NumPy 秘籍中文第二版:二、高级索引和数组概念

简介: NumPy 秘籍中文第二版:二、高级索引和数组概念

在本章中,我们将介绍以下秘籍:

  • 安装 SciPy
  • 安装 PIL
  • 调整图像大小
  • 比较视图和副本
  • 翻转 Lena
  • 花式索引
  • 位置列表索引
  • 布尔值索引
  • 数独的步幅技巧
  • 广播数组

简介

NumPy 以其高效的数组而闻名。 之所以成名,部分原因是索引容易。 我们将演示使用图像的高级索引技巧。 在深入研究索引之前,我们将安装必要的软件 – SciPy 和 PIL。 如果您认为有此需要,请参阅第 1 章“使用 IPython”的“安装 matplotlib”秘籍。

在本章和其他章中,我们将使用以下导入:

import numpy as np 
import matplotlib.pyplot as plt
import scipy

我们还将尽可能为print() Python 函数使用最新的语法。

注意

Python2 是仍然很流行的主要 Python 版本,但与 Python3 不兼容。Python2 直到 2020 年才正式失去支持。主要区别之一是print()函数的语法。 本书使用的代码尽可能与 Python2 和 Python3 兼容。

本章中的一些示例涉及图像处理。 为此,我们将需要 Python 图像库PIL),但不要担心; 必要时会在本章中提供帮助您安装 PIL 和其他必要 Python 软件的说明和指示。

安装 SciPy

SciPy 是科学的 Python 库,与 NumPy 密切相关。 实际上,SciPy 和 NumPy 在很多年前曾经是同一项目。 就像 NumPy 一样,SciPy 是一个开放源代码项目,已获得 BSD 许可。 在此秘籍中,我们将安装 SciPy。 SciPy 提供高级功能,包括统计,信号处理,线性代数,优化,FFT,ODE 求解器,插值,特殊功能和积分。 NumPy 有一些重叠,但是 NumPy 主要提供数组功能。

准备

在第 1 章,“使用 IPython”中,我们讨论了如何安装setuptoolspip。 如有必要,请重新阅读秘籍。

操作步骤

在此秘籍中,我们将完成安装 SciPy 的步骤:

