UCB Data100:数据科学的原理和技巧:第六章到第十章(1)

简介: UCB Data100:数据科学的原理和技巧:第六章到第十章(1)

六、正则表达式

学习成果

  • 了解 Python 字符串操作,pandasSeries方法
  • 解析和创建正则表达式,使用参考表
  • 使用词汇(闭包、元字符、组等)描述正则表达式元字符

这些内容在第 6 和第 7 讲中涵盖。

6.1 为什么处理文本?

上一堂课,我们了解了定量和定性变量类型之间的区别。后者包括字符串数据——第 6 讲的主要焦点。在本笔记中,我们将讨论操纵文本所需的工具:python字符串操作和正则表达式。

处理文本有两个主要原因。

  1. 规范化:将具有多种格式的数据转换为标准形式。
  • 通过操纵文本,我们可以将具有不匹配字符串标签的表格连接起来。
  1. 将信息提取到新特征中。
  • 例如,我们可以从文本中提取日期和时间特征。

6.2 Python 字符串方法

首先,我们将介绍一些有用的字符串操作方法。以下表格包括pythonpandas支持的一些字符串操作。python函数操作单个字符串,而它们在pandas中的等效函数是矢量化的——它们操作字符串数据的Series

操作 Python Pandas (Series)
转换 s.lower() ser.str.lower()
s.upper() ser.str.upper()
替换 + 删除 s.replace(_) ser.str.replace(_)
分割 s.split(_) ser.str.split(_)
子字符串 s[1:4] ser.str[1:4]
成员资格 '_' in s ser.str.contains(_)
长度 len(s) ser.str.len()

我们将在规范化的下一节讨论python字符串函数和pandasSeries方法之间的区别。

6.2.1 规范化

假设我们想要合并给定的表格。

代码

import pandas as pd
with open('data/county_and_state.csv') as f:
 county_and_state = pd.read_csv(f)
with open('data/county_and_population.csv') as f:
 county_and_pop = pd.read_csv(f)
display(county_and_state), display(county_and_pop);
County State
0 De Witt County IL
1 Lac qui Parle County MN
2 Lewis and Clark County MT
3 St John the Baptist Parish LS
County Population
0 De Witt County 16798
1 Lac qui Parle County 8067
2 Lewis and Clark County 55716
3 St John the Baptist Parish 43044

上次,我们使用主键外键来连接两个表格。虽然这两个键都不存在于我们的DataFrame中,但是"County"列看起来足够相似。我们能否将这些列转换为一个标准的规范形式,以便合并这两个表格?

6.2.1.1 使用python字符串操作进行规范化

以下函数使用python字符串操作将单个县名转换为规范形式。它通过消除空格、标点和不必要的文本来实现这一点。

def canonicalize_county(county_name):
 return (
 county_name
 .lower()
 .replace(' ', '')
 .replace('&', 'and')
 .replace('.', '')
 .replace('county', '')
 .replace('parish', '')
 )
canonicalize_county("St. John the Baptist")
'stjohnthebaptist'

我们将使用pandasmap函数将canonicalize_county函数应用于每个DataFrame中的每一行。这样做,我们将在每个DataFrame中创建一个名为clean_county_python的新列,其中包含规范形式。

county_and_pop['clean_county_python'] = county_and_pop['County'].map(canonicalize_county)
county_and_state['clean_county_python'] = county_and_state['County'].map(canonicalize_county)
display(county_and_state), display(county_and_pop);
County State clean_county_python
0 De Witt County IL dewitt
1 Lac qui Parle County MN lacquiparle
2 Lewis and Clark County MT lewisandclark
3 St. John the Baptist LS stjohnthebaptist
County Population clean_county_python
0 De Witt County 16798 dewitt
1 Lac qui Parle County 8067 lacquiparle
2 Lewis and Clark County 55716 lewisandclark
3 St. John the Baptist 43044 stjohnthebaptist
6.2.1.2 使用 Pandas Series 方法进行规范化

或者,我们可以使用pandasSeries方法来创建这个标准化的列。为此,我们必须在调用任何方法之前调用我们Series对象的.str属性,比如.lower.replace。注意这些方法名称与它们在内置的 Python 字符串函数中的等效函数名称相匹配。

