LeetCode 187. Repeated DNA Sequences

简介: 所有 DNA 由一系列缩写为 A,C,G 和 T 的核苷酸组成,例如:“ACGAATTCCG”。在研究 DNA 时,识别 DNA 中的重复序列有时会对研究非常有帮助。编写一个函数来查找 DNA 分子中所有出现超多一次的10个字母长的序列(子串)。

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Description



All DNA is composed of a series of nucleotides abbreviated as A, C, G, and T, for example: "ACGAATTCCG". When studying DNA, it is sometimes useful to identify repeated sequences within the DNA.


Write a function to find all the 10-letter-long sequences (substrings) that occur more than once in a DNA molecule.


Example:


Input: s = "AAAAACCCCCAAAAACCCCCCAAAAAGGGTTT"

Output: ["AAAAACCCCC", "CCCCCAAAAA"]


描述



所有 DNA 由一系列缩写为 A,C,G 和 T 的核苷酸组成,例如:“ACGAATTCCG”。在研究 DNA 时,识别 DNA 中的重复序列有时会对研究非常有帮助。


编写一个函数来查找 DNA 分子中所有出现超多一次的10个字母长的序列(子串)。


示例:

输入: s = "AAAAACCCCCAAAAACCCCCCAAAAAGGGTTT"

输出: ["AAAAACCCCC", "CCCCCAAAAA"]


思路



  • 题意是以10个字符构成每一个子串,寻找在字符串中出现了不止了一次的子字符串.
  • 我们使用两个哈希set,wordset用于存储已经找到的子字符串,res用于存储已经出现的结果.我们以10个字符串为窗口,如果当前子字符串已经出现过在wordset中,我们就把他添加到res中,如果没有就添加到wordset中,最后我们返回list类型的res.


# -*- coding: utf-8 -*-
# @Author:             何睿
# @Create Date:        2019-01-18 19:56:00
# @Last Modified by:   何睿
# @Last Modified time: 2019-01-18 20:10:34
class Solution:
    def findRepeatedDnaSequences(self, s):
        """
        :type s: str
        :rtype: List[str]
        """
        # wordset哈希set存储已经出现过的子字符串
        # res用于存储结果中的子字符串
        wordset, res, count = set(),set(), len(s)
        i = 0
        # 每一个窗口的长度为10
        while i + 10 <= count:
            # 如果当前字符串已经出现过,就把当前字符串添加到结果字符串中
            if s[i:i + 10] in wordset:
                res.add(s[i:i + 10])
            else:
                # 如果没有出现过,就添加到记录中
                wordset.add(s[i:i + 10])
            i += 1
        # 返回需要list类型
        return list(res)


源代码文件在这里.


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