  • 从源安装:如果已安装 Git,则可以使用以下命令克隆 SciPy 存储库:
$ git clone https://github.com/scipy/scipy.git
$ python setup.py build
$ python setup.py install --user
  • 这会将 SciPy 安装到您的主目录。 它需要 Python 2.6 或更高版本。在构建之前,您还需要安装 SciPy 依赖的以下包:
  • BLASLAPACK
  • C 和 Fortran 编译器
  • 您可能已经在 NumPy 安装过程中安装了此软件。
  • 在 Linux 上安装 SciPy:大多数 Linux 发行版都包含 SciPy 包。 我们将遵循一些流行的 Linux 发行版中的必要步骤(您可能需要以 root 用户身份登录或具有sudo权限):
  • 为了在 RedHat,Fedora 和 CentOS 上安装 SciPy,请从命令行运行以下指令:
$ yum install python-scipy
  • 为了在 Mandriva 上安装 SciPy,请运行以下命令行指令:
$ urpmi python-scipy
  • 为了在 Gentoo 上安装 SciPy,请运行以下命令行指令:
$ sudo emerge scipy
  • 在 Debian 或 Ubuntu 上,我们需要输入以下指令:
$ sudo apt-get install python-scipy
  • 在 MacOSX 上安装 SciPy:需要 Apple Developer Tools(XCode),因为它包含BLASLAPACK库。 可以在 App Store 或 Mac 随附的安装 DVD 中找到它。 或者您可以从 Apple Developer 的连接网站获取最新版本。 确保已安装所有内容,包括所有可选包。
    您可能已经为 NumPy 安装了 Fortran 编译器。 gfortran的二进制文件可以在这个链接中找到。
  • 使用easy_installpip安装 SciPy:您可以使用以下两个命令中的任何一个来安装 SciPy(sudo的需要取决于权限):
$ [sudo] pip install scipy
$ [sudo] easy_install scipy
```**
  • 在 Windows 上安装:如果已经安装 Python,则首选方法是下载并使用二进制发行版。 或者,您可以安装 Anaconda 或 Enthought Python 发行版,该发行版与其他科学 Python 包一起提供。
  • 检查安装:使用以下代码检查 SciPy 安装:
import scipy
print(scipy.__version__)
print(scipy.__file__)
  • 这应该打印正确的 SciPy 版本。

工作原理

大多数包管理器都会为您解决依赖项(如果有)。 但是,在某些情况下,您需要手动安装它们。 这超出了本书的范围。

另见

如果遇到问题,可以在以下位置寻求帮助:

安装 PIL

PIL(Python 图像库)是本章中进行图像处理的先决条件。 如果愿意,可以安装 Pillow,它是 PIL 的分支。 有些人喜欢 Pillow API; 但是,我们不会在本书中介绍其安装。

操作步骤

让我们看看如何安装 PIL:

$ sudo apt-get install python-imaging
  • 使用easy_installpip安装:在编写本书时,似乎 RedHat,Fedora 和 CentOS 的包管理器没有对 PIL 的直接支持。 因此,如果您使用的是这些 Linux 发行版之一,请执行此步骤。
    使用以下任一命令安装 :
$ easy_install PIL
$ sudo pip install PIL

另见

  • 可在这里 找到有关 PILLOW(PIL 的分支)的说明。

调整图像大小

在此秘籍中,我们将把 Lena 的样例图像(在 SciPy 发行版中可用)加载到数组中。 顺便说一下,本章不是关于图像操作的。 我们将只使用图像数据作为输入。

注意

Lena Soderberg 出现在 1972 年的《花花公子》杂志中。 由于历史原因,这些图像之一经常用于图像处理领域。 不用担心,该图像完全可以安全工作。

我们将使用repeat()函数调整图像大小。 此函数重复一个数组,这意味着在我们的用例中按一定的大小调整图像大小。

准备

此秘籍的前提条件是必须安装 SciPy,matplotlib 和 PIL。 看看本章和第 1 章,“使用 IPython”的相应秘籍。

操作步骤

通过以下步骤调整图像大小:

  1. 首先,导入SciPy。 SciPy 具有lena()函数。 它用于将图像加载到 NumPy 数组中:
lena = scipy.misc.lena()
  1. 从 0.10 版本开始发生了一些重构,因此,如果您使用的是旧版本,则正确的代码如下:
lena = scipy.lena()
  1. 使用numpy.testing包中的assert_equal()函数检查 Lena 数组的形状-这是可选的完整性检查测试:
np.testing.assert_equal((LENA_X, LENA_Y), lena.shape)
  1. 使用repeat()函数调整 Lena 数组的大小。 我们在xy方向上给此函数一个调整大小的因子:
resized = lena.repeat(yfactor, axis=0).repeat(xfactor, axis=1)
  1. 我们将在同一网格的两个子图中绘制 Lena 图像和调整大小后的图像。 使用以下代码在子图中绘制 Lena 数组:
plt.subplot(211)
plt.title("Lena")
plt.axis("off")