以这种方式链接多个 Series 方法可以消除使用 map 函数的需要(因为这段代码是矢量化的)。

def canonicalize_county_series(county_series):
 return (
 county_series
 .str.lower()
 .str.replace(' ', '')
 .str.replace('&', 'and')
 .str.replace('.', '')
 .str.replace('county', '')
 .str.replace('parish', '')
 )
county_and_pop['clean_county_pandas'] = canonicalize_county_series(county_and_pop['County'])
county_and_state['clean_county_pandas'] = canonicalize_county_series(county_and_state['County'])
display(county_and_pop), display(county_and_state);
/var/folders/7t/zbwy02ts2m7cn64fvwjqb8xw0000gp/T/ipykernel_88082/2523629438.py:3: FutureWarning:
The default value of regex will change from True to False in a future version. In addition, single character regular expressions will *not* be treated as literal strings when regex=True.
/var/folders/7t/zbwy02ts2m7cn64fvwjqb8xw0000gp/T/ipykernel_88082/2523629438.py:3: FutureWarning:
The default value of regex will change from True to False in a future version. In addition, single character regular expressions will *not* be treated as literal strings when regex=True.
County Population clean_county_python clean_county_pandas
0 DeWitt 16798 dewitt dewitt
1 Lac Qui Parle 8067 lacquiparle lacquiparle
2 Lewis & Clark 55716 lewisandclark lewisandclark
3 St. John the Baptist 43044 stjohnthebaptist stjohnthebaptist
County State clean_county_python clean_county_pandas
0 De Witt County IL dewitt dewitt
1 Lac qui Parle County MN lacquiparle lacquiparle
2 Lewis and Clark County MT lewisandclark lewisandclark
3 St John the Baptist Parish LS stjohnthebaptist stjohnthebaptist

6.2.2 提取

提取探讨了从文本数据中获取有用信息的想法。这在模型构建中将特别重要,我们将在几周内学习这个问题。

假设我们想要从一个 .txt 文件中读取一些数据。

with open('data/log.txt', 'r') as f:
 log_lines = f.readlines()
log_lines
['169.237.46.168 - - [26/Jan/2014:10:47:58 -0800] "GET /stat141/Winter04/ HTTP/1.1" 200 2585 "http://anson.ucdavis.edu/courses/"\n',
 '193.205.203.3 - - [2/Feb/2005:17:23:6 -0800] "GET /stat141/Notes/dim.html HTTP/1.0" 404 302 "http://eeyore.ucdavis.edu/stat141/Notes/session.html"\n',
 '169.237.46.240 - "" [3/Feb/2006:10:18:37 -0800] "GET /stat141/homework/Solutions/hw1Sol.pdf HTTP/1.1"\n']

假设我们想要提取日、月、年、小时、分钟、秒和时区。不幸的是,这些项目不是从字符串的开头固定位置开始的,所以通过一些固定偏移量进行切片是行不通的。

相反,我们可以进行一些巧妙的思考。注意到相关信息包含在一组方括号中,进一步由 /: 分隔。我们可以聚焦在文本的这个区域,并在这些字符上分割数据。Python 的内置 .split 函数使这变得容易。

first = log_lines[0] # Only considering the first row of data
pertinent = first.split("[")[1].split(']')[0]
day, month, rest = pertinent.split('/')
year, hour, minute, rest = rest.split(':')
seconds, time_zone = rest.split(' ')
day, month, year, hour, minute, seconds, time_zone
('26', 'Jan', '2014', '10', '47', '58', '-0800')

这段代码有两个问题:

  1. Python的内置函数限制我们一次只能提取一条记录的数据,
  • 这可以使用 map 函数或 pandasSeries 方法来解决。
  1. 这段代码相当冗长。
  • 这是一个更大的问题,更难解决

在下一节中,我们将介绍正则表达式 - 一种解决问题 2 的工具。

6.3 正则表达式基础知识

**正则表达式(“RegEx”)**是一个指定搜索模式的字符序列。它们被编写用来从文本中提取特定信息。正则表达式本质上是 python 中嵌入的一种较小的编程语言,通过 re 模块提供。因此,它们有独立的语法和各种功能的方法。

正则表达式在数据科学之外的许多应用中都很有用。例如,社会安全号码(SSN)经常使用正则表达式进行验证。

r"[0-9]{3}-[0-9]{2}-[0-9]{4}" # Regular Expression Syntax
# 3 of any digit, then a dash,
# then 2 of any digit, then a dash,
# then 4 of any digit
'[0-9]{3}-[0-9]{2}-[0-9]{4}'

