在MySQL中，可以通过以下方式来优化查询性能：
选择合适的索引：索引是提高查询性能的关键。在设计表结构时，应根据查询需求选择合适的字段作为索引，并尽可能避免使用过多的索引，因为过多的索引会增加数据维护的成本，而且还可能降低性能。
避免全表扫描：全表扫描是非常低效的查询方式，应尽可能避免。可以通过使用索引、分区表等方式来优化查询。
优化查询语句：查询语句的优化也可以提高查询性能。应尽可能避免使用复杂的子查询、联合查询等，而是尽可能使用简单的查询语句，如SELECT、WHERE、GROUP BY、ORDER BY等。
调整系统参数：MySQL的性能也会受到系统参数的影响。应根据硬件资源和实际情况调整MySQL的缓存、线程数、连接数等参数。
分区表：对于一些数据量比较大的表，可以使用分区表来优化查询性能。分区表可以将表按照特定的方式分成若干个分区，每个分区单独存储，从而提高查询效率。
底层原理方面，MySQL使用了一些高效的数据结构和算法来实现索引、查询、排序等操作。例如，MySQL的B+树索引可以高效地支持范围查询和排序操作；MySQL的查询优化器可以通过预估查询成本和选择最优执行计划来优化查询性能。此外，MySQL还可以使用缓存、内存表等技术来加速查询操作。总之，MySQL的优化查询性能的方式和原理比较复杂，需要结合实际情况进行分析和优化。
