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2022年05月

• 05.20 13:23:12
  发表了文章 2022-05-20 13:23:12

  TCGA数据库的利用（二）—— 数据处理

  上一篇文章介绍的是关于TCGA数据的下载，如果不太清楚怎么下载数据的读者请参考这篇文章：TCGA数据库的利用（一）—— 数据下载！,而本篇文章主要介绍一下数据的处理过程，因为数据下载之后都是单一样本存储而且样本名称都是以非规则性超长字符命名，进行数据分析之前需要把样本名称转化为TCGA样本编号，例如这种形式的：TCGA-A8-A07I-01A-11R-A00Z-07；这里我以乳腺癌的RNA-seq数据作为样例，从数据库中下载了200个乳腺癌样本，每个样本中都含6万多个基因的表达数据。

  
• 05.20 13:19:52
  发表了文章 2022-05-20 13:19:52

  TCGA数据库的利用（一）—— 数据下载

  还有1个多月就要毕业了，而在此之前需要顺利完成自己的毕设，因为对纯生物方向一点也不感兴趣，所以课题方向选的是生信—TCGA数据的利用，虽说本科专业与生物相关，但在整个大学期间基本就是在不挂科的情况下尽可能地与生物对着干，所以大学四年过后么，就有一种虽学生物、但毫不懂生物的状态。为了能够顺利拿到毕业证，经过这段时间的“刻苦钻研”也算是多少对于这方面有点了解，因此特地写个系列来巩固一下这方面知识的掌握。 对于数据的利用的第一步就是获取数据，对于数据的下载与利用，在这里我下载TCGA数据的主要方法就是通过官网的下载工具gdc-client进行下载的；

  
• 05.20 13:16:40
  发表了文章 2022-05-20 13:16:40

  python基础—正则表达式即re模块！

  正则表达式（regular expression），就是字符匹配模式，而这个匹配规则在我们写爬虫进行数据提取，或者进行数据可视化进行数据清洗时经常用到，多样化的匹配规则在复杂的字符的情况提取数据时助我们一臂之力；在Perl、java、C/C++等编程语言都支持；python是以re模块的形式支持的；

  
• 05.20 11:49:56
  发表了文章 2022-05-20 11:49:56

  ITK 基础(二) — 图像分割 General Threshold

  上篇文章介绍了 ITK 中的二值化分割，最终得到的是 二值图像（图像中只有两种像素值） 但有时我们会遇到另外一种需求，只改变某一阈值范围的像素值，其他部分保留；这时二值化分割已经满足不了我们的基本需求了，需要寻求另外一种方法。 本篇教程介绍 ITK 中的 General Threshold ，是二值化的改进版，可以只改变某一范围内的像素值，并且其它范围内像素值得到保留。

  
• 05.20 11:48:06
  发表了文章 2022-05-20 11:48:06

  ITK基础(一) — 二值化分割

  ITK 全称为 Insight Toolkit ，是一款开源、跨平台、用于图像分析工具包，开发遵循极限编程，主流使用语言为 C++，但目前开发团队已经提供了面向 Python 的接口。 ITK 内部封装了许多优秀算法。ITK 可用于图像处理、配准、分割等领域，处理图像维度面向二维、三维或者更高维度

  
• 05.20 11:46:22
  发表了文章 2022-05-20 11:46:22

  Matplotlib绘图 | 快速定义图表样式的小技巧

  Matpltlibrc file 设置图表属性 Matplotlib 在绘图过程中，每创建一个图表，都要对该图表内的样式(例如 字体大小、颜色、分辨率、横纵坐标刻度、横纵坐标标签)设置一次，重复乏味，如下展示的是一个正弦函数曲线

  
• 05.20 11:42:57
  发表了文章 2022-05-20 11:42:57

  两张脸融合在一起长啥样？Opencv-Python 来告诉你！

  1，Image Morphing 介绍 图像融合简单来说，通过把图像设置为不同的透明度，把两张图像融合为一张图像(一般要求图像需要等尺寸)，公式如下：

  
• 05.20 11:39:07
  发表了文章 2022-05-20 11:39:07

  不用 PS 抠图，Python + OpenCV 实现自动海报场景替换！

  现存在一个问题，就下面图片中的两本书而言，怎样快速让中间边的书本与左边书本对齐(最终效果能实现两张图片重叠(最终结果为右图))，进行的图像转变可旋转、平移、缩放、形变。