有很多资源可以学习和实验正则表达式。以下是一些资源:

  • 确保在左侧的类别下选择 Python

6.3.1 基础正则表达式语法

正则表达式有四种基本操作。

操作 顺序 语法示例 匹配 不匹配
| 4 AA|BAAB AABAAB 任何其他字符串
连接 3 AABAAB AABAAB 任何其他字符串
闭包*(零个或多个) 2 AB*A AAABBBBBBA ABABABA
分组()(括号) 1 A(A|B)AAB AAAABABAAB 任何其他字符串
(AB)*A AABABABABA AAABBA

注意这些元字符操作的顺序。这些元字符不是字面字符,而是操作相邻字符。() 优先级最高,然后是 *,最后是 |。这使我们能够区分非常不同的正则表达式命令,比如 AB*(AB)*。前者读作“A 然后零个或多个 B”,而后者指定“零个或多个 AB”。

6.3.1.1 示例

问题 1:给出一个匹配 moonmoooon 等的正则表达式。你的表达式应该匹配任何偶数个 o,但不包括零个(即不匹配 mn)。

答案 1moo(oo)*n

  • 在捕获组之前硬编码oo可以确保不匹配mn
  • (oo)*的捕获组确保o的数量是偶数。

问题 2:只使用基本操作,制定一个正则表达式,匹配muunmuuuunmoonmoooon等。你的表达式应该匹配任何偶数个uo,但不包括零(即不匹配mn)。

答案 2m(uu(uu)*|oo(oo)*)n

  • m开头和n结尾确保只匹配以m开头和以n结尾的字符串。
  • 注意外部捕获组围绕着|
  • 考虑正则表达式m(uu(uu)*)|(oo(oo)*)n。这错误地匹配了muuoooon
  • 每个 OR 子句是|左右两侧的所有内容。不正确的解决方案只匹配字符串的一半,并且忽略了m开头或n结尾。
  • 必须在|周围加上括号。这样,每个 OR 子句都是|组内左右两侧的所有内容。这确保了m开头n结尾都被匹配。

6.4 正则表达式扩展

以下提供了更复杂的正则表达式函数。

操作 语法示例 匹配 不匹配
任意字符.(除换行符外) .U.U.U. CUMULUS JUGULUM SUCCUBUS TUMULTUOUS
字符类[](匹配[]中的一个字符) [A-Za-z][a-z]* 单词首字母大写 驼峰命名 4illegal
重复"a"次{a} j[aeiou]{3}hn jaoehnjooohn jhnjaeiouhn
重复"a 到 b"次{a, b} j[0u]{1,2}hn johnjuohn jhnjooohn
至少一个+ jo+hn johnjoooooohn jhnjjohn
零或一次? joh?n jonjohn 任何其他字符串

字符类匹配其类中的单个字符。这些字符可以是硬编码的 - 在[aeiou]的情况下 - 或者可以指定简写以表示一系列字符。例如:

  1. [A-Z]:任何大写字母
  2. [a-z]:任何小写字母
  3. [0-9]:任何单个数字
  4. [A-Za-z]:任何大写或小写字母
  5. [A-Za-z0-9]:任何大写或小写字母或单个数字
6.4.0.1 示例

让我们分析一些复杂正则表达式的例子。

匹配 不匹配
.*SPB.*
RASPBERRY SPBOO SUBSPACE SUBSPECIES
[0-9]{3}-[0-9]{2}-[0-9]{4}
231-41-5121573-57-1821 23141512157-3571821
[a-z]+@([a-z]+\.)+(edu|com)
horse@pizza.comhorse@pizza.food.com frank_99@yahoo.comhug@cs

