人类疾病度越来越复杂,药物研发却越来越难,目前一款新药从药物发现到临床验证,审批上市累计要花费长达10余年的时间,药物研发高投入、高技术、高风险、长周期的特性,让大量企业都不再单单依托实验发现药物,尝试通过AI、大数据等计算机技术辅助与加速药物研发,泓博医药与深势科技是这条道路上的同行者。
泓博医药是一家快速发展的新药研发服务及原料药生产企业,致力于为全球医药客户提供一站式的小分子药物研发和生产解决方案,公司业务涵盖了药物发现、工艺和药学研究以及原料药生产等领域。药物研发的流程非常复杂,从早期的疾病靶点发现,针对靶点的先导化合物试剂和优化,临床候选药的甄选及后期的工艺开发、放大和商业化生产。
在临床前的化合物设计与优化阶段,泓博医药与深势科技展开了深度合作,利用深势科技的Hermite®药物计算设计平台,对化合物进行了分子级别的动力学仿真,能够以化学精度高效评估蛋白质与配体的结合情况,实现大规模的先导化合物优化筛选,从而提升了药物研发的效率。
分子级别的仿真意味着肉眼不可见的精细,对算力要求极高,计算200纳秒的分子运动就需要30TFLOPS,也就是每秒能进行30万亿次的浮点运算的算力,运行数小时才能模拟出来,而药物研发的工作流程是项目制的,意味着每次需要开出海量算力,计算完就释放掉,这样的需求非常适合采用公共云的弹性高性能算力。
图:泓博医药执行副总裁蔡振伟
泓博医药执行副总裁蔡振伟表示:“深势科技的Hermite®平台加上阿里云高性能计算E-HPC集群,大幅提升了泓博医药分子模拟效率,降低了泓博医药的合成成本,也减少了定制合成的等待时间,大大缩短管线推进到临床候选化合物的时间。”
目前,泓博医药能够在10-15小时内完成一次自由能微扰计算,通常一天内我们可以对数千通量级的候选化合物进行亲和力的准确评估。“针对在云端计算的IP保护,依托阿里云计算巢,泓博医药可以随时审计到深势科技的操作,这样的透明度大大提升了我们的安全感。”泓博医药执行副总裁蔡振伟强调到。
深势科技是“AI for Science”科学研究范式的引领者和践行者,致力于运用人工智能和分子模拟算法,结合先进计算手段求解重要科学问题,为生物医药、能源、材料和信息科学与工程研究,打造新一代微尺度工业设计和仿真平台。
过去,深势科技主要以私有化部署的形式服务泓博医药等企业,把更多的人力放在了产品交付、运维等繁重工作中,造成了比较大的人力负担,也影响了产品创新的效率。基于云的SaaS化交付形式十分便捷,却对用户不透明,导致药企一直想用却又望而却步。
当前,阿里云的云计算巢服务提供的数据安全隔离和审计方案很好地解决了上述问题。通过计算巢,深势科技可以一键自动化完成云上租户的环境创建,云资源成本可以按照租户的需求实现精细化管理,又可以兼顾对用户侧的透明操作;同时,对云资源的使用及操作记录用户都可以看见,还能根据实际情况获得操作权限。
图:深势科技生物医药事业群副总裁范梦奇
“通过阿里云计算巢服务,泓博医药可以无后顾之忧地享受公共云的弹性高性能算力,我们也节省了在交付上的人力,可以更加专注于产品创新。”深势科技生物医药事业群副总裁范梦奇总结到。
目前,深势科技利用阿里云的弹性高性能计算E-HPC集群,结合抢占式实例,以30%的成本实现海量资源的交付,云上弹性高性能计算自动运维的特性,降低了深势科技的运维成本,提升了集群管理效率;同时,深势科技Hermite®药物计算设计平台,基于阿里云计算巢服务,为药企提供了兼顾SaaS灵活性和数据安全性的交付方案,最大化提升了Hermite®在云上的运维效率,还进一步加强了客户对Hermite®的信任感。
未来,阿里云将与深势科技一起为加速药物研发提供更好的平台,共同为生命科学行业的客户提供助力。