plt.imshow(lena)
  1. matplotlib subplot()函数创建一个子图。 此函数接受一个三位整数作为参数,其中第一位是行数,第二位是列数,最后一位是子图的索引,从 1 开始。imshow()函数显示图像。 最后,show()函数显示最终结果。
    将调整大小后的数组绘制在另一个子图中并显示它。 索引现在为 2:
plt.subplot(212)
plt.title("Resized")
plt.axis("off")
plt.imshow(resized)
plt.show()
  1. 以下屏幕截图显示了结果,以及原始图像(第一幅)和调整大小后的图像(第二幅):

    以下是本书代码包中resize_lena.py文件中该秘籍的完整代码:
import scipy.misc
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np
# This script resizes the Lena image from Scipy.
# Loads the Lena image into an array
lena = scipy.misc.lena()
#Lena's dimensions
LENA_X = 512
LENA_Y = 512
#Check the shape of the Lena array
np.testing.assert_equal((LENA_X, LENA_Y), lena.shape)
# Set the resize factors
yfactor = 2
xfactor = 3
# Resize the Lena array
resized = lena.repeat(yfactor, axis=0).repeat(xfactor, axis=1)
#Check the shape of the resized array
np.testing.assert_equal((yfactor * LENA_Y, xfactor * LENA_Y), resized.shape)
# Plot the Lena array
plt.subplot(211)
plt.title("Lena")
plt.axis("off")
plt.imshow(lena)
#Plot the resized array
plt.subplot(212)
plt.title("Resized")
plt.axis("off")
plt.imshow(resized)
plt.show()

工作原理

repeat()函数重复数组,在这种情况下,这会导致原始图像的大小改变。 subplot() matplotlib 函数创建一个子图。 imshow()函数显示图像。 最后,show()函数显示最终结果。

另见

  • 第 1 章“使用 IPython”中的“安装 matplotlib”
  • 本章中的“安装 SciPy”
  • 本章中的“安装 PIL”
  • 这个页面中介绍了repeat()函数。

创建视图和副本

了解何时处理共享数组视图以及何时具有数组数据的副本,这一点很重要。 例如,切片将创建一个视图。 这意味着,如果您将切片分配给变量,然后更改基础数组,则此变量的值将更改。 我们将根据著名的 Lena 图像创建一个数组,复制该数组,创建一个视图,最后修改视图。

准备

前提条件与先前的秘籍相同。

操作步骤

让我们创建 Lena 数组的副本和视图:

  1. 创建 Lena 数组的副本:
acopy = lena.copy()
  1. 创建数组的视图:
aview = lena.view()
  1. 使用flat迭代器将视图的所有值设置为0
aview.flat = 0
  1. 最终结果是只有一个图像(与副本相关的图像)显示了花花公子模型。 其他图像完全消失:

    以下是本教程的代码,显示了本书代码包中copy_view.py文件中数组视图和副本的行为:
import scipy.misc
import matplotlib.pyplot as plt
lena = scipy.misc.lena()
acopy = lena.copy()
aview = lena.view()
# Plot the Lena array
plt.subplot(221)
plt.imshow(lena)
#Plot the copy
plt.subplot(222)
plt.imshow(acopy)
#Plot the view
plt.subplot(223)
plt.imshow(aview)
# Plot the view after changes
aview.flat = 0
plt.subplot(224)
plt.imshow(aview)
plt.show()

工作原理

如您所见,通过在程序结尾处更改视图,我们更改了原始 Lena 数组。 这样就产生了三张蓝色(如果您正在查看黑白图像,则为空白)图像-复制的数组不受影响。 重要的是要记住,视图不是只读的。

另见

  • NumPy view()函数的文档位于这里

翻转 Lena

我们将翻转 SciPy Lena 图像-当然,所有这些都是以科学的名义,或者至少是作为演示。 除了翻转图像,我们还将对其进行切片并对其应用遮罩。

操作步骤

步骤如下:

  1. 使用以下代码围绕垂直轴翻转 Lena 数组:
plt.imshow(lena[:,::-1])
  1. 从图像中切出一部分并将其绘制出来。 在这一步中,我们将看一下 Lena 数组的形状。 该形状是表示数组大小的元组。 以下代码有效地选择了花花公子图片的左上象限:
plt.imshow(lena[:lena.shape[0]/2,:lena.shape[1]/2])