解释

  1. .*SPB.*只匹配包含子字符串SPB的字符串。
  • .*元字符匹配任意数量的非负字符。换行符不计入其中。
  1. 这个正则表达式匹配任意 3 个数字,然后是一个破折号,然后是任意 2 个数字,然后是一个破折号,然后是任意 4 个数字。
  • 你会认出这是熟悉的社会安全号码正则表达式。
  1. 匹配任何带有comedu域的电子邮件,其中电子邮件的所有字符都是字母。
  • 域名前必须至少有一个.。在任何元字符(在本例中是.)之前包括一个反斜杠\告诉正则表达式精确匹配该字符。

6.5 方便的正则表达式

以下是一些更方便的正则表达式。

操作 语法示例 匹配 不匹配
内置字符类 \w+ Fawef_03 this person
\d+ 231123 423 people
\s+ 空白 非空白
字符类否定[^](除了给定的字符之外的所有内容) [^a-z]+. PEPPERS398217211!↑å porchCLAmS
转义字符\(匹配下一个字符的字面意义) cow\.com cow.com cowscom
行首^ ^ark ark twoark oark dark
行尾$ ark$ darkarko ark ark two
零或更多的懒惰版本*? 5.*?5 500555 5005005

6.5.1 贪婪性

为了充分理解表中的最后一个操作,我们必须讨论贪婪性。RegEx 是贪婪的 - 它会在字符串中寻找最长可能的匹配。为了举例说明这一点,考虑模式

.*

。给定下面的句子,我们希望粗体部分会被匹配:

这是一个正则表达式

的贪婪性的

示例

。”

实际上,RegEx 处理给定模式的文本的方式如下:

  1. “寻找确切的字符串


  2. 然后,“寻找任何字符 0 次或更多次”
  3. 然后,“寻找确切的字符串”

结果将是从最左边的

到最右边的

(包括在内)的所有字符。我们可以通过使我们的模式非贪婪来修复这个问题,

.*?

。您可以在文档中阅读更多信息 这里

6.5.2 示例

让我们重新审视一下从给定的.txt文件中提取日期/时间数据的早期问题。数据看起来是这样的。

log_lines[0]
'169.237.46.168 - - [26/Jan/2014:10:47:58 -0800] "GET /stat141/Winter04/ HTTP/1.1" 200 2585 "http://anson.ucdavis.edu/courses/"\n'

问题:给出一个正则表达式,匹配括号内和包括括号在内的所有内容 - 天,月,年,小时,分钟,秒和时区。

答案$$.*$$

  • 注意匹配字面上的[]是必要的。因此,在[]之前都需要转义字符\ — 否则这些元字符将匹配字符类。
  • 我们需要匹配[]之间的特定格式。对于这个例子,.*就足够了。

备选方案$$\w+/\w+/\w+:\w+:\w+:\w+\s-\w+$$

  • 这个解决方案更安全。
  • 想象一下在[]之间的数据是垃圾 - .*仍然会匹配它。
  • 备选方案只会匹配符合正确格式的数据。

Python 和 Pandas 中的正则表达式(RegEx 组)

6.6.1 规范化

6.6.1.1 使用正则表达式进行规范化

在本笔记的早期,我们使用python字符串操作和pandasSeries方法来检查规范化的过程。然而,我们提到这种方法有一个主要缺陷:我们的代码过于冗长。有了我们对正则表达式的知识,让我们来修复这个问题。

为此,我们需要了解re模块中的一些函数。其中之一是替换函数:re.sub(pattern, rep1, text)。它的行为类似于python内置的.replace函数,并返回所有pattern的实例被rep1替换后的文本。

这里的正则表达式删除了被<>(也称为 HTML 标签)包围的文本。

按顺序,模式匹配… 1. 单个< 2. 任何不是>的字符:div,td valign…,/td,/div 3. 单个>

text中的任何子字符串,只要满足所有三个条件,都将被替换为''

import re
text = "<div><td valign='top'>Moo</td></div>"
pattern = r"<[^>]+>"
re.sub(pattern, '', text)
'Moo'

注意在正则表达式模式之前的r;这指定了正则表达式是原始字符串。原始字符串不识别转义序列(即 Python 换行元字符\n)。这使它们对于正则表达式非常有用,因为正则表达式通常包含字面上的\字符。

换句话说,不要忘记用r标记你的 RegEx。

6.6.1.2 使用pandas进行规范化

我们还可以使用pandasSeries方法进行正则表达式。这使我们能够操作整列数据,而不是单个值。代码很简单:

ser.str.replace(pattern, repl, regex=True).

