倪桦_社区达人页

2023年06月

• 06.14 15:47:59
  发表了文章 2023-06-14 15:47:59

  R语言- data.table包加速大型数据集的加载和运算效率用法示例

  本文根据个人使用经验和博客参考，总结分享了在R语言中使用data.table包来提升大型数据集处理效率的用法示例，以供参考
• 06.14 15:26:53
  发表了文章 2023-06-14 15:26:53

  Linux- 转换 find 命令的返回值为 shell array

  本文示例了如何在Linux系统下转换 find 命令的返回值为一个 shell array
• 06.14 15:23:21
  发表了文章 2023-06-14 15:23:21

  R语言-rhdf5解析hdf5文件(.h5)展示文件组织结构和数据索引实现

  本文简单示例了在R语言如何使用 `rhdf5` 软件包解析 .h5 文件的代码过程
• 06.14 15:04:24
  发表了文章 2023-06-14 15:04:24

  Seurat::DotPlot 样式美化-Facet方法添加X轴注释标签

  本文示例了 Seurat::DotPlot 气泡图通过 GGPLOT Facet 美化展示效果的代码过程，以供参考学习
• 06.14 14:55:07
  发表了文章 2023-06-14 14:55:07

  GGPLOT -批量创建饼图

  本文分享了 数据预处理到 GGPLOT 批量创建饼图 的基本代码过程以供参考
• 06.14 14:40:01
  发表了文章 2023-06-14 14:40:01

  R语言-Chunk大型数据框与稀疏矩阵应对 as.matrix溢出异常 “problem too large”

  本文提出一种在R里面将大型数据集通过分块的方式转换出 DataFrame和 SparseMatrix的方法，能有效避免内存溢出、程序崩溃等严重问题。
• 06.14 14:18:26
  发表了文章 2023-06-14 14:18:26

  R语言- ComplexHeatmap 绘制复杂热图示例

  ComplexHeatmap是R语言中用于绘制复杂热图的一个重要包。它提供了一种灵活、高效、易于定制的方法来绘制热图，并支持多种数据类型和数据格式，支持包括多种热图类型，包括基本热图、聚类热图、分组热图、矩阵热图等。用户可以根据自己的需求选择不同的热图类型，并进行灵活的定制。在生物信息学、医学、生态学等领域得到广泛应用。 本文将通过一个复杂热图的创建示例分享 ComplexHeatmap的语法规则。
• 06.14 13:46:48
  发表了文章 2023-06-14 13:46:48

  R语言- parallel::mclapply 并行化计算任务

  R语言中的 parallel::mclapply 是一个用于在多核CPU上实现并行计算的方法。它是lapply函数的并行版本，可以在多个处理器核心上同时运行lapply函数。mclapply函数的语法与lapply函数类似，但它可以指定要使用的处理器核心数量，从而提高计算速度。
• 06.14 13:30:28
  发表了文章 2023-06-14 13:30:28

  R语言-稀疏矩阵对象格式介绍&重构方法

  在单细胞领域，基于稀疏矩阵对于处理 scRNA-seq 表达谱数据这类大型数据是非常必要的，因为构建分析对象的时候稀疏矩阵相比稠密矩阵拥有更高的数据处理效率和速度。本文重点介绍 在R语言平台关于 Matrix包中Sparse Matrix对象的格式， 与Dense Matrix的转换以及重构方法。

  
• 06.14 12:23:40
  发表了文章 2023-06-14 12:23:40

  R和Python平台下操作读写稀疏矩阵(matrix.mtx.gz格式文件)的基本方法

  将大型矩阵保存为稀疏矩阵格式特别有助于减少存储空间和提高数据处理的效率，因此本文将分享在R和Python平台下操作读写稀疏矩阵的基本方法。