(一)物流信息资源管理混乱
企业物流信息资源开发是物流信息化建设的核心任务，而开发物流信息资源，既是物流企业信息化的出发点，又是物流企业信息化的归宿。就目前的形式来说，绝大多数的物流企业信息化工作仍然没有良好的解决自身企业运作层与运作管理层之问的信息采集问题，从而造成系统缺乏足够的信息源，大大的影响到了整个物流企业信息资源的开发利用。另一方面，不少企业忽视了信息资源的规划、管理工作，缺乏统筹规划以及统一的信息标准，以至于相关的设计、生产、经营管理信息不能够快捷的流通，从而不能够完全的实现共享，形成了许多的信息孤岛，这样一来，物流企业就不能够享受到信息化投资所应得的、应产生的利益，从根本上严重的阻碍了物流企业管理信息化的发展进程。
(二)现代物流管理意识淡薄
现代物流不仅仅要求了物流管理的各个环节必须实现自动化以及智能化，还要求了物流运作的各种业务，比如说采购物流、生产物流、销售物流以及回收物流的专业化、高效化。这就要求过去相对独立的物流企业必须通过利用各种先进的物流设备以及软件系统来进行自身物流活动的设计、组织。但是由于受到现行经营体制的严重制约，我国绝大多数的企业物流活动基本上都是由企业内部组织来自行完成的。根据相关的数字显示出，在工业企业中，36％和46％的原材料物流由企业自身和供应方企业承担，而由第三方物流企业承担的仅为18％。产品销售物流中由企业自理与第三方物流企业共同承担比例分别是24．1％和59．8％，而由第三方物流企业独立承担的仅为16．1％。这种状况严重的限制了物流活动向专业化、信息化的方向发展，而现有物流企业不能够开发宽广的市场，自然也就没有足够的资金来改善自身的信息化设施以及提高自身的信息化管理水平。另外，人才是实施物流管理信息化的关键，目前物流企业普遍缺乏复合型的物流信息管理人才。