  1. 通过在 Lena 数组中找到所有偶数的值,对图像应用遮罩(这对于演示目的来说是任意的)。 复制数组并将偶数值更改为 0。 这样会在图像上放置很多蓝点(如果您正在查看黑白图像,则会出现暗点):
mask = lena % 2 == 0
masked_lena = lena.copy()
masked_lena[mask] = 0
  1. 所有这些工作都会产生2 x 2的图像网格,如以下屏幕截图所示:

    这是本书代码包中flip_lena.py文件中此秘籍的完整代码:
import scipy.misc
import matplotlib.pyplot as plt
# Load the Lena array
lena = scipy.misc.lena()
# Plot the Lena array
plt.subplot(221)
plt.title('Original')
plt.axis('off')
plt.imshow(lena)
#Plot the flipped array
plt.subplot(222)
plt.title('Flipped')
plt.axis('off')
plt.imshow(lena[:,::-1])
#Plot a slice array
plt.subplot(223)
plt.title('Sliced')
plt.axis('off')
plt.imshow(lena[:lena.shape[0]/2,:lena.shape[1]/2])
# Apply a mask
mask = lena % 2 == 0
masked_lena = lena.copy()
masked_lena[mask] = 0
plt.subplot(224)
plt.title('Masked')
plt.axis('off')
plt.imshow(masked_lena)
plt.show()

另见

  • 第 1 章“使用 IPython”中的“安装 matplotlib”
  • 本章中的“安装 SciPy”
  • 本章中的“安装 PIL”

花式索引

在本教程中,我们将应用花式索引将 Lena 图像的对角线值设置为 0。这将沿着对角线绘制黑线并交叉,这不是因为图像有问题,而仅仅作为练习。 花式索引是不涉及整数或切片的索引; 这是正常的索引编制。

操作步骤

我们将从第一个对角线开始:

  1. 将第一个对角线的值设置为0
    要将对角线值设置为0,我们需要为xy值定义两个不同的范围:
lena[range(xmax), range(ymax)] = 0
  1. 将另一个对角线的值设置为0
    要设置另一个对角线的值,我们需要一组不同的范围,但是原理保持不变:
lena[range(xmax-1,-1,-1), range(ymax)] = 0
  1. 最后,我们得到带有对角线标记的图像,如以下屏幕截图所示:

    以下是本书代码集中fancy.py文件中该秘籍的完整代码:
import scipy.misc
import matplotlib.pyplot as plt
# This script demonstrates fancy indexing by setting values
# on the diagonals to 0.
# Load the Lena array
lena = scipy.misc.lena()
xmax = lena.shape[0]
ymax = lena.shape[1]
# Fancy indexing
# Set values on diagonal to 0
# x 0-xmax
# y 0-ymax
lena[range(xmax), range(ymax)] = 0
# Set values on other diagonal to 0
# x xmax-0
# y 0-ymax
lena[range(xmax-1,-1,-1), range(ymax)] = 0
# Plot Lena with diagonal lines set to 0
plt.imshow(lena)
plt.show()

工作原理

我们为x值和y值定义了单独的范围。 这些范围用于索引 Lena 数组。 花式索引是基于内部 NumPy 迭代器对象执行的。 执行以下步骤:

  1. 创建迭代器对象。
  2. 迭代器对象绑定到数组。
  3. 数组元素通过迭代器访问。

另见

位置列表索引

让我们使用ix_()函数来随机播放 Lena 图像。 此函数根据多个序列创建网格。

操作步骤

我们将从随机改组数组索引开始:

  1. 使用numpy.random模块的shuffle()函数创建随机索引数组:
def shuffle_indices(size):
   arr = np.arange(size)
   np.random.shuffle(arr)
   return arr
  1. 绘制乱序的索引:
plt.imshow(lena[np.ix_(xindices, yindices)])
  1. 我们得到的是一张完全打乱的 Lena 图像,如以下屏幕截图所示:

    这是本书代码包中ix.py文件中秘籍的完整代码:
import scipy.misc
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np
# Load the Lena array
lena = scipy.misc.lena()
xmax = lena.shape[0]
ymax = lena.shape[1]
def shuffle_indices(size):
   '''
   Shuffles an array with values 0 - size
   '''
   arr = np.arange(size)
