fmri数据分析图像格式及转换问题——基于spm讨论

简介:

1.几大常用格式

这张ppt介绍了现在常用的三种格式:dicom主要由扫描器产生,一般是一个slice一个文件;analyze 格式= .img/.hdr spm下用的最多;nifti ,由fsl & afni & spm几个老大哥共同确定的格式,支持3d或者4d。

 

 

2.利用spm的dicom import 把dicom原始数据转换成分析格式

 

  一般从sanner拷出来的文件夹中,每一个文件夹里的dicom文件,代表一个被试一次run的结果。spm会自动将dicom转成hdr/img格式。

3.利用matlab从hdr/img中读取文件信息,绘图,抽取出矩阵数据等等。

  学会使用spm自带的两条命令:spm_vol :读取相应的img文件的hdr文件信息;

                spm_read_vols:按照矩阵格式,读取img文件内容。

 

 

4.利用matlab 批量读取img文件,然后自动转换成四维的数据。(这张ppt的spm_get命令似乎有问题,最好还是利用其他方法进行3d-》4d)

 

5.绘制时间序列

 5.利用spm进行3d转4d:
hankfully, SPM has a semi-hidden utility for this conversion.

The GUI is located within the Batch Editor’s SPM>Util menu, and be default saves the specified 3D NIFTI images to a single 4D NIFTI image within the same directory.

6. 把nii格式转成hdr和img格式

  利用mricron软件的import—》 convert nifti .nii to .hdr/.img

 本文转自二郎三郎博客园博客,原文链接:http://www.cnblogs.com/haore147/p/3631448.html,如需转载请自行联系原作者


相关文章
|
11月前
|
数据挖掘 计算机视觉 Python
Python数据分析中图像处理的实用技术点:图像加载与保存、图像转换与增强、特征提取与描述
Python数据分析中图像处理的实用技术点:图像加载与保存、图像转换与增强、特征提取与描述
92 1
Python数据分析中图像处理的实用技术点:图像加载与保存、图像转换与增强、特征提取与描述
|
6月前
|
数据可视化 数据挖掘
【数据分析与可视化】对图像进行SVD分解并重构图像实战(附源码)
【数据分析与可视化】对图像进行SVD分解并重构图像实战(附源码)
166 0
|
5月前
|
存储 数据可视化 算法
空间单细胞|基于图像的空间数据分析(2)
空间单细胞|基于图像的空间数据分析(2)
117 0
|
5月前
|
数据可视化 数据挖掘 数据库
空间单细胞|基于图像的数据分析(3)
空间单细胞|基于图像的数据分析(3)
47 0
|
机器学习/深度学习 数据采集 人工智能
数据科学实训案例研发:农业遥感图像数据分析上线阿里云
这是2020年阿里云计算有限公司-教育部产学合作协同育人项目的成果。 实训课程内容涵盖了主要内容涵盖了图像分割的基础知识,主要包括图像分割的概论、基础、分类、神经网络实现等经典的机器学习理论知识,也包括卷积神经网络、残差网络、U-Net算法、多模态等深度学习内容。此外,还介绍天池AI等平台的应用,在此基础上通过实验的方式,详细地介绍机器视觉在农业大数据分析领域的过程,以及遥感图像处理相关技术的原理与实践。结合阿里云的产品和技术资源,进行应用实验,让学生在充分理解掌握基础知识的同时,也能接触到业界最前沿的发展方向和成果。本课程通过实验大作业的方式,实现典型的机器视觉应用,训练学生模型设计与应用。
606 0
|
数据采集 数据挖掘 大数据
Python数据分析与挖掘————图像的处理(一)
Python数据分析与挖掘————图像的处理(一)
292 0
|
数据挖掘 Python
Python数据分析与挖掘————图像的处理(二)
Python数据分析与挖掘————图像的处理(二)
147 0
|
数据挖掘 Python
【Python数据分析】用Matplotlib绘制其它常见的图像
文章目录 1️⃣柱状图 2️⃣直方图 3️⃣散点图 4️⃣饼图
【Python数据分析】用Matplotlib绘制其它常见的图像
|
数据挖掘 Python
Python数据分析与展示:图像的手绘效果-5
Python数据分析与展示:图像的手绘效果-5
186 0
Python数据分析与展示:图像的手绘效果-5
|
数据挖掘 Python
Python数据分析与展示:图像的手绘效果-5
Python数据分析与展示:图像的手绘效果-5
120 0
Python数据分析与展示:图像的手绘效果-5
下一篇
无影云桌面