借助云计算的强大能力,生命科学行业迎来了前所未有的机遇。着眼于未来,无论是精准医疗、分子诊断,还是细胞基因治疗、生物药研发等前沿领域,只有让云计算来加速数字化、智能化转型,才能通过改善数据驱动的决策来加速转型升级,应对未来发展的挑战。
2003年,当来自各国的科学家们共同宣布实现了人类基因组的完整序列时,其实还有约8%的基因组因高度重复并未被完全测序,即使是这样,总共花费了14年的时间和数十亿美元。
而现在,费城儿童医院仅用两小时二十分钟就可以在云端完成了一千条全基因组序列。如果离开云计算,作为生命科学领域基石的基因组学将是空中楼阁,完全无法落地。
生命科学的发展,尤其是与人工智能、大数据、移动互联网的融合发展,促使未来健康医疗在理念、理论、方法、目标与体系方面都会发生深刻变革。人类社会的整个健康医疗产业体系、项目业态与消费模式都将重构与重建。
2018年,阿联酋宣布了一项医疗计划,将对近300万城市居民进行全面DNA测序,希望借此筛查可能的健康风险,使完成筛查的居民们在得病前就能得到有效治疗。
这无疑是一项庞大的工程,需要随时调用海量计算资源,2020年,来自中国的生命科学数字化解决方案提供商百奥利盟,成为阿联酋生物技术公司G42 BIOGENIX所负责中东人类基因组计划的合作伙伴。
阿里云计算巢加速器的成员企业「百奥利盟」,是一家提供生命科学数字化解决方案的高新技术企业,提供智慧实验室和智能制造数字化解决方案,助力生命科学企业数字化转型。目前,百奥利盟已经为全球300多家智慧实验室提供信息化解决方案,此外,还涉及生物药研发、临床前实验、智能制造等医疗产业链上的各个环节的数字化。
“我们的长期愿景是为全球的精准医疗和创新生物药行业提供全程数字化解决方案,这也意味着对企业数字化系统及IT基础设施都提出了更高的要求。现在,借助阿里云计算巢平台,我们正在帮助客户实现端到端集成全生命周期实现数字化管理,从根本上解决数字化转型的难题。”百奥利盟创始人兼CTO倪毅谈到。
“云计算的本质是技术和开放。对于企业服务领域,云需要更加开放,通过技术手段成为伙伴发展的效率倍增器。”阿里云智能基础产品部副总裁、阿里云智能弹性计算&无影产品线总经理张献涛表示,阿里云计算巢的愿景,是构建一个开放的企业服务应用生态,助力企业软件快速实现云化,共同助力客户实现数字化升级。
借助云计算的强大能力,生命科学行业迎来了前所未有的机遇。着眼于未来,无论是精准医疗、分子诊断,还是细胞基因治疗、生物药研发等前沿领域,只有让云计算来加速数字化、智能化转型,才能通过改善数据驱动的决策来加速转型升级,应对未来发展的挑战。
一、生于云,长于云,计算巢成为行业创新引擎
基因数据是精准医疗和创新生物药行业的基石,虽然相对结构化,但一个人的基因组就有3个G的大小,相当于一本上千页的书。由于基因测序成本等检测技术的成熟和成本降低,近年来基因数据爆发式增长,全部基因数据规模已达到EB级别。
在云计算出现以前,要读懂这样一本书都十分困难,而现在要面对的是一个又一个图书馆,普通的计算已经无法胜任。如今,百奥利盟正在帮助客户通过高级算法和云计算来加速基因序列分析,让发现疾病的过程变得更快、更容易、更便宜。
正如前文所提到的中东人类基因组计划,全球生命科学领域的前沿技术公司都在探索过去无法想象应用领域,而这些探索也需要大量基础能力作为基石。
阿里云计算巢面向8个行业、6个通用场景,已经在提供1000+应用服务,是为超过600家ISV合作伙伴提供服务的云集成PaaS平台,其中也沉淀了大量阿里云和合作伙伴在垂直领域开发云原生应用的行业Know how。
据倪毅介绍,借助阿里云计算巢的规模化、智能化优势,百奥利盟可以帮助客户一键构建云上精准医疗与创新生物药数字化解决方案,简化集群部署的复杂性,并实现应用集群的自动化部署,相比传统以天、甚至以周为单位的交付周期,交付效率有极大的提升。
除了部署和交付效率的提升之外,阿里云计算巢平台可以从根本上解决私有化部署中的各种问题:
首先,计算巢能够帮助百奥利盟实现服务的在线化。
以往,生命科学行业的科技公司通常采用传统的私有化部署模式,系统服务是离线的、滞后的,无法及时察觉系统异常、会导致业务受损,增加了运维的难度,无法保障业务的稳定运行。
今天,通过计算巢平台,百奥利盟可以检测到用户侧的异常事件,结合计算巢的智能检测的功能,把平台层面的问题排除掉,将客户问题排查范围缩小到应用层面,这样进一步地缩短了修复时间,加速用户业务的恢复。
第二,高度集成计算巢平台,为最终用户提供更具性价比的方案。
通过云的技术红利,借助阿里云提供的计算实例、对象存储等高性价比的云服务,百奥利盟可以让软件更好地与云更好地集成,最终为客户提供一套极具性价比的解决方案。
例如,采用全新第四代AMD EPYC处理器的阿里云g8a实例, 基于阿里云全新计算体系架构CIPU以及AMD EPYC前瞻性的架构设计和领先的制程技术,阿里云g8a实例可以为终端客户提供强劲算力,帮助客户加速业务创新、降本增效。