   np.random.shuffle(arr)
   return arr
xindices = shuffle_indices(xmax)
np.testing.assert_equal(len(xindices), xmax)
yindices = shuffle_indices(ymax)
np.testing.assert_equal(len(yindices), ymax)
# Plot Lena
plt.imshow(lena[np.ix_(xindices, yindices)])
plt.show()

另见

布尔值索引

布尔索引是基于布尔数组的索引 ,属于奇特索引的类别。

操作步骤

我们将这种索引技术应用于图像:

  1. 在对角线上带有点的图像。
    这在某种程度上类似于本章中的“花式索引”秘籍。 这次,我们在图像的对角线上选择模4
def get_indices(size):
   arr = np.arange(size)
   return arr % 4 == 0
  1. 然后,我们只需应用此选择并绘制点:
lena1 = lena.copy() 
xindices = get_indices(lena.shape[0])
yindices = get_indices(lena.shape[1])
lena1[xindices, yindices] = 0
plt.subplot(211)
plt.imshow(lena1)
  1. 在最大值的四分之一到四分之三之间选择数组值,并将它们设置为0
lena2[(lena > lena.max()/4) & (lena < 3 * lena.max()/4)] = 0
  1. 带有两个新图像的图看起来类似于以下屏幕截图所示:

    这是本书代码包中boolean_indexing.py文件中该秘籍的完整代码:
import scipy.misc
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np
# Load the Lena array
lena = scipy.misc.lena()
def get_indices(size):
   arr = np.arange(size)
   return arr % 4 == 0
# Plot Lena
lena1 = lena.copy() 
xindices = get_indices(lena.shape[0])
yindices = get_indices(lena.shape[1])
lena1[xindices, yindices] = 0
plt.subplot(211)
plt.imshow(lena1)
lena2 = lena.copy() 
# Between quarter and 3 quarters of the max value
lena2[(lena > lena.max()/4) & (lena < 3 * lena.max()/4)] = 0
plt.subplot(212)
plt.imshow(lena2)
plt.show()

工作原理

由于布尔值索引是一种花式索引,因此它的工作方式基本相同。 这意味着索引是在特殊的迭代器对象的帮助下发生的。

另见

  • “花式索引”

数独的步幅技巧

ndarray 类具有strides字段,它是一个元组,指示通过数组时要在每个维中步进的字节数。 让我们对将数独谜题拆分为3 x 3正方形的问题应用一些大步技巧。

注意

对数独的规则进行解释超出了本书的范围。 简而言之,数独谜题由3 x 3的正方形组成。 这些正方形均包含九个数字。 有关更多信息,请参见这里

操作步骤

应用如下的跨步技巧:

  1. 让我们定义sudoku数组。 此数组充满了一个实际的已解决的数独难题的内容:
sudoku = np.array([
    [2, 8, 7, 1, 6, 5, 9, 4, 3],
    [9, 5, 4, 7, 3, 2, 1, 6, 8],
    [6, 1, 3, 8, 4, 9, 7, 5, 2],
    [8, 7, 9, 6, 5, 1, 2, 3, 4],
    [4, 2, 1, 3, 9, 8, 6, 7, 5],
    [3, 6, 5, 4, 2, 7, 8, 9, 1],
    [1, 9, 8, 5, 7, 3, 4, 2, 6],
    [5, 4, 2, 9, 1, 6, 3, 8, 7],
    [7, 3, 6, 2, 8, 4, 5, 1, 9]
    ])
  1. ndarrayitemsize字段为我们提供了数组中的字节数。 给定itemsize,请计算步幅:
strides = sudoku.itemsize * np.array([27, 3, 9, 1])
  1. 现在我们可以使用np.lib.stride_tricks模块的as_strided()函数将拼图分解成正方形:
squares = np.lib.stride_tricks.as_strided(sudoku, shape=shape, strides=strides)
print(squares)
  1. 该代码打印单独的数独正方形,如下所示:
[[[[2 8 7]
    [9 5 4]
    [6 1 3]]
  [[1 6 5]
    [7 3 2]
    [8 4 9]]
  [[9 4 3]
    [1 6 8]
    [7 5 2]]]
 [[[8 7 9]
    [4 2 1]
    [3 6 5]]
  [[6 5 1]
    [3 9 8]
    [4 2 7]]
  [[2 3 4]
    [6 7 5]
    [8 9 1]]]
 [[[1 9 8]
    [5 4 2]
    [7 3 6]]