考虑以下带有单列的DataFramehtml_data

代码

data = {"HTML": ["<div><td valign='top'>Moo</td></div>", \
 "<a href='http://ds100.org'>Link</a>", \
 "<b>Bold text</b>"]}
html_data = pd.DataFrame(data)
html_data
HTML
0 <div><td valign='top'>Moo</td></div>
1 <a href='http://ds100.org'>Link</a>
2 <b>Bold text</b>
pattern = r"<[^>]+>"
html_data['HTML'].str.replace(pattern, '', regex=True)
0          Moo
1         Link
2    Bold text
Name: HTML, dtype: object

6.6.2 提取

6.6.2.1 使用正则表达式进行提取

就像规范化一样,re模块提供了从字符串中提取相关文本的功能:

re.findall(pattern, text)。此函数返回与pattern匹配的所有实例的列表。

使用熟悉的社会安全号码的正则表达式:

text = "My social security number is 123-45-6789 bro, or maybe it’s 321-45-6789."
pattern = r"[0-9]{3}-[0-9]{2}-[0-9]{4}"
re.findall(pattern, text)
['123-45-6789', '321-45-6789']
6.6.2.2 使用pandas进行提取

pandas类似地在数据Series上提供提取功能:ser.str.findall(pattern)

考虑以下DataFramessn_data

代码

data = {"SSN": ["987-65-4321", "forty", \
 "123-45-6789 bro or 321-45-6789",
 "999-99-9999"]}
ssn_data = pd.DataFrame(data)
ssn_data
SSN
0 987-65-4321
1 forty
2 123-45-6789 bro or 321-45-6789
3 999-99-9999
ssn_data["SSN"].str.findall(pattern)
0                 [987-65-4321]
1                            []
2    [123-45-6789, 321-45-6789]
3                 [999-99-9999]
Name: SSN, dtype: object

该函数返回一个列表,其中包含给定字符串中模式匹配的每一行。

正如你所期望的,pandas还为其他re函数提供了类似的等效功能。Series.str.extract接受一个模式,并返回字符串中每个捕获组的第一个匹配的DataFrame。相比之下,Series.str.extractall返回每个捕获组的所有匹配的多索引DataFrame。你可以在下面的输出中看到差异:

pattern_cg = r"([0-9]{3})-([0-9]{2})-([0-9]{4})"
ssn_data["SSN"].str.extract(pattern_cg)
0 1 2
0 987 65 4321
1 NaN NaN NaN
2 123 45 6789
3 999 99 9999
ssn_data["SSN"].str.extractall(pattern_cg)
0 1 2
match
0 0 987 65 4321
2 0 123 45 6789
1 321 45 6789
3 0 999 99 9999

6.6.3 正则表达式捕获组

早些时候,我们使用括号来指定正则表达式中操作的最高顺序。然而,它们还有另一层含义;括号经常用来表示捕获组。捕获组本质上是一组较小的正则表达式,用于匹配文本数据中的多个子字符串。

让我们看一个例子。

6.6.3.1 示例 1
text = "Observations: 03:04:53 - Horse awakens. \
 03:05:14 - Horse goes back to sleep."