第三,通过云的弹性能力,用户在数据量增长过程中可以随时对底层资源进行扩缩容,保证业务的稳定运行,为用户提供极致顺滑的体验。
计算巢为ISV更好地将产品、服务与阿里云集成提供了便利,借助云原生的能力提升软件服务在交付、部署及后续管理等环节的效率和用户体验。对于百奥利盟而言,云原生应用也明显提升了其行业和国际竞争力。
“百奥利盟的全程数字化解决方案融合了大量前沿技术,除了云计算,还在与人工智能相结合。绑定这些更新的技术,使我们不仅限于国内、还有机会为海外精准医疗和生物药领域的客户们提供与国际接轨的数字化解决方案,不断创新使我们具备了国际竞争力。”谈到创新,倪毅充满了自信。
百奥利盟的出海之路从2016年开始,当年Bio LIMS INC在美国波士顿成立,Bio-LIMS International版发布,该版本针对国际精准医疗实验室,2020年成功进入中东,国际客户对百奥利盟系统的评价是“There is no best LIMS,but suitable LIMS”,而百奥利盟对客户则是 “A Partnership Rather Than A Vendor-Client Relationship”。
百奥利盟所实施的Bio-LIMS International系统,借助阿里云计算巢平台级的底层能力,Bio-LIMS International系统作为云原生应用充分起到了核心系统的作用,基于组件式的体系架构设计,满足实验室业务的不断拓展,帮助其应对业务扩增的难题、降低信息化成本,用成熟、领先的国际化最佳实践助力合作伙伴探索未知领域。
倪毅特别提到:阿里云计算巢使我们可以采用诸如敏捷开发、持续迭代和持续交付等现代软件开发方法做到更快的应用交付。百奥利盟在服务北美客户有个心得,当地的实施人员在沟通定制化需求以后,即时传达给北京开发人员,因为时差,客户的休息时间北京的开发团队已经将新服务上线,第二天,客户欣喜地发现,通过持续迭代完成交付,需求在24小时内就得到了响应。
Bio-LIMS系统作为云原生的一体化管理平台,将稳定性、安全性、可规模化、多渠道打通、服务化、智能化这些要素交由更底层的阿里云计算巢,从而更高效集成“订单、样本库、报告、运营”等业务流程,进而实现人/材/机/法/环全面信息化管理。不仅大大提高工作效率、降低实验室成本,而且提升了客户体验与服务品质。
云原生也加速了百奥利盟产品创新及迭代的频率,其最新推出的Bio-Research5.0版通过引入AI人工智能、GxP数字化、IoT 、云技术,构建安全、合规、智能、可追溯的云上信息化管理平台。
在不久前百奥利盟为药物研发及肿瘤精准医学提供一站式服务企业立闻生物所定制的《智慧实验室信息化管理建设项目》中,双方项目团队仅用2-3个月即完成Bio-LIMS系统成功上线,全面应用于日常数字化管理工作中。
二、关于合规,百奥利盟与阿里云寻求最优解
全球生命科学数字化已经开始进入螺旋上升的增长飞轮。
医疗水平的提升对于医疗科技提出了越来越高要求,也因此在全行业范围内不断涌现出各种各样的精准医疗、AI医疗、辅助医疗手段。
在医疗科技数字化能力与摩尔定律同步增长的带动下,各种图像、医疗影像、基因组序列、以及大量精细分析领域的数据量呈海量增长的趋势。随着医疗及生命科学领域异构数据量的剧增,合规、数据安全等需求则越来越显著。
“此前,云计算在生命科学领域的应用有一定局限性,只在研发、实验室检测等对数据敏感性要求相对不高的场景,有一定应用空间。”百奥利盟成立于2012年,见证了国内云计算从无到有,从小到大的发展历程,倪毅也谈到了过去云计算的局限性。
在数字化转型潮流下,生命科学领域的企业们在更多地关注合规、安全、成本和效率。他们希望基于云计算构建完善运营、安全性、可靠性、性能效率和成本优化的框架,完善治理结构、健全规章制度、加强制度执行力,并且高效地解决业务需求和挑战。
针对创新生物药及细胞和基因治疗领域,百奥利盟提供的Bio-Vaccine生物药数字化解决方案和Bio-CELL细胞和基因治疗一体化追溯系统主要从基本法规、实验室规范、生产GMP规范三个层面 完全符合生命科学行业的法规和规范。
此外,据介绍,百奥利盟与阿里云云盒达成合作,依托云盒的软硬一体的公共云本地化部署服务,针对生物药企的计算机系统验证和数据追溯需求,百奥利盟可以在客户任意指定位置部署基于云原生架构的百奥利盟精准医疗和创新生物药数字化系统,为生命科学行业 SaaS 应用实现数据本地化,满足生命科学企业的数据安全合规要求,为大型研究型医院、生命科学与医学领域国家实验室和科研院所、第三方医学检测实验室、基因与生物技术科技公司、生物药企业、CRO、CDMO等企业打造科研到生产的全生命周期的一站式服务。
生命科学、云计算同样都是基础而前沿的高成长赛道,未来必定还将碰撞出更多的火花。「百奥利盟」也将借助阿里云计算巢,更好地生于云、长于云,实现更好的集成,共同助力生命科学企业实现数字化升级。