原因有：
二进制日志轮换（Rotate）时，在二进制日志轮换完成之前，无法提交其他任何事务。这个会引起事务提交出现短暂的停顿/卡顿。尤其当二进制日志过大或者IO性能差的时候，这个停顿可能更长。导致commit的时间超过参数long_query_time的值。从而commit语句出现在慢查询日志。
事务过大，导致事务提交的时候，需要等候的时间过长，尤其是发生二进制日志轮换时。
对于联接的列含有索引的情况，外部表的每条记录不再需要扫描整张内部表，只需扫描内部表上的索引即可得到联接的判断结果；而一般B+树的高度为3-4层，在有索引的情况下，Simple Nested-Loops Join算法的执行速度是比较快的。优化器在一般情况下总是选择将联接列含有索引的表作为内部表，如果两张表R和P联接的列上都有索引，并且索引的高度相同，那么优化器会选择将记录数量最少的表作为内部表，这是因为内部表的扫描次数总是索引的高度，与记录的数量无关。
基于内存的数据库是最快的，因为数据库不需要对磁盘进行操作，磁盘的速度要远慢于内存的速度，因此基于磁盘的数据库一般都有缓冲池，即一块内存区域，其作用是将从磁盘上读取的指定大小数据——称为页（或块），放入缓冲池，当再次读取时，数据库首先判断该页是否在缓冲池中，如果在则直接读取缓冲池中的页，如果不在则读取磁盘上的页。对于写操作，数据库将页读入缓冲池，然后在缓冲池中对页进行修改，修改完成的页一般被异步地写入磁盘上。由此可见，缓冲池的大小决定了数据库的性能。除了同步、异步的写磁盘操作外，所有其它操作都可以在内存中完成。