假设我们想要捕获时间数据(小时,分钟和秒)的所有出现作为单独的实体

pattern_1 = r"(\d\d):(\d\d):(\d\d)"
re.findall(pattern_1, text)
[('03', '04', '53'), ('03', '05', '14')]

注意给定的模式有 3 个捕获组,每个都由正则表达式(\d\d)指定。然后我们使用re.findall返回这些捕获组,每个都包含 3 个匹配的元组。

这些正则表达式捕获组可以是不同的。我们可以使用(\d{2})的速记法来提取相同的数据。

pattern_2 = r"(\d\d):(\d\d):(\d{2})"
re.findall(pattern_2, text)
[('03', '04', '53'), ('03', '05', '14')]
6.6.3.2 示例 2

有了捕获组的概念,让自己相信以下正则表达式是如何工作的。

first = log_lines[0]
first
'169.237.46.168 - - [26/Jan/2014:10:47:58 -0800] "GET /stat141/Winter04/ HTTP/1.1" 200 2585 "http://anson.ucdavis.edu/courses/"\n'
pattern = r'$$(\d+)\/(\w+)\/(\d+):(\d+):(\d+):(\d+) (.+)$$'
day, month, year, hour, minute, second, time_zone = re.findall(pattern, first)[0]
print(day, month, year, hour, minute, second, time_zone)
26 Jan 2014 10 47 58 -0800

6.7 正则表达式的局限性

今天,我们探讨了在数据整理中使用正则表达式处理文本数据的能力。然而,还有一些需要注意的事项。

编写正则表达式就像编写程序一样。

  • 需要熟悉语法。
  • 写起来可能比读起来更容易。
  • 可能很难调试。

正则表达式在某些类型的问题上表现糟糕:

  • 对于解析分层结构,比如 JSON,使用json.load()解析器,而不是 RegEx!
  • 复杂特性(例如有效的电子邮件地址)。
  • 计数(a 和 b 的实例数相同)。 (不可能)
  • 复杂属性(回文,平衡括号)。 (不可能)

最终的目标不是记住所有的正则表达式。相反,目标是:

  • 了解 RegEx 的能力。
  • 解析和创建 RegEx,使用参考表
  • 使用词汇(元字符,转义字符,组等)描述正则表达式元字符。
  • 区分()[]{}
  • 设计自己的字符类,使用,,[…-…],^等。
  • 使用pythonpandas的 RegEx 方法。

七、可视化 I

原文:Visualization I

译者:飞龙

协议:CC BY-NC-SA 4.0

学习成果

  • 使用matplotlibseaborn创建数据可视化。
  • 分析直方图,识别偏斜、潜在异常值和众数。
  • 使用boxplotviolinplot比较两个分布。

这个内容在第 7 讲中涵盖。

在我们的数据科学生命周期中,我们已经开始探索广阔的探索性数据分析世界。最近,我们学会了使用各种数据处理技术对数据进行预处理。当我们努力理解我们的数据时,我们的工具中缺少一个关键组件——即可视化和识别现有数据中的关系的能力。

接下来的两节课将向您介绍各种数据可视化的例子及其基本理论。通过这样做,我们将以绘图库的使用在真实世界的例子中激发它们的重要性。

7.1 Data 8 和 Data 100 中的可视化(到目前为止)

在学习过程中,您可能遇到了几种形式的数据可视化。您可能还记得 Data 8 中的两个例子:折线图和直方图。每个都有独特的用途。例如,折线图显示了数值数量随时间的变化,而直方图有助于理解变量的分布。

折线图

直方图

7.2 可视化的目标

可视化有许多用途。在 Data 100 中,我们特别考虑了两个领域:

  1. 为了扩大您对数据的理解
  • 探索性数据分析中的关键部分。
  • 有助于调查变量之间的关系。
  1. 向他人传达结果/结论
  • 可视化理论在这里尤为重要。

可视化最常见的应用之一是理解数据的分布。

本课程笔记将重点介绍 Data 100 中可视化主题的前半部分。这里的目标是了解如何根据不同的变量类型选择“正确”的图表,其次是如何使用代码生成这些图表。

7.3 分布概述

分布描述了变量中唯一值的频率。分布必须满足两个属性:

  1. 每个数据点必须属于一个类别。
  2. 所有类别的总频率必须相加等于 100%。换句话说,它们的总计数应等于考虑的值的数量。

无效的分布

有效的分布

左图:这不是一个有效的分布,因为个体可以与多个类别相关联,条形值表示的是分钟而不是概率。

右图:这个例子满足了分布的两个属性,因此它是一个有效的分布。

UCB Data100:数据科学的原理和技巧:第六章到第十章(2)https://developer.aliyun.com/article/1427169

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6月前
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