DESeq2安装避坑

简介: DESeq2安装避坑

DESeq2在R-studio上的安装非常让人自闭,具体可参考徐洲更老师的R语言安装介绍https://www.bilibili.com/video/BV19p4y1i7Zb?from=search&seid=2717757288900359126

#安装DESeq2包;
BiocManager::install("DESeq2")
#载入DESeq2包;
library(DESeq2)

输入矩阵数据(mycounts),行名为sample,列名为gene;对照组在前,实验组在后DESeq2不支持无生物学重复的数据,数据应是htseq-count的结果,如果是RSEM定量结果,要对count data取整,因为DESeq2包不支持count数有小数点,需要round取整。

相关文章
|
11月前
|
数据处理
CUT&Tag 分析教程 | 完结撒花
CUT&Tag 分析教程 | 完结撒花
CUT&Tag 分析教程 | 完结撒花
|
IDE Linux 开发工具
如何在Linux运行RStudio Server并实现Web浏览器远程访问
如何在Linux运行RStudio Server并实现Web浏览器远程访问
725 0
|
9月前
|
安全 Java 测试技术
Java 大学期末实操项目在线图书管理系统开发实例及关键技术解析实操项目
本项目基于Spring Boot 3.0与Java 17,实现在线图书管理系统,涵盖CRUD操作、RESTful API、安全认证及单元测试,助力学生掌握现代Java开发核心技能。
492 0
|
开发框架 前端开发 小程序
跨平台开发框架的选择应该考虑哪些因素?
【10月更文挑战第25天】综合考虑以上因素,能够帮助您更准确地选择适合项目需求的跨平台开发框架,从而提高项目的成功率和开发效率,为用户提供更好的应用体验。
|
自然语言处理 前端开发 数据可视化
Quarto ppt模板制作与Rstudio git连接
本文介绍了当前PPT演示中流行的Quarto文档使用情况,以及如何在Rstudio中连接Git进行版本控制。重点讲解了Quarto的ppt模板制作流程,包括安装、创建演示文稿及自定义样式等步骤,并提供了相关资源链接。
522 0
Quarto ppt模板制作与Rstudio git连接
|
机器学习/深度学习 人工智能 自然语言处理
CosyVoice 与 SenseVoice:阿里FunAudioLLM两大语音生成项目的深度评测
近年来,基于大模型的语音人工智能技术发展迅猛,为自然语音人机交互带来新的可能。通义语音大模型无疑是这一领域的佼佼者。它涵盖了语音理解与语音生成两大核心能力,可支持多种语音任务,包括多语种语音识别、语种识别、情感识别、声音事件检测以及语音合成等
5255 1
|
传感器 安全 Java
了解SENT协议及其应用
了解SENT协议及其应用
679 15
|
Python
【报错】Could not install packages due to an OSError: [Errno 2] No such file or directory: ‘/METADATA‘
【报错】Could not install packages due to an OSError: [Errno 2] No such file or directory: ‘/METADATA‘
5388 1
|
Linux Android开发 iOS开发
Typora 编辑器 讲解 包括使用方式 快捷键
Typora 编辑器 讲解 包括使用方式 快捷键
629 1

热门文章

最新文章

下一篇
开通oss服务