pandas 分类数据处理大全(附代码)

简介: category是pandas的一种分类的定类数据类型。和文本数据.str.<methond>一样,它也有访问器功能.cat.<method>。

本文将介绍:

  • 什么是分类数据?
  • 分类数据cat的处理方法
  • 为什么要使用分类数据?
  • 分类数据cat使用时的一些坑


什么是分类数据?


分类数据表达数值具有某种属性、类型和特征,也是我们理解的定类数据。比如,人口按性别分为男和女,按年龄分为老、中、少。

在计算机语言里,我们通常会用数字来表示,比如用1代表男,0代表女,但是0和1之间并没有大小关系,pandas中用category来表示分类数据。


创建分类数据


创建数据时可以用dtpye来指定类型,比如:


s = pd.Series(['a','b','c'],dtype='category')
s
------
0    a
1    b
2    c
dtype: category
Categories (3, object): ['a', 'b', 'c']


自动创建分类数据


在某些操作情况下会自动转变为分类类型,比如用cut进行分箱操作返回的分箱就是分类类型。


pd.Series(pd.cut(range(1,10,2),3))
-----------------
0    (0.992, 3.667]
1    (0.992, 3.667]
2    (3.667, 6.333]
3      (6.333, 9.0]
4      (6.333, 9.0]
dtype: category
Categories (3, interval[float64]): [(0.992, 3.667] < (3.667, 6.333] < (6.333, 9.0]]


分类数据类型转换


直接用astype方法转换即可,如:


s = pd.Series(['a','b','c'])
s
------
0    a
1    b
2    c
dtype: object
s.astype('category')
------
0    a
1    b
2    c
dtype: category
Categories (3, object): ['a', 'b', 'c']


自定义分类数据


除此之外,还可以通过CategoricalDtype自定义分类数据,自定义的类型适用于以上全部方法。

比如下面自定义了abc3个分类,并指定了顺序。然后就可以通过dtype指定自定义的数据类型了,d不在定义类型abc中,显示为空。


from pandas.api.types import CategoricalDtype
# 自定义分类数据,有序
c= CategoricalDtype(categories=['a','b','c'],ordered=True)
pd.Series(list('abcabd'),dtype=c)
--------
0      a
1      b
2      c
3      a
4      b
5    NaN
dtype: category
Categories (3, object): ['a' < 'b' < 'c']


分类数据的处理方法


修改分类


通过.cat.rename_categories()修改分类的名称。


s = pd.Series(['a','b','c'],dtype='category')
# 指定分类为x、y、z
s.cat.categories = ['x','y','z']
0    x
1    y
2    z
dtype: category
Categories (3, object): ['x', 'y', 'z']
# 列表形式:修改分类类型为mno
s.cat.rename_categories(['m','n','o'])
# 字典形式:
s.cat.rename_categories({'x':'m','y':'n','z':'o'})
0    m
1    n
2    o
dtype: category
Categories (3, object): ['m', 'n', 'o']


追加新分类


通过.cat.add_categories()追加分类。

s.cat.add_categories(['r','t'])
0    x
1    y
2    z
dtype: category
Categories (5, object): ['x', 'y', 'z', 'r', 't']


删除分类


同理,也可以删除分类。有两种方法remove_categoriesremove_unused_categories


# 删除指定的分类r和t
s.cat.remove_categories(['r','t'])
# 自动删除未使用的分类
s.cat.remove_unused_categories()


顺序


默认情况下分类数据不自动排序,可以通过前面CategoricalDtype设置顺序,或者通过.cat.as_ordered设置。


# 有序设置
s.cat.as_ordered()
0    x
1    y
2    z
dtype: category
Categories (3, object): ['x' < 'y' < 'z']
# 无序设置
s.cat.as_unordered()
# 重新排序
s.cat.reorder_categories(['y','x','z'], ordered=True)


为什么使用category数据类型?


