Python优化:Cython加速

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简介: Python 作为一门高级语言具有易学、易用的特点,被广泛应用于数据处理、网站编程等领域。但与 C 和 C++ 等编译型语言相比Python 在代码的执行效率方面存在天生的不足。这使得在处理大规模数据和高性能计算等领域,Python 相对于其他语言非常劣势。

一、Python语言的性能瓶颈问题

Python 作为一门高级语言具有易学、易用的特点,被广泛应用于数据处理、网站编程等领域。但与 C 和 C++ 等编译型语言相比Python 在代码的执行效率方面存在天生的不足。这使得在处理大规模数据和高性能计算等领域,Python 相对于其他语言非常劣势。造成 Python 语言性能瓶颈问题的主要原因包括以下两方面:

1 Python语言的弱点

  1. 弱类型语言:Python 是一门弱类型语言,需要在运行时才能确定变量的类型,这导致 Python 在计算时需要消耗大量的时间来进行类型检查和转换。

  2. 解释型语言:Python 是一门解释型语言,在执行 Python 程序时,需要先将程序代码转换成字节码,然后由 Python 解释器将字节码转换成机器码执行,这使得 Python 代码的执行效率较低。

2 代码执行效率低下的常见原因

  1. 列表操作过于频繁:在 Python 中,列表是最常用的数据类型之一,但是频繁的列表操作会导致 Python 代码的执行效率降低。

  2. 循环嵌套过多:Python 中的列表解析和生成器表达式等高级特性,虽然简洁而优美,但是在实现过程中,经常需要使用两层或多层循环嵌套,这会影响 Python 代码的执行效率。

二、Cython介绍

为了弥补 Python 在性能瓶颈上的不足许多工具和语言都被提出来。其中 Cython 作为 Python 中一种常用的语言扩展,被开发出来用于解决 Python 性能瓶颈问题。Cython 可以编写 C 扩展模块也可以将 Python 代码转换成 C 代码,提高 Python 的执行效率。

1 Cython的概念和作用

Cython 是一种“Python语法的C扩展版本”可以编写 C 扩展模块,也可以将 Python 代码转换成 C 代码。Cython 的目的就是为了解决 Python 的性能问题。

2 Cython与Python的关系

Cython 是 Python 的超集支持所有的 Python 语法,因此我们可以把 Python 的代码直接转换成 Cython 的代码,并使用 Cython 的编译器将其编译成 C 代码。在 Cython 中,Python 代码和 C 语言代码可以自由切换。

三、通过Cython提升Python性能

为了提高 Python 程序的性能可以使用 Cython 来对我们的 Python 代码进行优化。

1 从Python到Cython

假设我们有如下的 Python 代码:

# example.py
def fib(n):
    a, b = 0, 1
    for i in range(n):
        a, b = b, a+b
    return a

将这段 Python 代码转换成 Cython 的代码:

# example.pyx
cpdef fib(int n):
    cdef int a = 0, b = 1
    for i in range(n):
        a, b = b, a+b
    return a

Cython 代码中的 cpdef 声明允许这个函数被 Python 和 C 语言所调用。在 Cython 代码中使用了 cdef 来定义 C 语言变量和常量,这样做可以避免 Python 变量类型检查的开销,提高代码的执行速度。

2 Cython代码的编写和调试

除了转换 Python 代码到 Cython 代码也可以直接编写 Cython 代码。与 Python 不同的是,Cython 支持类型声明可以显式地指定函数的参数和返回值的类型等信息。这可以提高代码的执行效率,并且 Cython 代码可以方便地和 C 代码进行交互。

在编写 Cython 代码时为了保证代码的正确性需要使用 cythonize 来将我们写好的 Cython 代码编译成 C 代码。为了方便调试还需要在编译时开启 debug 模式,这可以通过设置 annotate=True 来实现:

# setup.py
from setuptools import setup, Extension
from Cython.Build import cythonize

ext_modules = [
    Extension(
        'fib',
        sources=['fib.pyx'],
        language='c++',
        extra_compile_args=['-g']
    )
]

setup(
    name='Fibonacci',
    ext_modules=cythonize(ext_modules, annotate=True)
)

使用 setup.py 中的脚本文件将 Cython 代码编译并打包成 Python 模块。其中ext_modules 变量指定了需要编译的 C 扩展。使用 cythonize 来将 Cython 代码编译成 C 代码,同时开启 annotate=True 会生成与 Cython 源代码相关联的 HTML 文件,以便我们可视化地查看代码的执行情况。

Python 对于 C 扩展的导入一般是通过 import 语句来实现的:

from fib import fib

最后,我们调用编译出来的 fib 函数即可:

print(fib(100))

四、Cython加速实战

Cython 提供了一种用于编写 C 扩展模块和以静态类型加速纯 Python 代码的方法。以下将会介绍三个使用 Cython 加速 Python 应用程序的实战示例。

1 实战一:使用Cython加速计算密集型任务

如何使用 Cython 加速计算密集型任务,下面是一个使用 Cython 编写快速斐波那契数列函数的示例:

  1. 首先创建一个 Python 文件 fib.py,编写如下 Python 代码:
# fib.py
def fib(n):
    a, b = 0, 1
    for i in range(n):
        a, b = b, a + b
    return a
  1. 然后编写 setup.py 文件,以便 Cython 可以将我们的 Python 代码编译成 C 代码:
# setup.py
from setuptools import setup, Extension
from Cython.Build import cythonize

ext_modules = [
    Extension(
        'fibo',
        sources = ['fib.pyx'],
        language = 'c++'
    )
]

setup(
    name = 'Fibonacci',
    ext_modules = cythonize(ext_modules)
)
  1. 现在将 fib.py 转化成 fib.pyx,这是 Cython 的文件扩展名。然后将 fib.pyx 文件编译成 C 代码,再编译成 Python 扩展模块:
# fib.pyx
cpdef int fib(int n):
    cdef int a = 0, b = 1
    cdef int i
    for i in range(n):
        a, b = b, a + b
    return a

使用 Cython 优化后的 fib 函数比原始的 Python 函数快很多,特别是在大型数列中表现更为明显。

2 实战二:使用Cython优化内存使用

Cython 还可以通过避免申请额外的 Python 对象来减少内存使用。在这个示例中将优化字符串拼接的内存使用:

  1. 创建 Python 文件 concat.py,编写如下 Python 代码:
# concat.py
def concat(n):
    res = ''
    for i in range(n):
        res += str(i)
    return res
  1. 然后,将 concat.py 转化成 concat.pyx
# concat.pyx
cpdef bytes concat(int n):
    cdef Py_ssize_t i
    cdef char* res = <char*> malloc((n + 1) * sizeof(char))
    if not res:
        raise MemoryError('Failed to allocate memory')
    try:
        for i in range(n):
            snprintf(res, i + 2, "%s%d", res, i)
        return bytes(res, encoding='utf8')
    finally:
        free(res)

在 Cython 版本的代码中避免了在字符串拼接时创建大量的 Python 字符串对象,这样可以减少内存使用。

3 实战三:使用Cython加速Python与C++混合编程

Cython 不仅仅用于编写 Python 扩展模块也可以将 Python 和 C++ 代码混合在一起,获得两者的优势:

  1. 创建一个名为 logging_example.pyx 的新文件其中将使用 Python 和 C++ 进行混合编程:
# logging_example.pyx

# 导入所需的头文件和函数库
cdef extern from "iostream":
    void cout(const char* str) nogil
cdef extern from "glog/logging.h":
    void InitGoogleLogging(const char* arg) nogil
cdef extern from "glog/logging.h":
    void SetCommandLineOption(const char* str1, const char* str2) nogil
cdef extern from "glog/logging.h":
    void ShutdownGoogleLogging() nogil

cdef void test_logging():
    # 将日志消息输出到控制台
    cout("Hello from C++")

def say_hello():
    # 初始化 Google 日志记录器并设置日志级别
    InitGoogleLogging("example")
    SetCommandLineOption("logtostderr", "true")
    # 调用 C++ 函数
    test_logging()
    # 关闭日志记录器
    ShutdownGoogleLogging()
  1. 然后,在 Python 中导入并运行 logging_example.pyx
# main.py
from logging_example import say_hello

def main():
    say_hello()

if __name__ == '__main__':
    main()

上面的程序将会输出以下信息:Hello from C++

五、应用场景与注意事项

1. 适用场景

  • 在处理大量数据或解决高性能计算任务时,使用 Cython 可以提高 Python 的执行效率。
  • 编写 C 扩展模块以提高 Python 的性能。
  • 要使用 Python 和 C++ 进行混合编程。

2. 注意事项

  • Cython 编译器只支持 Python 2 和 Python 3。
  • 在使用 Cython 编写应用程序时,必须遵循 C 的规则。
  • 在使用 C 的数据类型时,必须在 Cython 中使用 Cdef 关键字。
  • 如果不正确地使用指针和引用,它们可能会导致内存泄漏。
  • 在将 Python 代码转换成 Cython 代码时,必须遵循 Cython 的语法。

3. 常见错误和解决方法

  • "unexpected EOF while parsing" 错误通常表示在编写 Python 代码时,缺失了某个必要语句的结尾,或是使用了没有关闭的括号或引号等。
  • " 'module' has no attribute 'function'" 错误通常表示在调用对应模块的函数时,模块名或函数名写错了。
  • " 'memory allocation failed' " 错误通常是因为程序尝试分配超出了系统可用的内存。要减小内存使用或是考虑使用内存优化方法。

六、小结回顾

1. 优化 Python 性能的重要性

Python 的易用性和可读性是其最大的优势,但在处理大量数据或解决高性能计算任务时,计算速度是至关重要的。通过 Cython,我们可以在不妨碍开发者使用的前提下获得性能提升。

2. 使用 Cython 加速 Python 应用的方法和技巧

  • 将 Python 代码转换成 Cython 代码。
  • 避免申请额外的 Python 对象来减少内存使用。
  • 使用 Cython 将 Python 和 C++ 代码混合在一起,获得两者的优势。

3. 今后的发展趋势

Cython 在未来的 Python 开发中将扮演越来越重要的角色。因为它提供了一种快速、可读性高以及可编写性高的方式来编写 Python 扩展和高性能应用程序。

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