Sentieon | 每周文献-Gene Editing-第二十八期

简介: Sentieon | 每周文献-Gene Editing-第二十八期

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  • 标题(英文):CRISPR-Cas9 generated Pompe knock-in murine model exhibits early-onset hypertrophic cardiomyopathy and skeletal muscle weakness
  • 标题(中文):CRISPR-Cas9 生成的庞贝敲入小鼠模型表现出早发性肥厚型心肌病和骨骼肌无力
  • 发表期刊:scientific reports
  • 作者单位:加州大学圣地亚哥分校等
  • 发表年份:2020
  • 文章地址:
  • https://doi.org/10.1038/s41598-020-65259-8

 

庞贝病,由酸α-葡萄糖苷酶(GAA;EC 3.2.1.20),其特征在于糖原在身体组织(主要是心脏和骨骼肌)中的溶酶体积累。肌肉溶酶体糖原贮积导致肌无力,发病年龄和严重程度根据残留的 GAA 酶活性而变化。婴儿发病的庞贝病 (IOPD) 由几乎缺失的 GAA 酶引起,通常在出生后前2个月内表现为进行性和重度肥厚型心肌病、心力衰竭、肌张力减退、呼吸衰竭和出生后14个月内死亡

婴儿发病的庞贝病 (IOPD) 由溶酶体酸 α-葡萄糖苷酶 (GAA) 突变引起,表现为快速进展的致死性心脏和骨骼肌病,通过合成 GAA 静脉输注不完全减弱。目前可用的小鼠模型不能完全模拟人类眼压,显示骨骼肌病伴迟发性肥厚型心肌病。

在这项研究中,研究者报告了利用新的双单向导 RNA 方法,成功地产生了 Gaac.1826dupA (p.Y609*)14 小鼠庞贝氏症基因敲入模型。

在该研究中,研究者使用Sentieon软件进行胚系变异检测。

综上所述,该研究结果强烈表明 Gaac.1826dupA小鼠应用作首选的临床前庞贝病模型,用于评估基于基因组校正和其他基因组靶向治疗策略。

Sentieon软件介绍

Sentieon为完整的纯软件基因变异检测二级分析方案,其分析流程完全忠于BWA、GATK、MuTect2、STAR、Minimap2、Fgbio、picard等金标准的数学模型。在匹配开源流程分析结果的前提下,大幅提升WGS、WES、Panel、UMI、ctDNA、RNA等测序数据的分析效率和检出精度,并匹配目前全部第二代、三代测序平台。

Sentieon软件团队拥有丰富的软件开发及算法优化工程经验,致力于解决生物数据分析中的速度与准确度瓶颈,为来自于分子诊断、药物研发、临床医疗、人群队列、动植物等多个领域的合作伙伴提供高效精准的软件解决方案,共同推动基因技术的发展。

截至2023年3月份,Sentieon已经在全球范围内为1300+用户提供服务,被世界一级影响因子刊物如NEJM、Cell、Nature等广泛引用,引用次数超过700篇。此外,Sentieon连续数年摘得了Precision FDA、Dream Challenges等多个权威评比的桂冠,在业内获得广泛认可。

 

软件试用: https://www.insvast.com/sentieon
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