总结一下,使用category有以下一些好处:

  • 内存使用情况:对于重复值很多的字符串列,category可以大大减少将数据存储在内存中所需的内存量;
  • 运行性能:进行了一些优化,可以提高某些操作的执行速度
  • 算法库的适用:在某些情况下,一些算法模型需要category这种类型。比如,我们知道lightgbm相对于xgboost优化的一个点就是可以处理分类变量,而在构建模型时我们需要指定哪些列是分类变量,并将它们调整为category作为超参数传给模型。

一个简单的例子。


df_size = 100_000
df1 = pd.DataFrame(
    {
        "float_1": np.random.rand(df_size),
        "species": np.random.choice(["cat", "dog", "ape", "gorilla"], size=df_size),
    }
)
df1_cat = df1.astype({"species": "category"})


创建了两个DataFrame,其中df1包含了species并且为object类型,df1_cat复制了df1,但指定了species为category类型。

>> df1.memory_usage(deep=True)
Index          128
float_1     800000
species    6100448
dtype: int64


就内存使用而言,我们可以直接看到包含字符串的列的成本是多高。species列的字符串大约占用了6MB,如果这些字符串较长,则将会更多。

>> df1_cat.memory_usage(deep=True)
Index         128
float_1    800000
species    100416
dtype: int64


再看转换为category类别后的内存使用情况。有了相当大的改进,使用的内存减少了大约60倍。没有对比,就没有伤害。

这就是使用category的其中一个好处。


使用category的一些坑!


但爱之深,责之切呀,category有很多坑要注意,这里东哥总结出以下几点,供大家参考。


1、category列的操作


好吧,这部分应该才是大家较为关心的,因为经常会遇到一些莫名其妙的报错或者感觉哪里不对,又不知道问题出在哪里。

首先,说明一下:使用category的时候需要格外小心,因为如果姿势不对,它就很可能变回object 。而变回object的结果就是,会降低代码的性能(因为强制转换类型成本很高),并会消耗内存。

日常面对category类型的数据,我们肯定是要对其进行操作的,比如做一些转换。下面看一个例子,我们要分别对categoryobject类型进行同样的字符串大写操作,使用accessor的.str方法。

在非category字符串上:


>> %timeit df1["species"].str.upper()
25.6 ms ± 2.07 ms per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 10 loops each)


在category字符串上:

>> %timeit df1_cat["species"].str.upper()
1.85 ms ± 41.1 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1000 loops each)


结果很明显了。在这种情况下,速度提高了大约14倍(因为内部优化会让.str.upper()仅对分类的唯一类别值调用一次,然后根据结果构造一个seires,而不是对结果中的每个值都去调用一次)。

怎么理解?假设现有一个列叫animal,其类别有catdog两种,假设样本为10000个,4000个cat和6000个dog。那么如果我用对category本身处理,意味着我只分别对catdog两种类别处理一次,一共两次就解决。如果对每个值处理,那就需要样本数量10000次的处理。

尽管从时间上有了一些优化,然而这种方法的使用也是有一些问题的。。。看一下内存使用情况。


>> df1_cat["species"].str.upper().memory_usage(deep=True)
6100576

意外的发现category类型丢了。。结果竟是一个object类型,数据压缩的效果也没了,现在的结果再次回到刚才的6MB内存占用。

这是因为使用str会直接让原本的category类型强制转换为object,所以内存占用又回去了,这是我为什么最开始说要格外小心。


解决方法就是:直接对category本身操作而不是对它的值操作。 要直接使用cat的方法来完成转换操作,如下。


%timeit df1_cat["species"].cat.rename_categories(str.upper)
239 µs ± 13.9 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1000 loops each)


可以看到,这个速度就更快了,因为省去了将category类别转换为object的时间,并且内存占用也非常少。因此,这才是最优的做法。


2、与category列的合并


还是上面那个例子,但是这次增加了habitat一列,并且species中增加了sanke


df2 = pd.DataFrame(
    {
        "species": ["cat", "dog", "ape", "gorilla", "snake"],
        "habitat": ["house", "house", "jungle", "jungle", "jungle"],
    }
)
df2_cat = df2.astype({"species": "category", "habitat": "category"})


和前面一样,创建该数据集的一个category版本,并创建了一个带有object字符串的版本。如果将两个object列合并在一起的,没什么意思,因为大家都知道会发生什么,object+ object= object而已。


把object列合并到category列上


接着上面的例子。


>> df1.merge(df2_cat, on="species").dtypes
float_1     float64
species      object
habitat    category
dtype: object


左边的df1species列为object,右边的df2_catspecies列为category。我们可以看到,当我们合并时,在结果中的合并列会得到category+ object= object

这显然不行了,又回到原来那样了。我们再试下其他情况。


两个category列的合并


>> df1_cat.merge(df2_cat, on="species").dtypes
float_1     float64
species      object
habitat    category
dtype: object

结果是:category+ category= object?

