Step By Step
1、算法原理简介
2、Code Sample
3、优缺点
一、算法原理简介
降维就是一种对高维度特征数据预处理方法。降维是将高维度的数据保留下最重要的一些特征，去除噪声和不重要的特征，从而实现提升数据处理速度的目的。
PCA(Principal Component Analysis)，即主成分分析方法，是一种使用最广泛的数据降维算法。PCA的主要思想是将n维特征映射到k维上，这k维是全新的正交特征也被称为主成分，是在原有n维特征的基础上重新构造出来的k维特征。PCA的工作就是从原始的空间中顺序地找一组相互正交的坐标轴，新的坐标轴的选择与数据本身是密切相关的。其中，第一个新坐标轴选择是原始数据中方差最大的方向，第二个新坐标轴选取是与第一个坐标轴正交的平面中使得方差最大的，第三个轴是与第1,2个轴正交的平面中方差最大的。依次类推，可以得到n个这样的坐标轴。通过这种方式获得的新的坐标轴，我们发现，大部分方差都包含在前面k个坐标轴中，后面的坐标轴所含的方差几乎为0。于是，我们可以忽略余下的坐标轴，只保留前面k个含有绝大部分方差的坐标轴。事实上，这相当于只保留包含绝大部分方差的维度特征，而忽略包含方差几乎为0的特征维度，实现对数据特征的降维处理。
PCA使用方差作为信息量的衡量标准，并用特征值分解来找出空间V。
二、Code Sample
- 2.1 Iris特征数据可视化
import matplotlib.pyplot as plt
from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D
from sklearn import datasets
from sklearn.decomposition import PCA
# import some data to play with
iris = datasets.load_iris()
X = iris.data[:, :2] # we only take the first two features.
y = iris.target
x_min, x_max = X[:, 0].min() - 0.5, X[:, 0].max() + 0.5
y_min, y_max = X[:, 1].min() - 0.5, X[:, 1].max() + 0.5
plt.figure(2, figsize=(8, 6))
plt.clf()
# Plot the training points
plt.scatter(X[:, 0], X[:, 1], c=y, cmap=plt.cm.Set1, edgecolor="k")
plt.xlabel("Sepal length")
plt.ylabel("Sepal width")
plt.xlim(x_min, x_max)
plt.ylim(y_min, y_max)
plt.xticks(())
plt.yticks(())The Result
通过图形可以看出：Sepal length 和 Sepal width两个特征实际还是有很强的关联性的。
- 2.2 PCA处理
import matplotlib.pyplot as plt
from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D
from sklearn import datasets
from sklearn.decomposition import PCA
# import some data to play with
iris = datasets.load_iris()
# X = iris.data[:, :2] # we only take the first two features.
y = iris.target
# plot the first three PCA dimensions
fig = plt.figure(1, figsize=(8, 6))
ax = Axes3D(fig, elev=-150, azim=110)
X_reduced = PCA(n_components=3).fit_transform(iris.data)
ax.scatter(
X_reduced[:, 0],
X_reduced[:, 1],
X_reduced[:, 2],
c=y,
cmap=plt.cm.Set1,
edgecolor="k",
s=40,
)
ax.set_title("First three PCA directions")
ax.set_xlabel("1st eigenvector")
ax.w_xaxis.set_ticklabels([])
ax.set_ylabel("2nd eigenvector")
ax.w_yaxis.set_ticklabels([])
ax.set_zlabel("3rd eigenvector")
ax.w_zaxis.set_ticklabels([])
plt.show()
The Result
通过图形可以看出，通过PCA提取三个特征对图形的分类效果交集明显降低了很多。
- 2.3 使用MLE算法选择降维维度
pca = PCA(n_components = 'mle')
pca.fit(iris.data)
print(pca.explained_variance_ratio_)
print(pca.explained_variance_)
print(pca.n_components_)The Result
[0.92461872 0.05306648 0.01710261]
[4.22824171 0.24267075 0.0782095 ]
3数据的第一个投影特征的方差占比：92.46%，MLE算法保留了3个特征。
三、优缺点
优点：
- 降低数据的复杂性，识别最重要的多个特征；
缺点：
- 不一定需要，且有可能损失有用信息；
适用数据类型：
- 数值型数据。
更多参考
Python机器学习笔记：使用scikit-learn工具进行PCA降维
scikit-learn：降维算法PCA和SVD
