阿里云E-HPC+i4p大内存实例,加速寻因生物单细胞数据分析效率

本文涉及的产品
轻量应用服务器 2vCPU 1GiB,适用于搭建电商独立站
轻量应用服务器 2vCPU 4GiB,适用于搭建容器环境
轻量应用服务器 2vCPU 4GiB,适用于搭建Web应用/小程序
简介: 将单细胞测序技术与IT基础设施结合在一起,实现1+1大于2的效果。

视频:阿里云弹性计算加速寻因生物单细胞测序分析


寻因生物是一家专注于单细胞技术的生物科技企业,拥有自主研发的微孔芯片与油包水双技术单细胞捕获平台,致力于通过国产高通量单细胞全链条产品及服务,将单细胞技术普适化应用于临床及药物研发,助力相关疾病研究。

图片1.png


单细胞测序技术呼唤更高计算性能


自单细胞测序技术问世以来,先后被Nature Methods 评为年度技术,被 Nature 评为最值得期待的生物技术之一。相比于传统的检测技术,单细胞技术以细胞为研究单位,用更高的分辨率揭示个体的发育及疾病发生发展的机制。


更高的分辨率就意味着单细胞测序数据分析时需要更高的计算资源(更高的内存占用和CPU占用)。还要求数据分析人员有良好的编程基础、各种软件包的管理能力和较强的数据挖掘能力等,学习成本较高,这就导致了数据分析的通量和能力成为了单细胞技术快速成果转化的瓶颈。


阿里云E-HPC+i4p,加速寻因生物数据分析效率


为了提升数据分析的效率、简化用户操作流程,寻因生物基于千余项目实战经验自主研发出SeekSoul Online单细胞在线生信分析云平台。


该平台部署在阿里云i4p持久内存型实例中,并在实例中使用了Memory Machine大内存软件,不但完全消除磁盘读写带来的I/O瓶颈,还使得数据加载和导出时间从1000秒缩至2.5秒,任务的并发能力提升了5倍以上。同时,搭配的阿里云弹性高性能计算平台(E-HPC),通过统一调度不同规格云服务器,自动在业务高峰时扩容、低谷时释放,避免了资源浪费,有效保证项目周期。

图片2.png


寻因生物生信数据科学家马兴勇表示:“正是在这些技术的加持下,让我们的SeekSoul Online单细胞在线生信分析云平台可以集成多款高耗资源软件,数据库等,通过快速处理大规模单细胞测序数据,实现从单细胞数据质控到下游分析,再到个性化分析,一站式、可交互式单细胞数据分析操作。真正实现了将单细胞测序技术与IT基础设施结合在一起,达到了1+1>2的效果。”


