示了同一数据集的两种表示形式。左边是 X 变量的原始数据集。它有四个变量和 150 行。右边是 PCA 的输出。它有 150 行,但只有两个变量。回顾一下,我们已经将维度从四减少到了两。因此观测数量仍然是 150,而变量的数量已经从四个减少到两个。

图 3.7 左侧的图展示了原始数据集,它有 150 行和 4 个变量。在实施 PCA 后,变量的数量已被减少到了两个。行数仍然是 150,这由 pca_2d 的长度表明。


一旦我们减少了成分的数量,我们可以继续实施监督学习或无监督学习的解决方案。我们可以将以上解决方案应用于其他真实世界问题中,这些问题中我们的目标是减少维度。您将在案例研究部分进一步探讨这个问题。

通过这一部分,我们已经学习了 PCA。Github 仓库中包含了一个带有变量和相应图表的非常有趣的 PCA 分解。接下来我们将在下一节探讨奇异值分解(SVD)。

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