Python秒开100G数据是怎么办到的?

简介: Python秒开100G数据是怎么办到的?

Python秒开100G数据是怎么办到的?

在这个数据爆炸的时代,我们通常要对海量的数据进行分析,少则几十G,多则上百G,对于这样的数据我们打开都很困难,又该如何分析呢?通常都会采取下面几个方案:

  • 对数据抽样;
  • 使用分布式计算;
  • 使用强大的服务器。

本文让我们来了解一个低成本又速度快的方法,使用一个强大的Python库-vaex来实现海量数据的读取和操作。

在这里插入图片描述

Vaex是一个开源的DataFrame库,它可以对表格数据集进行可视化、探索、分析,甚至机器学习,这些数据集和你的硬盘驱动器一样大。它可以在一个n维网格上每秒计算超过10亿(10^9)个对象的平均值、和、计数、标准差等统计信息。可视化使用直方图、使用直方图、密度图和3D立体渲染进行可视化。为此,Vaex采用了内存映射、高效的外核算法和延迟计算等概念来获得最佳性能(不浪费内存)。所有这些都封装在一个类似Pandas的API中。

安装vaex

vaex的安装方式和其他的库没有什么不同,我们直接pip安装即可,安装的时候会一并安装很多关联的库,所以推荐使用国内的镜像进行安装。

pip install -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple vaex

使用vaex

在使用之前我们先来看一下官方给出的读取100G数据时的效率。

在这里插入图片描述

根据上图可以看到打开了一个107G的数据用了52毫秒,下面让我们用一个小一些的样本来检验一下。

把CSV数据转换成hdf5

在vaex中提供了把csv数据转换成hdf5(内存可映射文件格式)数据的方式,内存可映射格式后,即使在磁盘上的大小超过100GB,也可以使用Vaex即时打开。

df = vaex.open('Data_Action_201602.csv')
df.export_hdf5('Data_Action_201602.hdf5')

先来看一下我要使用的数据大小:

!ls -l -h Data_Action_201602.hdf5
-rw-r--r--  1 seven  staff   778M  7 16 14:31 Data_Action_201602.hdf5

使用vaex

从上面的信息可以看到,数据的大小有778M,我们如果用pandas打开该数据的话估计也需要很久的时间,下面让我们来尝试一下使用vaex。

博主电脑配置:2018MacPro+六核Intel Core i7+16G RAM。

%%time
df = vaex.open('Data_Action_201602.hdf5')
CPU times: user 5.06 ms, sys: 1.54 ms, total: 6.6 ms
Wall time: 15.7 ms

可以看到,我们耗时15.7毫秒,在一瞬间就完成了打开文件的操作,下面再进行一个快速检查数据的操作:

%%time
df

在这里插入图片描述

根据结果可以看出,阅览数据的时候仅仅用了4微秒,这有多快我就不必多说了吧~

再让我们使用describe方法获得 DataFrame 的高级概览来看一下。

%%time
df.describe()

在这里插入图片描述

可以看到1000万条的数据的计算时间还不到1秒,的确是快到飞起。

vaex的简便操作

光从简单的数据操作上还不足以让我们想要使用vaex,下面来简单介绍几种之前让我们头疼的想法,看一下vaex是怎么实现的。

在使用pandas的时候,我们很难直接对两列中所有的数据进行运算操作,但是vaex重新封装了这些操作,使得这种运算是完全可行的:

df['new_data'] = (df.type + df.cate)*100
df.new_data.values
array([ 900, 1400,  900, ..., 1400, 1400, 1400])

筛选数据:

df.select(df.new_data<1000)
df.evaluate(df.new_data, selection=True)
array([900, 900, 600, ..., 800, 800, 500])

统计学计算:

df.count(), df.mean(df.new_data), df.mean(df.new_data, selection=True)
(array(11485424), array(1027.95480602), array(701.08164584))

除了这些,vaex还提供了很多简单的函数功能,同时该数据也可以直接用于图表的绘制,具体可以参考文末给出的操作文档。

为什么要选择vaex

看完了vaex的一些简单操作,下面再来看一下为什么要选择vaex:

