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  • 数据挖掘
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  • 生物信息学
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同步推送生物信息学相关文献,及R语言针对多组学、单细胞Bulk、网络药理学等分析workflow

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2024年05月

  • 03.28 16:32:15
    发表了文章 2024-03-28 16:32:15

    文献速读|5分生信+免疫组化单细胞联合bulk转录组肿瘤预后模型

    研究摘要: 在《Cancer Immunology Immunotherapy》上发表的一篇文章,通过整合Bulk和单细胞RNA-seq数据,探讨了非小细胞肺癌(NSCLC)中癌相关纤维细胞(CAF)的作用。研究者识别出CAF的预后标志物,构建了一个基于CAF的模型,该模型在四个独立队列中区分了预后良好的和较差的患者。WGCNA分析鉴定出CAF标记基因,而CAF分数与免疫微环境和免疫治疗反应相关。高CAF分数关联较差的免疫治疗反应,FBLIM1被发现为CAF的主要来源,其高表达预测了免疫疗法的不良反应。该研究揭示了CAF在NSCLC免疫抑制和治疗策略中的重要地位。

2023年08月

2023年04月

  • 发表了文章 2024-05-15

    bayesplot|分享一个可视化贝叶斯模型的R包

  • 发表了文章 2024-05-15

    CMplot & rMVP | 全基因组曼哈顿图和QQ图轻松可视化!

  • 发表了文章 2024-05-15

    PACNet & CellNet(代码开源)|bulk数据作细胞分类,评估细胞命运性能的一大利器

  • 发表了文章 2024-05-15

    singleCellNet(代码开源)|单细胞层面对细胞分类进行评估,褒贬不一,有胜于无

  • 发表了文章 2024-05-15

    linux想做单细胞想下载Seurat,依赖包stringi要怎么安装

  • 发表了文章 2024-05-15

    GOplot|宝藏R包,拯救你的GO富集结果,杜绝平庸的条形图

  • 发表了文章 2024-05-15

    JCR一区5.2分|RNA修饰如何打开格局,一篇非肿瘤m6A带入门

  • 发表了文章 2024-05-15

    2023年纯生信一区7分中位水平|多组学鉴定直肠癌放疗药敏靶点

  • 发表了文章 2024-05-15

    自用的Linux命令高效的4个shell替代工具

  • 发表了文章 2024-05-15

    R包:disgenet2r|DisGeNET的懒癌福利,一行代码多种可视化

  • 发表了文章 2024-05-15

    用Python给大家画个小月饼祝福

  • 发表了文章 2024-05-15

    R语言处理RNA等位基因不平衡(二)

  • 发表了文章 2024-05-15

    R语言处理DNA等位基因不平衡(一)

  • 发表了文章 2024-05-15

    JCR一区7.7分|单细胞联合bulk-seq的线粒体自噬,分析方法都挺好

  • 发表了文章 2024-05-15

    JCR一区10.9分|单细胞:有一手数据的肿瘤课题组怎么冲高分文章

  • 发表了文章 2024-05-15

    一区9.3分top刊|多组学SNF数据融合的正确打开方式

  • 发表了文章 2024-05-15

    中科院一区7.9分top刊|好久不见,网络药理学(实验为主生信为辅)

  • 发表了文章 2024-05-15

    中科院二区7.7分的纯生信|还是铁死亡,还是肿瘤预后模型

  • 发表了文章 2024-05-15

    JCR一区7.3分|内质网应激+分型+药物筛选分子对接

  • 发表了文章 2024-05-15

    JCR一区5.4分|经典~非肿瘤机器学习筛选生物标志物+qPCR

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