点击这里,了解阿里云高性能计算平台E-HPC。

相关文章
|
4月前
|
存储
阿里云轻量应用服务器收费标准价格表:200Mbps带宽、CPU内存及存储配置详解
阿里云香港轻量应用服务器,200Mbps带宽,免备案,支持多IP及国际线路,月租25元起,年付享8.5折优惠,适用于网站、应用等多种场景。
1527 0
|
6月前
|
存储 缓存 网络协议
阿里云内存型实例规格性能、价格、适用场景与选型指南参考
阿里云服务器ECS(Elastic Compute Service)提供了多样化的内存型实例规格族,专为需要高性能内存资源的应用场景设计。从最新的r8a系列到经过优化的re6p系列,阿里云内存型实例旨在提供稳定、高效且安全的计算环境。这些实例不仅具备强大的计算性能与内存配比,还通过支持ESSD云盘和高效网络协议,显著提升了存储I/O能力和网络带宽,适用于大数据分析、高性能数据库、内存密集型应用等多种场景。本文将详细解析阿里云ECS中的多个内存型实例规格族,包括它们的核心特点、适用场景、实例规格及具体指标数据,为用户在选型时提供参考。
阿里云内存型实例规格性能、价格、适用场景与选型指南参考
|
8月前
|
存储 分布式计算 监控
阿里云服务器实例经济型e、通用算力型u1、计算型c8i、通用型g8i、内存型r8i详解与选择策略
在阿里云现在的活动中,可选的云服务器实例规格主要有经济型e、通用算力型u1、计算型c8i、通用型g8i、内存型r8i实例,虽然阿里云在活动中提供了多种不同规格的云服务器实例,以满足不同用户和应用场景的需求。但是有的用户并不清楚他们的性能如何,应该如何选择。本文将详细介绍阿里云服务器中的经济型e、通用算力型u1、计算型c8i、通用型g8i、内存型r8i实例的性能、适用场景及选择参考,帮助用户根据自身需求做出更加精准的选择。
|
3月前
|
存储 机器学习/深度学习 缓存
阿里云九代云服务器怎么样?计算型c9i、通用型g9i、内存型r9i实例介绍
阿里云第9代云服务器主要实例规格包括计算型c9i、通用型g9i、内存型r9i,本文将为大家介绍阿里云九代云服务器中的计算型c9i、通用型g9i、内存型r9i实例的主要性能特点,并分享最新的活动价格信息,以供参考。
425 1
|
5月前
|
存储 缓存 分布式计算
高内存场景必读!阿里云r7/r9i/r8y/r8i实例架构、性能、价格多维度对比
阿里云针对高性能需求场景,一般会在活动中推出内存型r7、内存型r9i、内存型r8y和内存型r8i这几款内存型实例规格的云服务器。相比于活动内的经济型e和通用算力型u1等实例规格,这些内存型实例在性能上更为强劲,尤其适合对内存和计算能力有较高要求的应用场景。这些实例规格的云服务器在处理器与内存的配比上大多为1:8,但它们在处理器架构、存储性能、网络能力以及安全特性等方面各有千秋,因此适用场景也各不相同。本文将为大家详细介绍内存型r7、r9i、r8y、r8i实例的性能、适用场景的区别以及选择参考。
|
6月前
|
存储 分布式计算 安全
阿里云服务器内存型实例怎么选?r7/r8y/r8i实例性能、适用场景与选择参考
在选择阿里云服务器时,针对内存密集型应用和数据库应用,内存型实例因其高内存配比和优化的性能表现,成为了众多用户的热门选择。在目前阿里云的活动中,内存型实例主要有内存型r7、内存型r8y和内存型r8i实例可选。为了帮助大家更好地了解这三款实例的区别,本文将详细对比它们的实例规格、CPU、内存、计算、存储、网络等方面的性能,并附上活动价格对比,以便用户能够全面了解它们之间的不同,以供选择和参考。
|
5月前
|
存储 缓存 数据挖掘
阿里云服务器实例选购指南:经济型、通用算力型、计算型、通用型、内存型性能与适用场景解析
当我们在通过阿里云的活动页面挑选云服务器时,相同配置的云服务器通常会有多种不同的实例供我们选择,并且它们之间的价格差异较为明显。这是因为不同实例规格所采用的处理器存在差异,其底层架构也各不相同,比如常见的X86计算架构和Arm计算架构。正因如此,不同实例的云服务器在性能表现以及适用场景方面都各有特点。为了帮助大家在众多实例中做出更合适的选择,本文将针对阿里云服务器的经济型、通用算力型、计算型、通用型和内存型实例,介绍它们的性能特性以及对应的使用场景,以供大家参考和选择。
|
8月前
|
运维 监控 数据可视化
使用阿里云操作系统控制台排查内存溢出
操作系统控制台是阿里云最新推出的一款智能运维工具,专为提升运维效率、优化服务器管理而设计。它集成了多种运维管理功能,包括操作系统助手、插件管理器以及其他实用工具,为用户提供一站式的运维解决方案。无论是个人开发者还是企业运维团队,都可以通过这一平台轻松管理服务器和操作系统。
301 18
 使用阿里云操作系统控制台排查内存溢出
|
7月前
|
弹性计算 固态存储 ice
阿里云服务器ECS内存型2核16G、4核32G和8核64G配置实例、费用和性能参数表
本文整理了2025年阿里云服务器租赁价格表,涵盖2核16G、4核32G和8核64G配置收费标准。CPU内存比为1:8,提供多种实例规格如ECS内存型r8i、通用算力型u1等。价格由CPU内存、公网带宽及系统盘组成,支持优惠折扣(年付6.7折起)。文中详细列出各配置参考价格、公网带宽与系统盘收费,并对比不同实例规格性能,如Intel Xeon和AMD EPYC处理器系列,帮助用户选择高性价比方案。具体价格以阿里云官网为准。
1077 4
|
机器学习/深度学习 数据采集 数据可视化
基于爬虫和机器学习的招聘数据分析与可视化系统,python django框架,前端bootstrap,机器学习有八种带有可视化大屏和后台
本文介绍了一个基于Python Django框架和Bootstrap前端技术,集成了机器学习算法和数据可视化的招聘数据分析与可视化系统,该系统通过爬虫技术获取职位信息,并使用多种机器学习模型进行薪资预测、职位匹配和趋势分析,提供了一个直观的可视化大屏和后台管理系统,以优化招聘策略并提升决策质量。
820 4

热门文章

最新文章

相关产品

  • 弹性高性能计算