2月12日，预印本网站Medrxiv发表了关于新冠肺炎的最新论文，分析了1月26日前中国疾控中心披露的、来自于国内30个省级行政区8866例患者数据，首次涵盖了疑似病例和确诊病例的分析，这也是迄今囊括样本数量最大的患者数据分析。
论文作者是来自解放军军事医学科学院微生物流行病研究所、国家疾控中心和美国佛罗里达大学的研究者们。
基于最新数据，论文对病毒传染性和病死率进行了重新计算，得出了一些有价值的结论：
- 近一半的患者年龄在50岁或以上（47.7%）；
- 男女发病率分别为0.31/10万和0.27/10万，差异有统计学意义（P<0.001）；
- 病毒中位潜伏期为4.75天（四分位间隔3.0~7.2天）；
- 重症肺炎占25.5%，轻度肺炎占69.9%，非肺炎占4.5%；
- 总体病死率估计为3.06%（95%可信区间为2.02-4.59%），但男性患者，60岁以上重症肺炎的基线诊断和延误诊断与病死率显著升高有关；
- 在不同潜伏期和感染期的敏感性分析中，R0估计为3.77（95%CI为3.51~4.05），范围为2.23~4.82。
本次研究结果基于纳入至2020年1月26日向中国疾病预防控制中心报告的所有2019-nCoV感染患者，比较人口统计学和基线状况之间的疾病和死亡发生率，用传播模型重新估计了病死率（CFR）和基本再生数R0。
基于最新数据分析，与SARS-CoV相比，2019-nCoV具有较低的病死率，但更高的传染性。
值得注意的是，该研究尚未经过同侪审查，须对此研究的所有数据、方法与论述等持保留态度，并关注后续论文同侪审查的进度。
论文链接：https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.02.10.20021675v1
男性发病率总体高于女性，病死率是女性患者的3倍多
这一研究中，最早期的患者出现临床表现可以追溯到2019年12月7日，截止到2020年1月26日。患者的平均年龄为49±16岁，与疑似患者相当。
在中国30个省份获取的8866名确诊病例、4021名疑似病例中，男女比例略有不同。确诊患者中女性占比45%，疑似患者中占49%。
总的来说，男性的发病率高于女性（0.31/10万 vs 0.27/10万，P<0.001）。但是需要注意的是，武汉和其他地区的年龄性别模式不同，外来人口往往比武汉市民年轻，性别差异仅在武汉以外的地区表现显著，男性为0.19/10万，女性为0.15/10万（P<0.001）。
确诊患者中，重度肺炎935例（25.5%），轻度肺炎2563例（69.9%），无肺炎167例（4.5%）。与轻度肺炎（45±15岁，男性占52.71%）和非肺炎（42±16岁，男性占52.1%）相比，诊断为重症肺炎的患者年龄明显增大（55±15岁），男性占61.5%。
截止26日，根据卫健委公布的疫情数据，确诊患者达到1975，疑似病患为2684，其中58名确诊患者和18名疑似患者中出现了致命结果，前者导致观察到的CFR为1.44%（95%可信区间为1.10%-1.86%），确诊的重症肺炎患者的观察CFR为5.88%，明显高于轻型肺炎患者（0.12%）和非肺炎患者（0%）。
据此可以估计，确诊患者中的整体校正CFR为3.06%（95%可信区间2.02-4.59%）。男性患者校正后的病死率是女性患者的3倍多，分别为4.45%（95%可信区间2.81-6.93%）和1.25%（95%可信区间0.43-3.29%）。60岁或60岁以上的患者调整后的病死率也比年轻患者高5.30%（95%可信区间3.25-8.46%），年轻患者为1.43%（95%可信区间0.61-3.15%）。
总体病死率估计为3.06%，高于50岁的成年人发病率最高
基于最新数据，重估的总体病死率为3.06%（95%可信区间为2.02-4.59%），但男性患者，60岁以上重症肺炎的基线诊断和延误诊断与病死率显著升高有关。
最新的这份研究中，确诊患者以30-65岁为主（2873例，占比71.45%），56岁患者以139例最多。在疑似患者中也能观察到类似的年龄分布，高于50岁的成年人发病率最高，20岁以下年龄组发病率最低。
确诊患者中还有14名小于10岁的儿童。有严重症状的13例10岁以下儿童患者中，10例为轻度肺炎，3例为非肺炎。重症肺炎8（4-12）天的发病至诊断的中间时间间隔长于轻度肺炎4（2-7）天，非肺炎3（1-5）天。非肺炎发病率由早发病上升到晚发病。武汉地区的轻度肺炎和非肺炎发病率高于武汉以外地区。
