R语言APRIORI关联规则、K-MEANS均值聚类分析中药专利复方治疗用药规律网络可视化

简介: R语言APRIORI关联规则、K-MEANS均值聚类分析中药专利复方治疗用药规律网络可视化

全文链接:http://tecdat.cn/?p=30605


应用关联规则、聚类方法等数据挖掘技术分析治疗的中药专利复方组方配伍规律点击文末“阅读原文”获取完整代码数据


方法检索治疗中药专利复方,排除外用中药及中西药物合用的复方。最近我们被要求撰写关于用药规律的研究报告,包括一些图形和统计输出。对入选的中药专利复方进行术语规范化等处理,抽取信息、建立表,应用数据分析软件R对数据进行关联规则分析,应用网络分析软件进行聚类分析。


查看数据


转换成二值矩阵数据


colnames(data) <- paste0("X",1:ncol(data))
database <- NULL
for(i in 1:nrow(data)) {
  tmp <- integer(length(total_types))

建立apriori


plot(all_rules, method = "graph")

点击标题查阅往期内容


R语言用关联规则和聚类模型挖掘处方数据探索药物配伍中的规律


01

02

03

04


中药专利复方中药对的关联规则分析


药对是方剂配伍的基本形式,它反映了中药之间相辅相成、相反相成、同类相从等配伍关系。药对中的中药在组方配伍时具有在处方中同时出现的特点,因此在关联规则分析中,分析置信度较大且双向关联的规则即可得到药对。

根据置信度和支持度筛选强关联规则

K-means均值网络聚类分析


抑郁症中药专利复方中药物之间形成了一个复杂的配伍关系网络,关联规则分析可以用来发现其中的药对及强关联规则,但随着支持度和置信度阈值参数的降低,关联规则大量涌现,使得其中的配伍规律变得难以分析,应用网络聚类方法可以有效地发现其中的配伍规律。

#聚类类别号
kmod$cluster

查看每个类别中的强关联规则


聚类1

聚类2

配伍关系网络的聚类分析结果显示了抑郁症治疗中常用的中药“社团”,反映了复方中一些配伍关系相对密切、固定的中药联合,临床运用可以提高疗效。

相关文章
|
机器学习/深度学习 数据可视化 计算机视觉
目标检测笔记(五):详细介绍并实现可视化深度学习中每层特征层的网络训练情况
这篇文章详细介绍了如何通过可视化深度学习中每层特征层来理解网络的内部运作,并使用ResNet系列网络作为例子,展示了如何在训练过程中加入代码来绘制和保存特征图。
505 1
目标检测笔记(五):详细介绍并实现可视化深度学习中每层特征层的网络训练情况
|
数据可视化 数据挖掘 图形学
R语言基础可视化:使用ggplot2构建精美图形的探索
【8月更文挑战第29天】 `ggplot2`是R语言中一个非常强大的图形构建工具,它基于图形语法提供了一种灵活且直观的方式来创建各种统计图形。通过掌握`ggplot2`的基本用法和美化技巧,你可以轻松地将复杂的数据转化为直观易懂的图形,从而更好地理解和展示你的数据分析结果。希望本文能够为你探索`ggplot2`的世界提供一些帮助和启发。
|
数据可视化 数据挖掘 数据处理
R语言高级可视化技巧:使用Plotly与Shiny制作互动图表
【8月更文挑战第30天】通过使用`plotly`和`shiny`,我们可以轻松地创建高度互动的数据可视化图表。这不仅增强了图表的表现力,还提高了用户与数据的交互性,使得数据探索变得更加直观和高效。本文仅介绍了基本的使用方法,`plotly`和`shiny`还提供了更多高级功能和自定义选项,等待你去探索和发现。希望这篇文章能帮助你掌握使用`plotly`和`shiny`制作互动图表的技巧,并在你的数据分析和可视化工作中发挥更大的作用。
|
机器学习/深度学习 数据可视化 Windows
深度学习笔记(七):如何用Mxnet来将神经网络可视化
这篇文章介绍了如何使用Mxnet框架来实现神经网络的可视化,包括环境依赖的安装、具体的代码实现以及运行结果的展示。
265 0
|
12月前
|
机器学习/深度学习 数据可视化 PyTorch
深入解析图神经网络注意力机制:数学原理与可视化实现
本文深入解析了图神经网络(GNNs)中自注意力机制的内部运作原理,通过可视化和数学推导揭示其工作机制。文章采用“位置-转移图”概念框架,并使用NumPy实现代码示例,逐步拆解自注意力层的计算过程。文中详细展示了从节点特征矩阵、邻接矩阵到生成注意力权重的具体步骤,并通过四个类(GAL1至GAL4)模拟了整个计算流程。最终,结合实际PyTorch Geometric库中的代码,对比分析了核心逻辑,为理解GNN自注意力机制提供了清晰的学习路径。
769 7
深入解析图神经网络注意力机制:数学原理与可视化实现
|
数据可视化
R语言可视化设计原则:打造吸引力十足的数据可视化
【8月更文挑战第30天】R语言可视化设计是一个综合性的过程,需要综合运用多个设计原则来创作出吸引力十足的作品。通过明确目标、选择合适的图表类型、合理运用色彩与视觉层次、明确标注与引导视线以及引入互动性与动态效果等原则的应用,你可以显著提升你的数据可视化作品的吸引力和实用性。希望本文能为你提供一些有益的启示和帮助。
|
机器学习/深度学习 数据可视化 Linux
Seaborn可视化学习笔记(一):可视化神经网络权重分布情况
这篇文章是关于如何使用Seaborn库来可视化神经网络权重分布的教程,包括函数信息、测试代码和实际应用示例。
408 0
|
JSON 安全 网络协议
【Azure Policy】添加策略用于审计Azure 网络安全组(NSG)规则 -- 只能特定的IP地址允许3389/22端口访问
为了确保Azure虚拟机资源的安全管理,只有指定IP地址才能通过RDP/SSH远程访问。解决方案包括使用Azure Policy服务扫描所有网络安全组(NSG),检查入站规则中的3389和22端口,并验证源地址是否在允许的IP列表中。不符合条件的NSG规则将被标记为非合规。通过编写特定的Policy Rule并定义允许的IP地址参数,实现集中管控和合规性检查。
242 0
|
数据采集 机器学习/深度学习 数据可视化
R语言从数据到决策:R语言在商业分析中的实践
【9月更文挑战第1天】R语言在商业分析中的应用广泛而深入,从数据收集、预处理、分析到预测模型构建和决策支持,R语言都提供了强大的工具和功能。通过学习和掌握R语言在商业分析中的实践应用,我们可以更好地利用数据驱动企业决策,提升企业的竞争力和盈利能力。未来,随着大数据和人工智能技术的不断发展,R语言在商业分析领域的应用将更加广泛和深入,为企业带来更多的机遇和挑战。
|
12月前
|
数据采集 机器学习/深度学习 数据可视化
探索大数据分析的无限可能:R语言的应用与实践
探索大数据分析的无限可能:R语言的应用与实践
446 9

热门文章

最新文章