使用多个神经网络进行细菌分类(Matlab代码实现)

简介: 使用多个神经网络进行细菌分类(Matlab代码实现)

💥1 概述

使用多个神经网络进行细菌分类是一种常见的方法,可以通过集成多个网络的预测结果来提高分类性能。下面是一个基本的步骤:


1. 数据收集和准备:收集包含细菌图像和相应标签的数据集。这些图像可以是通过显微镜或其他图像采集设备获取的。确保数据集中包含各种不同类型的细菌,以及他们的相应标签。对图像进行预处理,如调整大小、灰度化等。


2. 构建多个神经网络:选择适当的神经网络架构用于细菌分类任务。可以使用常见的分类网络结构,如卷积神经网络(CNN),或自定义的网络结构。构建多个独立的神经网络模型。


3. 数据集划分和训练:将数据集划分为训练集、验证集和测试集。使用训练集对每个神经网络模型进行独立的训练,并使用验证集进行模型的优化和超参数调整。确保使用数据增强技术来扩充训练数据的多样性。


4. 集成分类器:使用多个神经网络模型的输出作为输入,构建一个集成分类器来综合利用这些模型的预测结果。可以使用简单的投票或加权平均等集成方法来决定最终的分类结果。


5. 模型评估和优化:使用测试集对集成分类器进行评估。计算准确率、召回率、F1分数等性能指标来评估分类器的表现。根据评估结果对模型进行调整和优化。


6. 模型推理和应用:使用经过训练和优化的集成分类器对输入的细菌图像进行预测和分类。将细菌图像输入到多个神经网络模型中,并综合考虑它们的输出结果以得出最终的分类结果。


7. 模型更新和改进:随着获取更多数据和新的细菌类型,可以继续更新和改进神经网络模型,并对集成分类器进行重新训练和优化。


通过上述步骤,你可以使用多个神经网络进行细菌分类,提高分类性能并提供更可靠的预测结果。这种方法在微生物学研究、医学诊断和环境监测中都具有潜在的应用价值。


对许多人来说,迁移学习并不是新鲜事。然而,在一个脚本中训练多个深度学习网络的情况很少见。然而,这可能需要大量的计算资源,因此你可以修改上面的代码,在一个for循环中逐个训练深度学习网络,在获得一个模型的准确率后,你可以清除网络和相关信息,然后运行下一个模型。享受探索的乐趣!


在MATLAB中有许多预先训练的网络:alexnet,googlenet,resnet50,vgg16,vgg19,resnet101,inceptionv3,inceptionresnetv2,squeezenet。


这个例子将使用各种预训练深度学习网络的迁移学习来对各种细菌进行分类。这将有助于减少手动分类的时间,并将错误分类的风险降至最低。


1) 使用 Alexnet 进行迁移学习 2) 在单个脚本中使用多个预训练神经网络进行迁移学习


📚2 运行结果


%Display image from each category
for i=1:1:numel(DataSetInfo.Label)
        subplot(ceil(numel(DataSetInfo.Label)/3),3,i);
        I = readimage(imds,sum(DataSetInfo.Count(1:i))-randi(DataSetInfo.Count(i),1));
        imshow(I)
        title(string(DataSetInfo.Label(i)));
end


idx = randperm(numel(imdsValidation.Files),4);
for j=1:numel(net)
    figure
    for i = 1:4
        subplot(2,2,i)
        I = readimage(imdsValidation,idx(i));
        imshow(I)
        label = YPred{j}(idx(i));
        title(string(label));
    end
    stringtitle = strcat(netName{j},sprintf('\n Accuracy is %0.2f %%',(accuracy(j))*100));
    sgtitle(stringtitle);
end 



🎉3 参考文献

部分理论来源于网络,如有侵权请联系删除。

[1]刘国华. 细菌域不同分类单元模式菌株间的基因组差异度研究[D].烟台大学,2022.DOI:10.27437/d.cnki.gytdu.2022.000395.


[2]刘国华. 细菌域不同分类单元模式菌株间的基因组差异度研究[D].烟台大学,2022.DOI:10.27437/d.cnki.gytdu.2022.000395.


[3]Kevin Chng (2023). Bacteria Classification Using Multiple Neural Networks


🌈4 Matlab代码实现

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