基线诊断重症肺炎是死亡的另一个主要危险因素，调整后的病死率6.23%（95%可信区间3.87-9.79%）相关，轻度或无肺炎患者在基线检查时的校正病死率相对较低，为0.68-1.16%，这取决于基线检查时未知严重程度的患者是否被归类为轻度。
从发病到诊断的延迟超过5天，校正后的病死率也从1.34%（95%可信区间0.35-5.12%）增加到3.07%（95%可信区间2.02-4.60%）。通过一个以上的基线变量进一步分层分析可以发现，符合这三个特征中任何两个的患者，男性患者，60岁或以上，以及诊断时的严重肺炎，CFR将进一步增加。特别是，在确诊患有严重肺炎的老年男性患者中，校正后的病死率高达9.47%（5.34-15.99%）。
R0重新估计为3.77，传播力较SARS更强
新研究也基于最新数据，重新估计了新病毒的基本传染数R0为3.77（95%可信区间3.51-4.05）。之前发布在《新英格兰医学杂志》上的研究，基于425名患者得到的R0为2.2。
R0是指在没有外力的干预下，同一个前宿主平均能传染给多少个新宿主。当R0小于1表示该传染病会渐渐自我消亡。
作为估计R0的必要输入，研究人员对125例有明确暴露时间的患者的潜伏期分布进行了估计，结果表明，潜伏期的中位数（IQR）持续时间为4.8（3.0，7.2）天，在此基础上，研究人员构建了几个潜伏期和感染期的敏感性分析设置，以评估2019-nCoV的人对人传播。
使用平均潜伏期5天和平均感染期7天，研究者估计R0为3.77（95%可信区间3.51-4.05），假设2020年1月1日前初始报告率为100%。自然病史和报告率的不同设置产生了R0估计值，范围从2.23到4.82。较高的估计数与较长的潜伏期和感染期以及较高的初始报告率有关。使用所有确诊和疑似患者进行估计，得出的估计值略高，范围从2.31到5.18。
作为对比，中东呼吸综合征(MERS)的R0小于1，而SARS的R0为3。
将估计窗口从2019年12月25日至2020年1月12日移至2019年12月28日至2020年1月15日，根据确诊患者将估计值降至3.00（95%CI 2.81-3.20），根据所有患者将估计值降至3.28（95%CI 3.14-3.43），在中位潜伏期和感染期以及100%初次报告下。有效再生数Rt在2019年12月25日左右开始超过1的临界阈值，根据自然病史的设定在2020年1月3日左右达到8-15的峰值，并在2020年1月16日附近迅速下降到阈值以下。
这一下降趋势很可能是由于报告延迟，而不是传播性降低。Rt曲线形状对潜伏期中等敏感，对感染期不敏感。与R0的结果相似，较低的初始报告率与较低的Rt曲线相关。在疫情的早期阶段，使用所有患者都会导致高Rt，但峰值相似。
使用EpiEstim软件包获得的Rt曲线呈双峰形，在2019年12月22日附近和2020年1月中旬附近有两个模式。假设平均序列间隔为9天，2019年12月25日至2020年1月12日期间的平均Rt接近3，与对R0的估计相当，平均序列间隔越长，Rt曲线越高。
全国疫情新地图：爆发趋势与节前人口流动重叠，乡镇地区地理聚集性明显
在2020年1月1日之前，该病的发病率保持在较低水平，临床症状的出现也是零星的，但是在1月23日后，发病率突然上升，随后呈指数增长，这一增长趋势与1月10日正式开始的春节前人口流动的行为重叠。研究期间最后三天的下降趋势可能是由于诊断或报告的延迟导致。
1月17日可以看做是疫情的一个转折点，武汉以外地区的确诊患者数量开始超过武汉，疑似患者的模式与确诊患者相似，但有23天的延迟。
1月中旬，武汉病人数量迅速增加，下旬又蔓延到其他省份，特别是河南、四川和湖南等邻近省份，受农民工欢迎的浙江和广东也出现了大幅增长。在分析受影响城镇的数量时，也观察到类似的趋势，受影响城镇的数量显著增加。
在乡镇，患者的地理聚集性明显，主要集中在湖北省（占全部患者的65.35%），发病率从0.75/10万到15.81/10万不等，在湖北周边省份以及北京、上海附近的长江三角洲、浙江东南部以及广州和香港附近的珠江三角洲等地区，也表现出了较为明显的聚集性。
确诊病例报告越早，发病率越高。同时，在非湖北地区，首例患者的报告时间与武汉市流入各地区的人口数量呈负相关。
