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聚焦「 数据科学 | 深度学习 | 生命科学 | Python | 机器学习 」等前沿交叉学科,定期分享理论教程与应用实践等。
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在单细胞基因组学中,新方法“桥接整合”允许将scATAC-seq、scDNAme等技术的数据映射到基于scRNA-seq的参考数据集,借助多组学数据作为桥梁。研究展示了如何将scATAC-seq数据集映射到人类PBMC的scRNA-seq参考,使用10x Genomics的多组学数据集。Azimuth ATAC工具提供了自动化的工作流程,支持在R和网页平台上执行桥接整合。通过加载和预处理不同数据集,映射scATAC-seq数据并进行评估,证明了映射的准确性和细胞类型预测的可靠性。此方法扩展了参考映射框架,促进了不同技术间的互操作性。
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