带你读《生命科学行业云上解决方案及最佳实践》——GHDDI,阿里云高性能计算助力 药物研发实现高通量分子筛选

简介: 带你读《生命科学行业云上解决方案及最佳实践》——GHDDI,阿里云高性能计算助力 药物研发实现高通量分子筛选

1 客户介绍

GHDDI,全称全球健康药物研发中心(Global Health Drug Discovery Institute),由比尔

及梅琳达·盖茨基金会、清华大学和北京市政府联合发起成立于中国北京。清华大学药学院院长、拜耳特聘教授丁胜教授担任中心主任。通过汇聚全球顶尖资源、发挥中国特色优势,GHDDI 致力于建设引领性的生物医药研发能力和创新药物转化平台,攻克人类面临的重大疾病挑战,改善全球健康。


2 业务痛点

1. GHDDI 的计算化学和人工智能研发系统需要大量的、弹性的计算,日后还有对外开放平台的计划,已有的 4 台 GPU 服务器和 12 台 CPU 服务器,不能满足日常的科研和对外服务的需求。


2. 当新冠肺炎爆发,GHDDI 也加入到了研发新药和疫苗的队列中,急需大量计算资源加快研究进度。


3 解决方案和价值

阿里云高性能计算在短时间内提供了大量 GPU 和超算产品,以及全天候的技术支持。1 月 29 日,阿里云宣布对全球公共科研机构免费开放一切 AI 算力,以支持抗疫。在此之前,阿里云弹性高性能计算平台 E-HPC 就开始免费支持 GHDDI 研究新冠病毒。


新冠疫情期间,GHDDI 使用 E-HPC 搭建云上高性能计算集群在阿里云上实现了开放共享平台,用于药物研发的分子对接、分子动力学模拟、深度学习模型训练、大规模并行计算,把需要几天的计算工作缩短到几小时,速度提升 8 到 20 倍。同时为合作伙伴创建不同的云上 HPC 子账户,实现计算资源共享和数据共享。

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随后,数以百计的海内外科研机构和研究团队基于 GHDDI 的开放资源进行针对新冠病毒的药物、疫苗开发。

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