PyTorch Geometric (PyG) 安装教程

简介: 以下根据PyTorch和对应的cuda版本来写PyG的安装方式。对应可行的安装时间会对应附上。由于我在遇到对应情况时才能撰写对应博文,更多情况看以后我会不会遇上吧。

1. PyTorch 1.11.0


1.1 cudatoolkit 10.2

2022.8.3

我安装PyTorch用的Python3.8,命令是conda install pytorch==1.11.0 torchvision==0.12.0 torchaudio==0.11.0 cudatoolkit=10.2 -c pytorch

这是符合quick start的场景,所以可以直接安装:

image.png

conda install pyg -c pyg


1.2 cudatoolkit 11.3

2022.9.1

PyTorch 1.11.0+cu113(命令是:pip install torch==1.11.0+cu113 torchvision==0.12.0+cu113 torchaudio==0.11.0 --extra-index-url https://download.pytorch.org/whl/cu113

pip install torch-scatter -f https://data.pyg.org/whl/torch-1.11.0+cu113.html
pip install torch-sparse -f https://data.pyg.org/whl/torch-1.11.0+cu113.html
pip install torch-geometric


2. main/nightly版本


2022.8.10

我是因为这个:After T.ToUndirected, the data.is_undirected() is still False · Discussion #5174 · pyg-team/pytorch_geometric 所以需要下main/nightly版本的。

官方GitHub README文件中的安装部分:https://github.com/pyg-team/pytorch_geometric#installation

(先把之前下过的PyG给conda uninstall了)

pip install torch-scatter -f https://data.pyg.org/whl/torch-1.11.0+cu102.html
pip install torch-sparse -f https://data.pyg.org/whl/torch-1.11.0+cu102.html
pip install pyg-nightly


(请自行替换torch和cuda的版本)


3. 测试安装效果


import torch
from torch_geometric.data import Data
edge_index = torch.tensor([[0, 1, 1, 2],
                           [1, 0, 2, 1]], dtype=torch.long)
x = torch.tensor([[-1], [0], [1]], dtype=torch.float)
data = Data(x=x, edge_index=edge_index)
print(data)


输出:

my_env/lib/python3.8/site-packages/scipy/__init__.py:146: UserWarning: A NumPy version >=1.16.5 and <1.23.0 is required for this version of SciPy (detected version 1.23.1
  warnings.warn(f"A NumPy version >={np_minversion} and <{np_maxversion}"
Data(x=[3, 1], edge_index=[2, 4])


可以看到这里scipy和numpy的版本不合。但是这样我也没有办法!

相关文章
|
缓存 PyTorch 数据处理
基于Pytorch的PyTorch Geometric(PYG)库构造个人数据集
基于Pytorch的PyTorch Geometric(PYG)库构造个人数据集
931 0
基于Pytorch的PyTorch Geometric(PYG)库构造个人数据集
|
5月前
|
PyTorch 算法框架/工具 Python
pytorch安装教程
pytorch安装教程
132 0
|
机器学习/深度学习 并行计算 PyTorch
PyTorch安装教程
PyTorch是学习深度学习时常用的Python神经网络框架,本文将介绍其部分版本的安装方式。Windows和Linux通用。 作者使用anaconda作为管理虚拟环境的工具。以下工作都在虚拟环境中进行,对Python和Aanaconda的安装及对虚拟环境的管理本文不作赘述,后期可能会撰写相关的博文。
PyTorch安装教程
|
5月前
|
机器学习/深度学习 JSON PyTorch
图神经网络入门示例:使用PyTorch Geometric 进行节点分类
本文介绍了如何使用PyTorch处理同构图数据进行节点分类。首先,数据集来自Facebook Large Page-Page Network,包含22,470个页面,分为四类,具有不同大小的特征向量。为训练神经网络,需创建PyTorch Data对象,涉及读取CSV和JSON文件,处理不一致的特征向量大小并进行归一化。接着,加载边数据以构建图。通过`Data`对象创建同构图,之后数据被分为70%训练集和30%测试集。训练了两种模型:MLP和GCN。GCN在测试集上实现了80%的准确率,优于MLP的46%,展示了利用图信息的优势。
82 1
|
机器学习/深度学习 存储 PyTorch
使用Pytorch Geometric 进行链接预测代码示例
PyTorch Geometric (PyG)是构建图神经网络模型和实验各种图卷积的主要工具。在本文中我们将通过链接预测来对其进行介绍。
58 0
|
5月前
|
PyTorch 算法框架/工具
使用Pytorch Geometric 进行链接预测代码示例
该代码示例使用PyTorch和`torch_geometric`库实现了一个简单的图卷积网络(GCN)模型,处理Cora数据集。模型包含两层GCNConv,每层后跟ReLU激活和dropout。模型在训练集上进行200轮训练,使用Adam优化器和交叉熵损失函数。最后,计算并打印测试集的准确性。
103 6
|
机器学习/深度学习 数据可视化 数据挖掘
PyTorch Geometric (PyG) 入门教程
PyTorch Geometric是PyTorch1的几何图形学深度学习扩展库。本文旨在通过介绍PyTorch Geometric(PyG)中常用的方法等内容,为新手提供一个PyG的入门教程。
PyTorch Geometric (PyG) 入门教程
|
PyTorch 算法框架/工具
进行链接预测代码示例使用Pytorch Geometric
使用Pytorch Geometric 进行链接预测代码示例
51 0
|
PyTorch 算法框架/工具
PyG (PyTorch Geometric) Dropbox系图数据集无法下载的解决方案(AMiner, DBLP, IMDB, LastFM)(持续更新ing...)
本文主要关注PyG官方提供的数据集中,因为数据下载源是Dropbox,所以不能直接下载的解决方案。
|
数据采集 PyTorch 算法框架/工具
使用PyG (PyTorch Geometric) 实现同质图transductive链路预测任务
使用PyG (PyTorch Geometric) 实现同质图transductive链路预测任务