  
• 05.20 11:35:58
  发表了文章 2022-05-20 11:35:58

  图像增强、锐化，利用 Python-OpenCV 来实现 4 种方法！

  图像增强目的使得模糊图片变得更加清晰、图片模糊的原因是因为像素灰度差值变化不大，图片各区域产生视觉效果似乎都是一样的， 没有较为突出的地方，看起来不清晰的感觉 解决这个问题的最直接简单办法，放大像素灰度值差值、使图像中的细节更加清晰。

  
• 05.20 11:32:38
  发表了文章 2022-05-20 11:32:38

  Numpy 进阶(二) — 对图像进行旋转、水平、垂直镜像操作！

  原理讲解 用 Python 对图片做旋转、镜像操作时，小伙伴们可能首先想到的是 PIL 、Opencv 等图像处理程序包，只需要一行代码就可以实现目标转换。 这样做的确能够实预期目标，但图像是怎么实现旋转的，这个过程对我们来说就像一个黑盒子，很陌生，为了了解图像变换机制，这篇文章借助 Numpy 数组来实现图像翻转等操作

  
• 05.20 11:30:03
  发表了文章 2022-05-20 11:30:03

  Numpy进阶(一) — 替换图片中的指定颜色！

  提出需求 做图像处理时，有时会遇到换色问题，就例如下面图片(网上找的小姐姐图片，侵删)的背景图并不喜欢，我想换成蓝色的要怎么做呢

  
• 05.20 11:27:20
  发表了文章 2022-05-20 11:27:20

  VTK 基础(一) — 常用控件介绍及实现圆锥体绘制

  最近在做医学图像的相关处理，其中用到了可视化程序包 VTK,在学习过程中，准备写一系列相关教程，一方面用于巩固自己所学，主要自己太笨图片，另一方面加强一下知识理解。 利用 VTK 进行绘制物体时，常用到的组件有下面几种，为了加深理解，VTK 把一个物体的渲染过程比喻成了一场演出（真的很形象图片）：

  
• 05.20 11:24:56
  发表了文章 2022-05-20 11:24:56

  玩转 Numpy 精选习题

  这 20 道解题步骤中虽然大部分都是一些常见函数，但用的是都是一些进阶语法，有时解一道题需要多个函数混合在一起使用，需要仔细思考它的用法
• 05.20 11:23:30
  发表了文章 2022-05-20 11:23:30

  Numpy 基本介绍

  Numpy 是 Python 中用于科学计算最基本的一个包，它除了提供了多维度数组对象以外，还提供了大象的派生类：矩阵等 在 Numpy 中提供了许多针对数组对象快速操作的历程，例如：数学基本运算、逻辑处理、尺寸转换、排序、旋转、旋转、线性代数等运算
• 05.20 11:21:04
  发表了文章 2022-05-20 11:21:04

  实现人脸识别、人脸68个特征点提取，或许这个 Python 库能帮到你

  本次将借助于 dlib 程序包实现人脸区域检测、特征点提取等功能， dlib 封装了许多优秀的机器学习算法， 可实现人脸识别、检测、识别，视频目标追逐等功能，是由由 C++开发的一个开源程序库，目前也提供了 Python 接口，可供我们直接调用。

  
• 05.20 11:17:42
  发表了文章 2022-05-20 11:17:42

  用 Python 对图片主体轮廓进行提取、颜色标记、并计算区域面积

  Python + Opencv2 实现轮廓提取，轮廓区域面积计算； 对图像处理时，会遇到这样一个场景：找到图像主体轮廓，这是其一，可能为了凸显轮廓，需要用指定的颜色进行标记；轮廓标记完可能任务还没有结束，还需对轮廓所勾勒的像素面积区域统计计算。