有点想打人了,但是别急,我们看看为啥。


在合并中,为了保存分类类型,两个category类型必须是完全相同的。

这个与pandas中的其他数据类型略有不同,例如所有float64列都具有相同的数据类型,就没有什么区分。

而当我们讨论category数据类型时,该数据类型实际上是由该特定类别中存在的一组值来描述的,因此一个类别包含["cat", "dog", "mouse"]与类别包含["cheese", "milk", "eggs"]是不一样的。上面的例子之所以没成功,是因为多加了一个snake

因此,我们可以得出结论:

  • category1+ category2=object
  • category1+ category1=category1


因此,解决办法就是:两个category类别一模一样,让其中一个等于另外一个


>> df1_cat.astype({"species": df2_cat["species"].dtype}).merge(
       df2_cat, on="species"
   ).dtypes
float_1     float64
species    category
habitat    category
dtype: object


3、category列的分组


用category类列分组时,一旦误操作就会发生意外,结果是Dataframe会被填成空值,还有可能直接跑死。。

当对category列分组时,默认情况下,即使category类别的各个类不存在值,也会对每个类进行分组。


一个例子来说明。


habitat_df = (
    df1_cat.astype({"species": df2_cat["species"].dtype})
           .merge(df2_cat, on="species")
)
house_animals_df = habitat_df.loc[habitat_df["habitat"] == "house"]


这里采用habitat_df,从上面例子得到的,筛选habitathouse的,只有dogcathouse,看下面分组结果。


>> house_animals_df.groupby("species")["float_1"].mean()
species
ape             NaN
cat        0.501507
dog        0.501023
gorilla         NaN
snake           NaN
Name: float_1, dtype: float64


groupby中得到了一堆空值。默认情况下,当按category列分组时,即使数据不存在,pandas也会为该类别中的每个值返回结果。略坑,如果数据类型包含很多不存在的,尤其是在多个不同的category列上进行分组,将会极其损害性能。

因此,解决办法是:可以传递observed=Truegroupby调用中,这确保了我们仅获取数据中有值的组。


>> house_animals_df.groupby("species", observed=True)["float_1"].mean()
species
cat    0.501507
dog    0.501023
Name: float_1, dtype: float64


4、category列的索引


仍以上面例子举例,使用groupby-unstack实现了一个交叉表,species作为列,habitat作为行,均为category类型。


>> species_df = habitat_df.groupby(["habitat", "species"], observed=True)["float_1"].mean().unstack()
>> species_df
species       cat       ape       dog   gorilla
habitat                                        
house    0.501507       NaN  0.501023       NaN
jungle        NaN  0.501284       NaN  0.501108


这好像看似也没什么毛病,我们继续往下看。为这个交叉表添加一个新列new_col,值为1。

>> species_df["new_col"] = 1
TypeError: 'fill_value=new_col' is not present in this Categorical's categories


正常情况下,上面这段代码是完全可以的,但这里报错了,为什么?

原因是specieshabitat现在均为category类型。使用.unstack()会把species索引移到列索引中(类似pivot交叉表的操作)。而当添加的新列不在species的分类索引中时,就会报错。

总结一下,pandascategory类型非常有用,可以带来一些良好的性能优势。但是它也很娇气,使用过程中要尤为小心,确保category类型在整个流程中保持不变,避免变回object。本文介绍的4个点注意点:

  • category列的变换操作:直接对category本身操作而不是对它的值操作。这样可以保留分类性质并提高性能。
  • category列的合并:合并时注意,要保留category类型,且每个dataframe的合并列中的分类类型必须完全匹配。
  • category列的分组:默认情况下,获得数据类型中每个值的结果,即使数据中不存在该结果。可以通过设置observed=True调整。
  • category列的索引:当索引为category类型的时候,注意是否可能与类别变量发生奇怪的交互作用。