  • 性能:处理海量表格数据,每秒处理超过十亿行
  • 虚拟列:动态计算,不浪费内存
  • 高效的内存在执行过滤/选择/子集时没有内存副本。
  • 可视化:直接支持,单线通常就足够了。
  • 用户友好的API:只需处理一个数据集对象,制表符补全和docstring可以帮助你:ds.mean,类似于Pandas。
  • 精益:分成多个包
  • Jupyter集成:vaex-jupyter将在Jupyter笔记本和Jupyter实验室中提供交互式可视化和选择。

vaex的相关网站

Vaex 官方网站:https://vaex.io/

文档:https://docs.vaex.io/

GitHub:https : //github.com/vaexio/vaex

PyPi:https://pypi.python.org/pypi/vaex/

相关文章
|
2月前
|
数据采集 Web App开发 数据可视化
Python零基础爬取东方财富网股票行情数据指南
东方财富网数据稳定、反爬宽松,适合爬虫入门。本文详解使用Python抓取股票行情数据,涵盖请求发送、HTML解析、动态加载处理、代理IP切换及数据可视化,助你快速掌握金融数据爬取技能。
1299 1
|
2月前
|
Java 数据挖掘 数据处理
(Pandas)Python做数据处理必选框架之一!(一):介绍Pandas中的两个数据结构;刨析Series:如何访问数据;数据去重、取众数、总和、标准差、方差、平均值等;判断缺失值、获取索引...
Pandas 是一个开源的数据分析和数据处理库,它是基于 Python 编程语言的。 Pandas 提供了易于使用的数据结构和数据分析工具,特别适用于处理结构化数据,如表格型数据(类似于Excel表格)。 Pandas 是数据科学和分析领域中常用的工具之一,它使得用户能够轻松地从各种数据源中导入数据,并对数据进行高效的操作和分析。 Pandas 主要引入了两种新的数据结构:Series 和 DataFrame。
422 0
|
2月前
|
JSON 算法 API
Python采集淘宝商品评论API接口及JSON数据返回全程指南
Python采集淘宝商品评论API接口及JSON数据返回全程指南
|
2月前
|
JSON API 数据安全/隐私保护
Python采集淘宝拍立淘按图搜索API接口及JSON数据返回全流程指南
通过以上流程,可实现淘宝拍立淘按图搜索的完整调用链路,并获取结构化的JSON商品数据,支撑电商比价、智能推荐等业务场景。
|
3月前
|
数据采集 关系型数据库 MySQL
python爬取数据存入数据库
Python爬虫结合Scrapy与SQLAlchemy,实现高效数据采集并存入MySQL/PostgreSQL/SQLite。通过ORM映射、连接池优化与批量提交,支持百万级数据高速写入,具备良好的可扩展性与稳定性。
|
3月前
|
JSON API 数据安全/隐私保护
Python采集淘宝评论API接口及JSON数据返回全流程指南
Python采集淘宝评论API接口及JSON数据返回全流程指南
|
3月前
|
数据采集 数据可视化 关系型数据库
基于python大数据的电影数据可视化分析系统
电影分析与可视化平台顺应电影产业数字化趋势,整合大数据处理、人工智能与Web技术,实现电影数据的采集、分析与可视化展示。平台支持票房、评分、观众行为等多维度分析,助力行业洞察与决策,同时提供互动界面,增强观众对电影文化的理解。技术上依托Python、MySQL、Flask、HTML等构建,融合数据采集与AI分析,提升电影行业的数据应用能力。
|
数据采集 存储 数据挖掘
Python数据分析:Pandas库的高效数据处理技巧
【10月更文挑战第27天】在数据分析领域,Python的Pandas库因其强大的数据处理能力而备受青睐。本文介绍了Pandas在数据导入、清洗、转换、聚合、时间序列分析和数据合并等方面的高效技巧,帮助数据分析师快速处理复杂数据集,提高工作效率。
355 0
|
机器学习/深度学习 数据采集 数据挖掘
解锁 Python 数据分析新境界:Pandas 与 NumPy 高级技巧深度剖析
Pandas 和 NumPy 是 Python 中不可或缺的数据处理和分析工具。本文通过实际案例深入剖析了 Pandas 的数据清洗、NumPy 的数组运算、结合两者进行数据分析和特征工程,以及 Pandas 的时间序列处理功能。这些高级技巧能够帮助我们更高效、准确地处理和分析数据,为决策提供支持。
287 2
|
存储 数据挖掘 数据处理
Python数据分析:Pandas库的高效数据处理技巧
【10月更文挑战第26天】Python 是数据分析领域的热门语言,Pandas 库以其高效的数据处理功能成为数据科学家的利器。本文介绍 Pandas 在数据读取、筛选、分组、转换和合并等方面的高效技巧,并通过示例代码展示其实际应用。
294 2

推荐镜像

更多