DataWorks克隆的元数据主键冲突了，但是数据存储在哪里呢？

DataWorks的元数据存储在MaxCompute（原名ODPS）中，而不是MySQL。MaxCompute是阿里云提供的大数据计算平台，支持海量数据存储和高效计算。在DataWorks中，元数据包括表结构、任务定义、资源配置等信息，这些信息会被存储在MaxCompute的元数据存储中。

当您在DataWorks中进行元数据克隆操作时，如果遇到主键冲突的报错，通常是由于克隆的元数据与目标环境中已存在的元数据冲突引起的。您可以尝试修改克隆的元数据的主键或者目标环境中的元数据的主键，以解决冲突问题。

需要注意的是，DataWorks本身并不存储数据，而是通过集成和管理各种数据存储引擎和计算引擎，如MaxCompute、Hive、MySQL等，来实现数据的存储和计算。因此，具体的数据存储位置和引擎可能因项目配置和需求而有所不同。