  
• 05.20 11:07:40
  发表了文章 2022-05-20 11:07:40

  Pandas 数据处理 | Datetime 时间模块在 Pandas 中的使用

  Datatime 作为 Python 中的时间模块类型，处理时间有关数据是非常方便的， Pandas 作为数据分析程序包同样也支持 DataTime 数据机制

  
• 05.20 11:02:18
  发表了文章 2022-05-20 11:02:18

  超酷！用 Python 教你绘制皮卡丘和哆啦A梦

  本文利用 Python 绘制两个卡通角色，并带大家熟悉一下绘图程序包 turtle 的一些用法

  
• 05.20 10:59:27
  发表了文章 2022-05-20 10:59:27

  不到100行代码 Python制作一个九宫格图片生成器，炫酷朋友圈！

  本文将介绍如何用 Python 将一张图片转化为 9 宫格，并加入 GUI 界面，封装成一个程序，先看一下程序的预览效果：

  
• 05.20 10:55:55
  发表了文章 2022-05-20 10:55:55

  快速绘制动态排序图 — Pyecharts 高级组件 Timeline 实现！

  之前写过一篇关于Python 制作 动态排序图的教程，里面利用的是 Matplotlib 中的 animation 函数，文章内容可参考动态排序图的详细制作教程，动态排序图的最终部分效果如下：

  
• 05.20 10:53:02
  发表了文章 2022-05-20 10:53:02

  在 Stackoverflow 找了许久，挑了5个比较火的 Python 问答！

  Stackoverflow 作为全球最大的开发者问答社区，里面积累了许多优质问答内容，在这里我根据 issue 的投票排行榜单，挑选了在 Python 模块中点赞比较高的 5 个问答，并整理推送给大家，如果你能坚持把文章全部内容看完，一定会有所收获！
• 05.20 10:51:21
  发表了文章 2022-05-20 10:51:21

  Python 自动化办公 — 处理 Excel 文件！

  openpyxl 介绍 openpyxl 是一个直接可用于读写 xlsx 、xlsm、xltx、xltm 文件的 Python 内置库，借助它可以利用 Python 语法对本地 xlsx 文件进行自动化批量操作 先说一下安装部分，如果小伙伴们用 Anaconda 作为 Python 环境的话，openpyxl 无需安装可直接使用；需要安装的话方法也非常简单 pip 工具一行命令即可

  
• 05.20 10:48:56
  发表了文章 2022-05-20 10:48:56

  Python自动化办公- 从 Excel 创建、数据操作到存储！

  引入一个例子从 创建 Workbook 到存储到本地磁盘，涉及到的操作命令相对会更全面一点，内容概括如下： 新建 Workbook，并保存； 新建 sheet ，修改标题、tabColor； 对 sheet 中的单元格进行赋值； 删除 sheet 中指定行、列(可多行、多列)； 插入 sheet 中指定行、列(可多行、多列)； sheet 中指定列添加筛选机制； 合并单元行； 设置单元格字体样式、填充样式、对齐样式； 应用 Excel 表格中函数命令；

  
• 05.20 10:41:16
  发表了文章 2022-05-20 10:41:16

  Amazing！黑白老照片上色，Python 两秒一张

  各位读者们，大家好啊，上个月初写了一篇关于老照片修复的教程，有读者看完不过瘾，表示想让我再安排一篇黑白照片上色教程，于是就有了这篇文章的由来

  
• 05.20 10:33:27
  发表了文章 2022-05-20 10:33:27

  教大家用 Python 绘制几棵圣诞树~

  今天分享五种用 Python 绘制圣诞树的方法，从基础到高级，效果也不断攀升分为 1 到 5 五个 Level 水平；

  
• 05.20 10:30:49
  发表了文章 2022-05-20 10:30:49

  手把手教你用 Python 制作一场炫酷烟花秀

  本篇文章，带大家用 Python 制作一个炫酷烟花秀，来迎接即将到来的元旦佳节。开始之前先看一下最终效果

  
• 05.20 10:28:05
  发表了文章 2022-05-20 10:28:05

  PaddleOCR + Django 实现一个OCR在线识别网站，一起来玩呀

  除了PaddleOCR之外，之前还介绍过一些其它好玩的开源项目，例如老照片修复 Bringing-Old-Photos-Back-to-Life 、黑白照片上色DeOldify 。因此，最近准备启动一个项目，做一个在线网站，将之前一些好玩的功能都陆续集成在这个网站中