  [[5 7 3]
    [9 1 6]
    [2 8 4]]
  [[4 2 6]
    [3 8 7]
    [5 1 9]]]]
  1. 以下是本书代码包中strides.py文件中此秘籍的完整源代码:
import numpy as np
sudoku = np.array([
   [2, 8, 7, 1, 6, 5, 9, 4, 3],
   [9, 5, 4, 7, 3, 2, 1, 6, 8],
   [6, 1, 3, 8, 4, 9, 7, 5, 2],
   [8, 7, 9, 6, 5, 1, 2, 3, 4],
   [4, 2, 1, 3, 9, 8, 6, 7, 5],
   [3, 6, 5, 4, 2, 7, 8, 9, 1],
   [1, 9, 8, 5, 7, 3, 4, 2, 6],
   [5, 4, 2, 9, 1, 6, 3, 8, 7],
   [7, 3, 6, 2, 8, 4, 5, 1, 9]
   ])
shape = (3, 3, 3, 3)
strides = sudoku.itemsize * np.array([27, 3, 9, 1])
squares = np.lib.stride_tricks.as_strided(sudoku, shape=shape, strides=strides)
print(squares)

工作原理

我们应用了跨步技巧,将数独谜题拆分为3 x 3的正方形。 步幅告诉我们通过数独数组时每一步需要跳过的字节数。

另见

  • strides属性的文档在这里

广播数组

在不知道的情况下,您可能已经广播了数组。 简而言之,即使操作数的形状不同,NumPy 也会尝试执行操作。 在此秘籍中,我们将一个数组和一个标量相乘。 标量被扩展为数组操作数的形状,然后执行乘法。 我们将下载一个音频文件并制作一个更安静的新版本。

操作步骤

让我们从读取 WAV 文件开始:

  1. 我们将使用标准的 Python 代码下载 Austin Powers 的音频文件。 SciPy 具有 WAV 文件模块,可让您加载声音数据或生成 WAV 文件。 如果已安装 SciPy,则我们应该已经有此模块。 read()函数返回data数组和采样率。 在此示例中,我们仅关心数据:
sample_rate, data = scipy.io.wavfile.read(WAV_FILE)
  1. 使用 matplotlib 绘制原始 WAV 数据。 将子图命名为Original
plt.subplot(2, 1, 1)
plt.title("Original")
plt.plot(data)
  1. 现在,我们将使用 NumPy 制作更安静的音频样本。 这只是通过与常量相乘来创建具有较小值的新数组的问题。 这就是广播魔术发生的地方。 最后,由于 WAV 格式,我们需要确保与原始数组具有相同的数据类型:
newdata = data * 0.2
newdata = newdata.astype(np.uint8)
  1. 可以将新数组写入新的 WAV 文件,如下所示:
scipy.io.wavfile.write("quiet.wav",
    sample_rate, newdata)
  1. 使用 matplotlib 绘制新数据数组:
plt.subplot(2, 1, 2)
plt.title("Quiet")
plt.plot(newdata)
plt.show()
  1. 结果是原始 WAV 文件数据和具有较小值的新数组的图,如以下屏幕快照所示:

    这是本书代码包中broadcasting.py文件中该秘籍的完整代码:
import scipy.io.wavfile
import matplotlib.pyplot as plt
import urllib2
import numpy as np
# Download audio file
response = urllib2.urlopen('http://www.thesoundarchive.com/austinpowers/smashingbaby.wav')
print(response.info())
WAV_FILE = 'smashingbaby.wav'
filehandle = open(WAV_FILE, 'w')
filehandle.write(response.read())
filehandle.close()
sample_rate, data = scipy.io.wavfile.read(WAV_FILE)
print("Data type", data.dtype, "Shape", data.shape)
# Plot values original audio
plt.subplot(2, 1, 1)
plt.title("Original")
plt.plot(data)
# Create quieter audio
newdata = data * 0.2
newdata = newdata.astype(np.uint8)
print("Data type", newdata.dtype, "Shape", newdata.shape)
# Save quieter audio file
scipy.io.wavfile.write("quiet.wav",
    sample_rate, newdata)
# Plot values quieter file
plt.subplot(2, 1, 2)
plt.title("Quiet")
plt.plot(newdata)
plt.show()

另见

以下链接提供了更多背景信息:

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