以上就是本次分享内容。

所有数据和代码可在我的GitHub获取:

https://github.com/xiaoyusmd/PythonDataScience


原创不易,欢迎点赞、留言、分享,支持东哥继续写下去。

相关文章
|
2月前
|
数据可视化 数据挖掘 数据处理
进阶 pandas DataFrame:挖掘高级数据处理技巧
【5月更文挑战第19天】本文介绍了Pandas DataFrame的高级使用技巧,包括数据重塑(如`pivot`和`melt`)、字符串处理(如提取和替换)、日期时间处理(如解析和时间序列操作)、合并与连接(如`merge`和`concat`),以及使用`apply()`应用自定义函数。这些技巧能提升数据处理效率,适用于复杂数据分析任务。推荐进一步学习和探索Pandas的高级功能。
|
2月前
|
数据处理 索引 Python
使用pandas的merge()和join()函数进行数据处理
使用pandas的merge()和join()函数进行数据处理
55 2
|
2月前
|
数据采集 数据挖掘 大数据
数据处理利器:使用Pandas进行数据清洗与转换
【4月更文挑战第12天】在大数据时代,Pandas是Python数据分析的关键工具,提供高效的数据清洗和转换功能。本文介绍了如何使用Pandas处理缺失值(删除或填充)、异常值(Z-Score法和IQR法)以及重复值(检测和删除)。此外,还涵盖了数据转换,包括数据类型转换、数据标准化(Min-Max和Z-Score)以及类别数据的one-hot编码。通过学习这些方法,可以为数据分析和挖掘奠定坚实基础。
|
2天前
|
机器学习/深度学习 数据采集 大数据
驾驭大数据洪流:Pandas与NumPy在高效数据处理与机器学习中的核心作用
【7月更文挑战第13天】在大数据时代,Pandas与NumPy是Python数据分析的核心,用于处理复杂数据集。在一个电商销售数据案例中,首先使用Pandas的`read_csv`加载CSV数据,通过`head`和`describe`进行初步探索。接着,数据清洗涉及填充缺失值和删除异常数据。然后,利用`groupby`和`aggregate`分析销售趋势,并用Matplotlib可视化结果。在机器学习预处理阶段,借助NumPy进行数组操作,如特征缩放。Pandas的数据操作便捷性与NumPy的数值计算效率,共同助力高效的数据分析和建模。
|
1天前
|
机器学习/深度学习 数据采集 数据处理
重构数据处理流程:Pandas与NumPy高级特性在机器学习前的优化
【7月更文挑战第14天】在数据科学中,Pandas和NumPy是数据处理的关键,用于清洗、转换和计算。用`pip install pandas numpy`安装后,Pandas的`read_csv`读取数据,`fillna`处理缺失值,`drop`删除列。Pandas的`apply`、`groupby`和`merge`执行复杂转换。NumPy加速数值计算,如`square`进行向量化操作,`dot`做矩阵乘法。结合两者优化数据预处理,提升模型训练效率和效果。
|
1天前
|
数据采集 机器学习/深度学习 数据处理
从基础到卓越:Pandas与NumPy在复杂数据处理中的实战策略
【7月更文挑战第14天】Pandas与NumPy在数据科学中的核心应用:**加载数据(如`read_csv`)、探索(`head()`, `info()`, `describe()`)、数据清洗(`fillna`, `dropna`, `replace`, `apply`)、数值计算(借助NumPy的`ndarray`)、分组聚合(`groupby`与聚合函数)、窗口函数(如`rolling`)和数据筛选排序(布尔索引,`query`,`sort_values`)。通过这些工具,实现从数据预处理到复杂分析的高效处理。
6 0
|
2月前
|
数据挖掘 数据处理 Python
【Python DataFrame 专栏】深入探索 pandas DataFrame:高级数据处理技巧
【5月更文挑战第19天】在 Python 数据分析中,pandas DataFrame 是核心工具。本文介绍了几个高级技巧:1) 横向合并 DataFrame;2) 数据分组与聚合;3) 处理缺失值;4) 数据重塑;5) 条件筛选;6) 使用函数处理数据。掌握这些技巧能提升数据处理效率和分析深度,助你更好地发掘数据价值。
【Python DataFrame 专栏】深入探索 pandas DataFrame:高级数据处理技巧
|
1月前
|
存储 数据挖掘 数据处理
19. Python 数据处理之 Pandas
19. Python 数据处理之 Pandas
35 1
|
1月前
|
数据采集 安全 数据处理
Python采集数据处理:利用Pandas进行组排序和筛选
使用Python的Pandas库,结合亿牛云代理和多线程技术,提升网络爬虫数据处理效率。通过代理IP避免封锁,多线程并发采集,示例代码展示数据分组、排序、筛选及代理IP配置和线程管理。
Python采集数据处理:利用Pandas进行组排序和筛选
|
2月前
|
数据采集 数据可视化 数据处理
Python中的高效数据处理:Pandas库详解
Python中的高效数据处理:Pandas库详解
53 2