4.3 图像分类ResNet实战：眼疾识别

# 如果已经解压过，不需要运行此段代码，否则由于文件已经存在，解压时会报错
!unzip -o -q -d /home/aistudio/work/palm /home/aistudio/data/data19065/training.zip
%cd /home/aistudio/work/palm/PALM-Training400/
!unzip -o -q PALM-Training400.zip
!unzip -o -q -d /home/aistudio/work/palm /home/aistudio/data/data19065/validation.zip
!unzip -o -q -d /home/aistudio/work/palm /home/aistudio/data/data19065/valid_gt.zip
#返回家目录，生成模型文件位于/home/aistudio/
%cd /home/aistudio/

import os
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
%matplotlib inline
from PIL import Image
DATADIR = '/home/aistudio/work/palm/PALM-Training400/PALM-Training400'
# 文件名以N开头的是正常眼底图片，以P开头的是病变眼底图片
file1 = 'N0012.jpg'
file2 = 'P0095.jpg'
# 读取图片
img1 = Image.open(os.path.join(DATADIR, file1))
img1 = np.array(img1)
img2 = Image.open(os.path.join(DATADIR, file2))
img2 = np.array(img2)
# 画出读取的图片
plt.figure(figsize=(16, 8))
f = plt.subplot(121)
f.set_title('Normal', fontsize=20)
plt.imshow(img1)
f = plt.subplot(122)
f.set_title('PM', fontsize=20)
plt.imshow(img2)
plt.show()

# 查看图片形状
img1.shape, img2.shape

import cv2
import numpy as np
# 对读入的图像数据进行预处理
def transform_img(img):
    # 将图片尺寸缩放道 224x224
    img = cv2.resize(img, (224, 224))
    # 读入的图像数据格式是[H, W, C]
    # 使用转置操作将其变成[C, H, W]
    img = np.transpose(img, (2,0,1))
    img = img.astype('float32')
    # 将数据范围调整到[-1.0, 1.0]之间
    img = img / 255.
    img = img * 2.0 - 1.0
    return img

import cv2
import random
import numpy as np
import os
# 定义训练集数据读取器
def data_loader(datadir, batch_size=10, mode = 'train'):
    # 将datadir目录下的文件列出来，每条文件都要读入
    filenames = os.listdir(datadir)
    def reader():
        if mode == 'train':
            # 训练时随机打乱数据顺序
            random.shuffle(filenames)
        batch_imgs = []
        batch_labels = []
        for name in filenames:
            filepath = os.path.join(datadir, name)
            img = cv2.imread(filepath)
            img = transform_img(img)
            if name[0] == 'H' or name[0] == 'N':
                # H开头的文件名表示高度近似，N开头的文件名表示正常视力
                # 高度近视和正常视力的样本，都不是病理性的，属于负样本，标签为0
                label = 0
            elif name[0] == 'P':
                # P开头的是病理性近视，属于正样本，标签为1
                label = 1
            else:
                raise('Not excepted file name')
            # 每读取一个样本的数据，就将其放入数据列表中
            batch_imgs.append(img)
            batch_labels.append(label)
            if len(batch_imgs) == batch_size:
                # 当数据列表的长度等于batch_size的时候，
                # 把这些数据当作一个mini-batch，并作为数据生成器的一个输出
                imgs_array = np.array(batch_imgs).astype('float32')
                labels_array = np.array(batch_labels).reshape(-1, 1)
                yield imgs_array, labels_array
                batch_imgs = []
                batch_labels = []
        if len(batch_imgs) > 0:
            # 剩余样本数目不足一个batch_size的数据，一起打包成一个mini-batch
            imgs_array = np.array(batch_imgs).astype('float32')
            labels_array = np.array(batch_labels).reshape(-1, 1)
            yield imgs_array, labels_array
    return reader
# 定义验证集数据读取器
def valid_data_loader(datadir, csvfile, batch_size=10, mode='valid'):
    # 训练集读取时通过文件名来确定样本标签，验证集则通过csvfile来读取每个图片对应的标签
    # 请查看解压后的验证集标签数据，观察csvfile文件里面所包含的内容
    # csvfile文件所包含的内容格式如下，每一行代表一个样本，
    # 其中第一列是图片id，第二列是文件名，第三列是图片标签，
    # 第四列和第五列是Fovea的坐标，与分类任务无关
    # ID,imgName,Label,Fovea_X,Fovea_Y
    # 1,V0001.jpg,0,1157.74,1019.87
    # 2,V0002.jpg,1,1285.82,1080.47
    # 打开包含验证集标签的csvfile，并读入其中的内容
    filelists = open(csvfile).readlines()
    def reader():
        batch_imgs = []
        batch_labels = []
        for line in filelists[1:]:
            line = line.strip().split(',')
            name = line[1]
            label = int(line[2])
            # 根据图片文件名加载图片，并对图像数据作预处理
            filepath = os.path.join(datadir, name)
            img = cv2.imread(filepath)
            img = transform_img(img)
            # 每读取一个样本的数据，就将其放入数据列表中
            batch_imgs.append(img)
            batch_labels.append(label)
            if len(batch_imgs) == batch_size:
                # 当数据列表的长度等于batch_size的时候，
                # 把这些数据当作一个mini-batch，并作为数据生成器的一个输出
                imgs_array = np.array(batch_imgs).astype('float32')
                labels_array = np.array(batch_labels).reshape(-1, 1)
                yield imgs_array, labels_array
                batch_imgs = []
                batch_labels = []
        if len(batch_imgs) > 0:
            # 剩余样本数目不足一个batch_size的数据，一起打包成一个mini-batch
            imgs_array = np.array(batch_imgs).astype('float32')
            labels_array = np.array(batch_labels).reshape(-1, 1)
            yield imgs_array, labels_array
    return reader

import paddle
paddle.seed(100)
# 查看数据形状
DATADIR = '/home/aistudio/work/palm/PALM-Training400/PALM-Training400'
train_loader = data_loader(DATADIR, 
                           batch_size=10, mode='train')
data_reader = train_loader()
data = next(data_reader)
data[0].shape, data[1].shape
eval_loader = data_loader(DATADIR, 
                           batch_size=10, mode='eval')
data_reader = eval_loader()
data = next(data_reader)
data[0].shape, data[1].shape